Seura ei ole koskaan voittanut Sveitsin-mestaruutta, mutta kaudella 2004–2005 se sijoittui maan superliigassa toiseksi, mikä oikeutti paikkaan Mestarien liigan karsintaan. Karsinnoissa se voitti Kiovan Dynamon ja Malmön, ja näin se oli Grasshopperin ja Baselin jälkeen historian kolmas sveitsiläisseura, joka pääsi kilpailun lohkovaiheeseen asti. Samaan lohkoon Thunin kanssa arvottiin Arsenal, AFC Ajax ja Sparta Praha. Thun sijoittui lohkossaan kolmanneksi, joten Mestarien liigan jatkopelit jäivät haaveeksi. Se pääsi kuitenkin jatkamaan euro-ottelujaan UEFA Cupissa. Cupin kolmannen kierroksen vastustaja HSV oli kuitenkin vahvempi yhteismaalein 2–1.