Bistua: Revista de la Facultad de Ciencias

Básicas
ISSN: 0120-4211
revistabistua@unipamplona.edu.co
Universidad de Pamplona
Colombia

Restrepo, Guillermo
Química matemática y la universidad de pamplona
Bistua: Revista de la Facultad de Ciencias Básicas, vol. 3, núm. 1, 2005, pp. 61-76
Universidad de Pamplona
Pamplona, Colombia

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ISSN 0120 - 4211 Bistua Vol. 3 No. 1

QUÍMICA MATEMÁTICA Y LA
MATEMÁTICA
UNIVERSIDAD DE P
UNIVERSIDAD AMPL ON
AMPLON
PAMPL ONAA

Guillermo Restrepo
Laboratorio de Química Teórica,
Grupo de Investigación en Química
Universidad de Pamplona, Pamplona, Colombia
grestrepo@unipamplona.edu.co

RESUMEN

Mostramos el significado de la química teórica, el origen de la química matemática

y su relación con los fundamentos de la química teórica. Posteriormente
realizamos una revisión de la matematización de la química y el carácter científico
de esta actividad desde el siglo XVIII hasta nuestros días. Finalmente mostramos
el aporte del Laboratorio de Química Teórica de la Universidad de Pamplona a la
consolidación de la química matemática mediante el desarrollo de una metodología
general de investigación denominada quimiotopología, con la cual es posible
realizar química teórica sin abandonar la información experimental química.

ABSTRACT

We show the meaning of the Theoretical Chemistry, the origin of the Mathematical
Chemistry and its relationship with the foundations of the Theoretical Chemistry.
Afterwards, we review the process of mathematisation of Chemistry and also the
scientific character of this activity since the 18th century to our days. Finally, we
show the contribution of the Laboratorio de Química Teórica at the Universidad de
Pamplona to the consolidation of the Mathematical Chemistry through the
development of a general methodology of researching called chemotopology. This
methodology allows developing Theoretical Chemistry without the abandoning of
the experimental information in chemistry.

PALABRAS CLAVE

Química teórica, Química matemática, Quimiotopología, Historia de la química,

Epistemología de la química.

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INTRODUCCIÓN representa al objeto sobre el cual se desea

hacer la medida (átomo o molécula) y E
La ecuación de Schrödinger y la Química representa el valor de la medida, en este caso
Teórica la energía. Resolver la ecuación de Schrödinger
La química matemática con alrededor de 30 implica determinar las mejores
años de existencia es una de las ramas más representaciones matemáticas del objeto, es
jóvenes de la química teórica [1]. Por esta decir las funciones de onda y determinar
última se entiende todo estudio o investigación las diferentes energías E del objeto. La
encaminada a la búsqueda de los descripción de los átomos y moléculas de una
fundamentos de la química y su relación con manera matemática no siempre es sencilla, en
otras ciencias. Sin embargo, en estos este proceso hay que tener en cuenta el
momentos cuando alguien habla de química número de átomos de la molécula, el número
teórica, o está hablando de química cuántica de electrones de los átomos y los diferentes
computacional o todos esperan que así lo sistemas de coordenadas necesarios para
haga. Este fenómeno social-científico es describirlos a cada uno de ellos. Por otra parte
interesante y peligroso. Esto implicaría que es imposible resolver en tiempo real de
únicamente mediante la computación de cómputo la ecuación (1) para sistemas
procesos cuánticos sería posible pensar polielectrónicos y es por ello que se requiere
sobre los fundamentos de la química, una solución numérica aproximada. Este
situación que es totalmente errónea ya que proceso reduccionista del "agua de la alberca
Lavoisiser, Mendeléiev y otros químicos no de la casa" a un problema de dos átomos de
cuánticos pensaron los fundamentos de la hidrógeno y un átomo de oxígeno (H2O) pierde
química sin la teoría cuántica como una gran cantidad de información del sistema
herramienta; de hecho sin contar con el original. Una labor de los químicos teóricos
electrón en sus hipótesis y planteamientos. interesados en la epistemología de la química
es la de calcular la cantidad efectiva de
Ya mencionamos el significado de la química información perdida en esta reducción. Lo cierto
teórica e introdujimos la frase "química es que perdemos información en la reducción
cuántica computacional", pero, ¿qué es la y esto se evidencia en la baja correlación de
química cuántica computacional? Esta rama las propiedades del agua que percibimos y la
de la química teórica comprende el uso de hipotética H2O [ 2 ]. De hecho una sola molécula
computadores para realizar cálculos de H2O sólo puede explicar el comportamiento
numéricos que de manera aproximada del vapor de agua. Para poder predecir
resuelven la ecuación de Schrödinger (1). medianamente el comportamiento del agua de
la alberca de nuestra casa necesitamos más
Hˆ Ψ = EΨ (1) de cinco moléculas de H 2O. El anterior
argumento nos permite decir que la búsqueda
Esta ecuación permite representar de los fundamentos de la química, la búsqueda
matemáticamente el proceso de medida de de las razones del cambio en la materia y su
la energía sobre un objeto microscópico comportamiento no es necesariamente la
(partículas subatómicas, átomos y reducción del problema a la solución de una
moléculas). Una descripción rápida de los ecuación matemática que no es capaz de
términos que aparecen en la ecuación (1) es predecir los comportamientos totales de la
materia. En síntesis, la química teórica no es la
la siguiente: Ĥ es el operador de energía
resolución de (1). Sin embargo, a pesar de sus
(Hamiltoniano) que representa al instrumento debilidades, la teoría cuántica hace parte del
de medida,HΨ es la función de onda que arsenal teórico de la química para tratar
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de entender la materia. Quizá es la fue especialmente notorio con el desarrollo

