Nella stagione 2006-2007 il Carpenedolo disputa il girone A del campionato di Serie C2, con 52 punti ottiene il sesto posto. Discreto il campionato dei rossoneri bresciani, che arrivano a tre lunghezze dai Play-off, raccolgono 24 punti nel girone di andata e 28 in quello discendente. Sono salite in Serie C1 il Legnano con promozione diretta, ed il Lecco che ha vinto i Play-off. Ottimo il torneo dell'attacco rossonero, che con 47 reti è risultato il migliore del girone A, ma sono troppe le 41 reti che ha subito, per nutrire velleità di promozione. La coppia Lorenzini e Zubin hanno realizzato 12 reti a testa in campionato. Il Carpenedolo ha partecipato alla Coppa Italia Nazionale, indicata a parteciparvi per merito sportivo, dalla Lega Professionisti di Serie C, ma è stato subito eliminato nel primo turno dal Siena, squadra che disputa il campionato di Serie A, che si è imposto (1-2) dopo i tempi supplementari. Poi a ottobre ha partecipato alla Coppa Italia di Serie C, entrando in scena nel primo turno eliminatorio, dove nel doppio confronto ha eliminato il Venezia, poi nel secondo turno è uscita dal torneo, superato nel doppio confronto dal Prato.
^Giornata interamente rinviata per i gravi incidenti accaduti a Catania nel dopo gara di Catania-Palermo del 2 febbraio 2007, e recuperata il 18 marzo 2007.
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