herramienta más desarrollada actualmente, del hardware entre los años 1950 y 1980.
¡pero no la única! De ser posible la reducción Esta capacidad de cálculo hizo posible
matemática propuesta por la teoría cuántica, resolver de manera aproximada la ecuación
las palabras de P. A. M. Dirac (1902-1984) de Schrödinger en tiempos relativamente
tendrían total vigencia por estos días: "The cortos y permitió extrapolar la mecánica
general theory of quantum mechanics is now cuántica a sistemas químicos más complejos
almost complete [1929]. The underlying que los ortodoxos átomo de hidrógeno y
physical laws necessary for the mathematical molécula de hidrógeno ionizada [ 5, 6 ]. Sin
theory of a large part of physics and the whole lugar a dudas, la capacidad de cálculo
of chemistry are thus completely known […] permitió entender de manera más rápida y
and the difficult is only that the exact más "física", los procesos químicos. Pero la
applications of these laws leads to equations facilidad de realizar cálculos inundó la
much to complicated to be soluble" [ 3 ]. Estas química de calculistas, de aproximacionistas
célebres palabras fueron un desacierto del y de fisicalistas ante todo. Esta tendencia
gran científico británico, quien embriagado por cuántico-computacional convirtió los
el fisicalismo [ 4 ] condenó a la química a ser congresos y simposios de química teórica en
una colonia de la física durante los años simposios y congresos de químicos
siguientes a 1930. Lo cierto es que la teoría calculistas donde la preocupación por los
cuántica ha aportado enormemente al fundamentos de la química y su interrelación
entendimiento de los procesos químicos, pero con otras ciencias pasó a ser un trabajo
no es una sustitución de la química misma. abstracto, abstruso y ambiguo. Lo importante
era realizar cálculos más precisos, mostrar
La fisicalización de la química no es un legado cuál hidrógeno era el que expulsaba una
de Dirac, el caso de este científico es uno de molécula para darle cabida a un átomo
los más recientes y mencionados en nuestra diferente. Este tipo de encuentros científicos
época, pero es necesario recordar a I. A. M. y de literatura científica estuvo acompañada
F. X. Comte (1798-1857), quien a principios de fascinantes ilustraciones y videos en
del siglo XIX estableció una jerarquía en las multimedia de reacciones químicas y
ciencias. Comte arguye que la más compleja mecanismos de reacción. Se hizo tan popular
y a su vez la más dependiente de las ciencias la visión mecanicista de los procesos
es la que aparece en la cima de la jerarquía. químicos que a los programas de televisión
Así la ciencia social es la más compleja de de divulgación científica nunca les faltó una
su método positivo y todas las otras son estructura tridimensional del ADN en
preparatorias para ella. De esta forma la movimiento. Lo curioso de este proceso
ciencia social disfruta de los recursos de las social-científico fue que surgió de la mecánica
anteriores ciencias. Según Comte la cuántica, teoría que tiene como uno de sus
astronomía (matemáticas en nuestra época) pilares el principio de incertidumbre, el cual
es el pilar de todas las otras ciencias; de la establece que dos variables físicas
misma manera el científico francés sustenta conjugadas nunca podrán ser determinadas
que la física se soporta en las matemáticas y ambas, al mismo tiempo, con total certeza
que la física es a su vez soporte de la química. [7]. Sin embargo, en las revistas
Es decir que para hacer química hay que especializadas y en los congresos se habla
saber física o esperar los resultados y de la energía de las moléculas y de sus
desarrollos de la física. geometrías con certezas típicas de la física
newtoniana determinista. En pocas palabras,
El problema de la fisicalización de la química la esencia cuántica se ha perdido y las

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revistas, congresos y programas de área de la filosofía de la química, una

divulgación científica se han convertido en especialidad de la química que va de la mano
espectáculos animados, en carnavales de de la labor teórica de esta ciencia y que había
multimedia donde no es descabellado pensar dado sus primeros pasos en publicaciones
en hologramas que muestren "cómo" ocurre como la Journal of Chemical Education. Los
una reacción química y "cómo" vibra una líderes actuales de esta corriente filosófica
molécula. Es importante resaltar que el son J. Schummer (Alemania) y E. Scerri
rumbo que ha tomado la investigación en (Estados Unidos). El primero de ellos fundó
química teórica no es culpa de Dirac, sino la revista HYLE en la Karlsruhe Universität
una mala interpretación de su magna obra. (Alemania) y actualmente sus artículos
Dirac habló irresponsablemente de la relación pueden descargarse gratuitamente de
física-química, pero eso no opaca su gran internet (http://www.hyle.org/). E. Scerri es el
trabajo en la mecánica cuántica. De hecho, editor de la revista Foundations of Chemistry
en su libro Principles of Quantum Mechanics que al igual que HYLE se dedica a la
[8], menciona la importancia de la publicación de artículos sobre filosofía e
representatividad en química y enfatiza que historia de la química. Pero, ¿qué fue lo que
lo realmente importante en la descripción matematizaron los científicos contrariados
científica es la representación matemática mencionados en el párrafo anterior?, es decir,
(objetiva), más que la representación ¿qué es la química matemática? En este
pictórica de los objetos y fenómenos. Sin artículo presentamos una breve descripción
embargo, esta parte del libro es pasada por de esta disciplina y cómo el Laboratorio de
alto por la mayoría de los químicos teóricos Química Teórica de la Universidad de
contemporáneos. Pamplona ha aportado a esta rama del
conocimineto.
El interés por las representaciones pictóricas
en la química teórica, notorio en las ¿QUÉ ES QUÍMICA
publicaciones en el área, en los congresos y
MATEMÁTICA?
simposios, hartó a un grupo de científicos que
aún conservaba la idea fundamental del
Algunos hechos históricos importantes para
químico teórico: ¿qué es la química, cuáles
aproximarnos al significado de la química
son sus fundamentos, cómo está relacionada
matemática son los ya mencionados de
con las otras ciencias y cómo esas otras
Comte y Dirac, sin embargo existen otros que
ciencias influyen en ella? Este grupo de
vale la pena mencionar en esta sección.
científicos, contrariado a finales de los años
1970, empezó a buscar nuevas formas de
En 1786 Immanuel Kant (1724-1804) realizó
teorizar la química sin recurrir a la física
una revisión sobre el estado de las ciencias
cuántica. Dentro de ellos se cuentan: A. T.
de su tiempo [ 9 ] y encontró que la química
Balaban (Rumania), N. Trinajstic (Croacia),
tenía un insuficiente grado de
M. Randic (Croacia), D. Bonchev (Bulgaria),
matematización. Para Kant la
P. G. Mezey (Hungría), R. B. King (Estados
matematización de una ciencia era tan
Unidos), D. H. Rouvray (Reino Unido), R.
importante que la ciencia adquiría el grado de
Hefferlin (Estados Unidos), D. Klein (Estados
ciencia en tanto fuera susceptible de ser
Unidos), entre otros. Esta búsqueda de una
matematizada; en sus propias palabras "[...]
nueva forma de teorizar en química llevó al
jeder besonderen Naturlehre nur so viel
nacimiento de la química matemática.
Wissenschaft angetroffen werden könne, als
Paralelamente a esta rama de la química
darin Mathematik anzutreffen ist" [9]. Tomando
surgió la divulgación científica concreta en el

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como base esta poca matematización, Kant science" [ 11 ]. Y agregó, "Mathematics may
arguyó que la química no podía llegar a ser enable us retrospectively to justify results
más que arte o enseñanzas experimentales obtained by experiment, may point out useful
y finalizó diciendo que la química nunca podría lines of research and even sometimes predict
llegar a ser una ciencia, "[...]-so kann Chemie entirely novel discoveries" [11] Finalmente
nichts mehr als Kunst oder escribió, "We do not know when the change
Experimentallehre, niemals aber eigentliche will take place, or wheter it will be gradual or
Wissenschaft werden" [9]. Esta era la sudden [...]" [11]. Si analizamos cada una de
situación de la química a finales del siglo XVIII las ideas de Brown mencionadas arriba,
y las palabras de Kant fueron influyentes para veremos la riqueza de sus proféticas
los pensadores del siglo XIX quienes palabras:
consideraron innecesaria la matematización
de la química por ser clasificada como un arte 1. "[...] la química se convertirá en una rama
o conocimiento empírico. Por suerte hoy de las matemáticas aplicadas, pero no dejará
sabemos que el arte también es susceptible de ser una ciencia experimental". Por
de matematización y que las matemáticas matemática aplicada entendemos el uso de
subyacen en toda actividad humana. Las los conceptos y teorías matemáticas en
palabras de Kant fueron, al igual que las de diferentes ramas del saber. Esta afirmación
Dirac dos siglos después, influyentes en el va en contradicción con el pensamiento
pensamiento científico y en la forma como comteano ya que establece que la química
se desarrolló la química. puede surgir de las matemáticas sin recurrir
a la física. Actualmente esta relación
Ya en el siglo XIX, Comte, escribió "cada matemáticas-química ha sido evidenciada y
intento de emplear métodos matemáticos en no sólo para el caso de la química; de hecho
el estudio de las cuestiones químicas debe la biología, la antropología y otras ciencias han
ser considerado profundamente irracional y encontrado en las matemáticas importantes
contrario al espíritu de la química" [10 ]. Comte herramientas para su desarrollo y en algunos
fue más directo que Kant y no se dedicó a casos, como en el de la biología [ 12 ] y la
formular sus ideas desde la matematización química [13], han generado nuevo
de la química de su época, como sí lo hizo conocimiento matemático en el proceso de
Kant, sino que fue más allá y lanzó juicios de aplicación. Brown insistió en que a pesar de
valor sobre una actividad científica ajena a su convertirse en una rama de las matemáticas,
experiencia y a su "espíritu" filosófico. Estas la química, no dejaría de ser una ciencia
palabras de Comte y la irresponsabilidad con experimental. Este legado se ha perdido en
que fueron dichas y escritas recuerdan la el imaginario colectivo de los químicos
irresponsabilidad de Dirac al considerar la teóricos contemporáneos quienes siguiendo
química "explicada" desde la física y argüir las palabras de Dirac consideran que la
que el problema de la química estaba totalidad de la química está contenida en una
solucionado por la mecánica cuántica. ecuación matemática, la ecuación de
Schrödinger (1). Como veremos más
Cincuenta y cuatro años después de las adelante, es posible realizar investigación en
palabras de Comte sobre la incompatibilidad química teórica recurriendo a la información
de las matemáticas y la química, A. C. Brown experimental sin necesidad de realizar
(1838-1922), uno de los pioneros de la reducciones aberrantes de la química a las
química estructural, escribió: "[...] chemistry matemáticas o a la física.
will become a branch of applied mathematics;
but it will not cease to be an experimental 2. "Las matemáticas pueden servir para

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justificar retrospectivamente resultados álgebra lineal, la teoría de matrices, la teoría

obtenidos mediante experimentos, pueden de grupos y la teoría de grafos han
señalarnos líneas versátiles de investigación encontrado subsiguientes aplicaciones en
y además, algunas veces, pueden predecir problemas y descripciones propias de la
totalmente nuevos descubrimientos". En la química. Teniendo en cuenta el desarrollo de
época en que Brown escribió estas palabras, ciertas ramas de la química, es posible decir
las matemáticas empezaron a usarse para que la aplicación de las matemáticas a la
describir el comportamiento termodinámico química ha ocurrido de manera gradual, sin
y cinético de sistemas químicos, embargo es una pregunta abierta el hecho
especialmente el cálculo diferencial de si realmente ha sido de manera gradual o
desarrollado dos siglos antes por G. W. intempestivamente que las matemáticas han
Leibniz (1646-1716) e I. Newton (1643-1727). incursionado en la química. Esta pregunta
Pero quizá, el uso más importante de las merece ser estudiada a la luz de los
matemáticas como herramienta predictiva paradigmas científicos y la estructura de las
fue el que D. I. Mendeléiev les dio cuando revoluciones científicas de T. S. Kuhn (1922-
encontró, gracias a una visión conjuntista de 1996) [15 ] o a través de la ideología de L.
los elementos químicos, la Ley Periódica. Fleck (1896-1961) [16]. Tal vez algún filósofo
Este hecho, entendido en nuestro tiempo de la química o historiador de la ciencia algún
como un hecho fortuito y como producto de día se dedique a realizar esta importante
la gran inteligencia de Mendeléiev, permitió investigación.
que el científico ruso predijera la existencia
de tres nuevos elementos y además los Con el advenimiento de la teoría cuántica los
caracterizara teóricamente. Mendeléiev no químicos teóricos necesitaron adentrarse en
sólo dijo cuál sería el peso atómico de los el mundo de las matemáticas para entender la
nuevos elementos, sino sus propiedades física implícita en la teoría, de esta forma
físico-químicas (densidad, volumen molar, adquirieron conocimientos de álgebra lineal,
temperatura de fusión, calor específico), sus teoría de matrices, teoría de grupos y cálculo
propiedades químicas (reactividades, diferencial e integral. Pero esto no sólo les
fórmulas empíricas) y hasta en qué minerales permitió entender y aplicar la teoría cuántica a
sería probable encontrarlos [ 14 ]. Algunos la química sino que les permitió encontrar otras
estudios desarrollados por nuestro grupo de aplicaciones de estas ramas de las
investigación de la Universidad de Pamplona matemáticas a problemas químicos diferentes
muestran que los elementos químicos, más a los químico-cuánticos. Una evidencia de ello
que una estructura cuántica ortodoxa, es que la teoría de grupos se convirtió en una
presentan una estructura matemática herramienta indispensable para los químicos
subyacente, la cual se fundamenta en las cristalógrafos y estructurales. Un aporte
propiedades de los elementos más que en importante de la teoría cuántica a la química
los electrones. fue la necesidad de que los químicos se
apropiaran de la matemática continua (cálculo
3. "No sabemos cuándo tendrá lugar [la diferencial e integral). Esto permitió un mayor
aplicación de las matemáticas a la química], grado de matematización de la química del que
o si será gradual o de repente[...]". Las había encontrado Kant en 1786, pero sesgó la
primeras aplicaciones de las matemáticas a aplicación de las matemáticas a la química a
la química ocurrieron en la físico-química y las matemáticas continuas. Esta
fue específicamente el cálculo el que preponderancia de la matemáticas continua en
encontró una aplicación directa. Sin embargo, la química se evidencia en los contenidos de
otras ramas de las matemáticas como el los cursos de matemáticas para químicos de

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las diferentes universidades que incluyen general, sin embargo, debido al rumbo que
matemáticas continuas y muy poco de ha tomado la investigación en topología, hoy
matemáticas discretas (autómatas celulares, en día la teoría de grafos es considerada
teoría de codificación, combinatoria, como una disciplina matemática aparte de
sistemas computacionales, grupos finitos, la topología. Pero es importante resaltar que
teoría de grafos, teoría de la información, tienen el mismo origen.
retículos, etc.).
Topología: Esta rama de las matemáticas es
Según lo anterior, es posible suponer que las actualmente empleada en la caracterización
matemáticas discretas incursionaron en la de superficies de energía potencial
química luego de la aparición de la teoría moleculares, en discusiones sobre quiralidad
cuántica. A pesar de ser esta una idea y en la descripción de sistemas
extendida en los círculos académicos, la concatenados y de especies químicas
incursión de la matemática discreta en la anudadas.
química se dio desde el siglo XIX con los
trabajos de Cayley sobre la enumeración de Teoría de la información: Es utilizada en la
los alcanos [ 17 ]. Infortunadamente estas descripción de procesos termodinámicos y
investigaciones no han sido igual de aquellos relacionados con la química del
reconocidas como las realizadas haciendo origen de la vida. Actualmente nuestro grupo
uso de las matemáticas continuas. de investigación está aplicando esta teoría
Actualmente es posible decir que, para determinar la información contenida en
independientemente de la fecha de aparición los sistemas de clasificación químicos [19 ].
en la química, las matemáticas continuas y
las matemáticas discretas han encontrado Otra de las aplicaciones de las matemáticas
un importante uso en la descripción y a la química se da en el diseño racional de
predicción de situaciones químicas. Algunas experimentos y en el análisis e interpretación
de las aplicaciones de las matemáticas de los datos obtenidos en la experimentación
discretas a la química son las siguientes: química. En estos momentos existen dos
especialidades de la química que contemplan
Teoría de grafos: Esta teoría matemática estos objetivos, la quimiometría y la
fundada por L. Euler (1707-1783) en 1736 quimioinformática. Estas especialidades
actualmente se aplica a la clasificación, surgieron a finales del siglo XX y han logrado
sistematización, enumeración y diseño de tal desarrollo que actualmente existen dos
sistemas de interés químico. Mediante ella revistas especializadas en el tema:
es posible demostrar que la descripción Chemometrics and Intelligent Laboratory
gráfica bidimensional de las moléculas Systems y Journal of Chemometrics. En
(¡como son representadas por un profesor investigaciones recientes nuestro grupo ha
en un tablero!) pertenece a la teoría de grafos demostrado la versatilidad de una
y permite estudiar las propiedades de las metodología matemática que combina
moléculas teniendo en cuenta las algunas técnicas quimiométricas con la teoría
propiedades matemáticas de los grafos que de conjuntos y la topología general, esta
las representan. Generalmente la teoría de metodología ha recibido el nombre de
grafos en química es empleada para describir quimiotopología y será discutida más
las relaciones de conectividad entre los adelante en este texto.
átomos que constituyen una molécula [ 18 ].
El estudio de estas relaciones de vecindad o Luego de mencionar algunos hechos
conectividad hace parte de la topología históricos sobre la matematización de la

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química y de señalar las aplicaciones no introductoriamente al lector. De hecho existen

convencionales de las matemáticas a la libros y revistas especializadas para muchas
química, es posible decir que el término de las herramientas matemáticas empleadas
química matemática, acuñado a principios de actualmente en la química. El objetivo de esta
los 1980 se entiende como toda aplicación sección es el de introducir al lector en una
nueva y no trivial de la matemática a la herramienta quimiomatemática
química. recientemente desarrollada que lleva por
nombre quimiotopología. El nombre de esta
Actualmente existen dos revistas metodología fue acuñado durante la visita del
especializadas en química matemática: profesor R. Hefferlin a la Universidad de
Journal of Mathematical Chemistry y MATCH. Pamplona en julio de 2004 con motivo del
Sin embargo, otras revistas científicas de alto curso de química matemática: periodicidad,
impacto dedican gran parte de sus páginas a que dicho profesor estadounidense impartió
las publicaciones quimiomatemáticas, en el claustro universitario pamplonés. Este
algunas de ellas son: Journal of Chemical nombre, quimiotopología, surgió de la
Information and Computer Sciences (desde pregunta del Dr. Hefferlin sobre el tipo de
enero de 2005 llamada Journal of Chemical herramienta matemática que los miembros
Information and Modeling) y la Croatica del grupo de investigación del Laboratorio de
Chemica Acta (artículos gratuitos en http:// Química Teórica de la Universidad de
public.carnet.hr/ccacaa/). Pamplona estábamos aplicando para realizar
las clasificaciones de los elementos químicos
Los esfuerzos por matematizar la química no publicadas en algunas revistas
se quedan sencillamente en la internacionales [ 21-22 ]. Teniendo en cuenta
fundamentación teórica de esta ciencia sino que la metodología quimiomatemática
que han encontrado aplicación práctica en el desarrollada por nuestro grupo de
diseño de nuevos fármacos y materiales. Una investigación se fundamenta en la
muestra de ello es el desarrollo de quimiometría y en la subsecuente aplicación
metodologías como el QSAR (Quantitative de la topología general, la respuesta fue la
Structure-Activity Relationships) y el QSPR fusión de quimiometría y topología,
(Quantitative Structure-Property "quimiotopología". Actualmente esta
Relationships) basados en la teoría de grafos, herramienta originada de las investigaciones
la topología y la teoría de la información [ 20 ]. químicas, está siendo aplicada a estudios
Estos avances y los que se están biológicos, fitotaxonómicos, ecotoxicológicos,
desarrollando en los laboratorios de química de ciencias de la información y de ciencia y
teórica del mundo y en los centros de tecnología de alimentos, entre otros.
investigación de los matemáticos interesados
por la química son una muestra de que "el Quimiometría (Análisis de Agrupamientos)
uso de métodos matemáticos en la química La técnica quimiométrica empleada en la
es profundamente racional". quimiotopología es el análisis de
agrupamientos, CA (Cluster Analysis). Esta
QUIMIOTOPOLOGÍA EN LA herramienta hace parte de las metodologías
no supervisadas de reconocimiento de
UNIVERSIDAD DE PAMPLONA
patrones y fundamentalmente busca
determinar clases o grupos en un conjunto
Cada una de las herramientas matemáticas
de interés. Pero, ¿cuál es el criterio para
mencionadas en los párrafos anteriores
generar tales grupos? Las relaciones de
merece un artículo en especial para ilustrar
semejanza entre los elementos del conjunto

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en cuestión. De esta forma los clases mostradas en el dendrograma. El

agrupamientos formados generan clases de primer paso incluye la selección de una
equivalencia donde la relación de equivalencia medida de semejanza, normalmente una
es una relación de semejanza [ 23 ]. Y, ¿por métrica que es aplicada para calcular las
qué es necesario utilizar precisamente el CA relaciones de semejanza entre los objetos.
en los estudios de conjuntos químicos? La El segundo paso del CA es la selección de
razón se encuentra en los fundamentos una metodología de agrupamiento que en
metodológicos de la química y en general de términos matemáticos implica la selección
todas las ciencias maduras. Toda ciencia de un forma de calcular la distancia entre un
madura [ 24 ] produce sistemas de punto y un conjunto. El producto final de estos
clasificación con el objetivo de sistematizar dos pasos es una clasificación jerárquica del
el conocimiento, de ordenarlo y de conjunto, denominada dendrograma. Este
economizar tiempo de análisis de la dendrograma muestra los agrupamientos
información propia de la ciencia. Por ejemplo, obtenidos a través de los pasos
en química la información experimental y el anteriormente mencionados. Generalmente
comportamiento químico de las sustancias los estudios que emplean CA sólo usan una
nos ha llevado a formular diversas clases de función de semejanza y una metodología de
compuestos químicos: alcanos, alquenos, agrupamiento para finalmente obtener un
alquinos, venenos, medicamentos, cetonas, sólo dendrograma (Figura 1a), pero es
aldehidos, ácidos, bases, etc. De igual arbitrario seleccionar una función de
manera tenemos clases de elementos semejanza en particular y una metodología
químicos: metales, no metales, semimetales, de agrupamiento. Para evitar este problema
alcalinos, alcalinotérreos, calcógenos, recientemente mostramos [21] que es
pnicógenos, halógenos, gases nobles, etc. recomendable calcular árboles consenso
Pero no sólo hemos clasificado las que busquen las características en común
sustancias químicas, en general hemos para diferentes árboles obtenidos por
clasificado los objetos químicos, es decir las diferentes metodologías (función de
sustancias y las reacciones químicas. semejanza y metodología de agrupamiento).
Tenemos reacciones de eliminación, de Un árbol consenso hipotético aparece en la
sustitución, de adición, de neutralización. En figura 1b. En general podemos tener dos
el mundo microscópico de los átomos y las diferentes representaciones de las relaciones
moléculas hemos llegado a clasificar los de semejanza entre los elementos de un
enlaces químicos: sencillos, dobles, triples, conjunto, dendrogramas y árboles consenso
coordinados, etc. Hacer un recuento de los (Figura 1). Estas dos representaciones
diversos sistemas de clasificación con que comparten una característica matemática,
cuenta la química y cada uno de los ambos son árboles (grafos conexos y
subsistemas de clasificación propios de cada acíclicos).
especialidad sería un trabajo harto extenso.
Topología del dendrograma
El CA busca las clases de los objetos con A continuación mostramos el fundamento
mayor grado de semejanza y muestra estas matemático de la quimiotopología.
clases en un objeto matemático denominado
árbol o dendrograma. La construcción del Definición 1. Un árbol es un grafo que
dendrograma se realiza en dos pasos, el muestra los agrupamientos de un conjunto
primero incluye una medida de semejanza de objetos y que posee las siguientes clases
entre los objetos y el segundo una de vértices:
metodología de agrupamiento para formar las

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1. vertices de grado 1, correspondientes a Definición 3. Sea un n-subárbol un subárbol

los objetos; de cardinalidad menor o igual a n.

2. vertices de grado mayor o igual que 3, Definición 4. Un n-subárbol maximal es un

llamados nodos; n-subárbol tal que no hay otro n-subárbol que
lo contenga.
3. sólo un vértice de grado 2, llamado nodo
raíz. La topologización de Q la logramos por medio
del siguiente teorema cuya demostración
En la figura 1 mostramos los diferentes aparece en la referencia [ 25 ].
vértices de un dendrograma y un árbol
consenso. Es importante mencionar que el Teorema 1. Sea Q un conjunto de objetos y
grado de un vértice en un grafo es el número Bn={ B está formado por los
de líneas o aristas que convergen en el vértice.
elementos de algún n-subárbol maximal}.
Entonces Bn es una base topológica en Q.

Así para cada n podrán aparecer diferentes

topologías. Cuando n=1 tendremos una base
que es la colección de todos los objetos de
Q (A3). Esto significa que la vecindad de cada
objeto es el mismo objeto en sí mismo y
ningún otro. Por otra parte si n=|Q|, donde |Q|
es la cardinalidad o número de elementos de
Q, entonces la base es una colección de un
sólo conjunto, el conjunto Q total (A4). Por
esta razón seleccionamos 1<n<|Q| y como
mostramos para el conjunto de los elementos
Figura 1. a) Un dendrograma, b) Un árbol
químicos [ , , , ], una selección de n=5 produce
consenso y sus vértices.
una base que genera una topología que a su
vez reproduce algunas de las ideas intuitivas
El objetivo de la quimiotopología es el de dotar
acerca de los elementos químicos, tales como
al conjunto Q de objetos con una topología. A
la clasificación de los metales, los no metales
continuación mostramos algunas
y los semimetales.
definiciones indispensables para la
topologización de Q (algunos conceptos
La metodología quimiotopológica desarrollada
básicos de topología aparecen en el apéndice
para dotar a un conjunto con una topología
A1-A2):
se basa en la selección de "ramas" del árbol
para construir la base topológica. Además,
Definición 2. Un subgrafo G de un árbol D
cada selección de n determina el tamaño de
es denominado subárbol si:
las ramas, es decir, el tamaño de las
vecindades de los objetos del conjunto. En la
1. G no contiene el nodo raíz;
figura 2, mostramos una representación
gráfica de esta metodología.
2. Hay un vértice p en D de grado mayor que
1 tal que G corresponde a uno de los
subgrafos conectados obtenidos al sustraer
p de D.

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mostramos que algunas ideas intuitivas de

la química pueden ser explicadas de acuerdo
con nuestra metodología quimiotopológica.
Mostramos, por ejemplo, que la frontera
matemática de los metales y no metales es
el conjunto de los semimetales
[21,22,26,27,29]. Este resultado indica que el
concepto ancestral de semimetal como un
elemento cuyas propiedades no son ni las de
los metales ni las de los no metales tiene un
sustento matemático considerando las
propiedades experimentales de los elementos
químicos. Por otra parte mostramos [22,28]
que a partir de los resultados de Semejanza
Cuántica Molecular [ 30 ], la clasificación
intuitiva de los esteroides de acuerdo al
conocimiento químico de estructura y
reactividad produce conjuntos disjuntos, lo
cual indica que la clasificación es correcta.
Aplicamos la misma metodología a los amino
ácidos [31] y benzimidazoles [32] y
encontramos [22,28] que algunas especies
químicas pertenecen a más de un grupo a la
vez, algo similar a lo que ocurre con los
semimetales en el conjunto de los elementos
químicos [21,22,26,27,29]. Estos resultados
indican que hay algunas sustancias que
comparten sus propiedades con otras
sustancias normalmente consideradas como
diferentes. Debido a que estos resultados
surgen de la topología y las propiedades
topológicas de los conjuntos Q de interés,
consideramos necesario explicar
químicamente el significado de las
propiedades topológicas. Supongamos el
siguiente ejemplo:
Figura 2. Representación de la influencia de
n en el tamaño de las ramas. Ejemplo 1.
Sea Q ={a,b,c,d,e,f,g,h,i,j,k,l,m,n,o,p,q,r,s,t,u,
Una vez hemos dotado al conjunto Q con una v,w,x,y,z} y supongamos que tenemos el
topología podemos estudiar algunas siguiente dendrograma para este conjunto Q
propiedades topológicas del conjunto Q. (Figura 3). Ahora, si tomamos n = 4, entonces
buscamos 4- subárboles maximales en el
Sobre el significado químico de las dendrograma. Así, tenemos la siguiente base
propiedades topológicas topológica:
En una reciente investigación [22,28]

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Bistua Vol. 3 No. 1 ISSN 0120 - 4211

B4={{a,b,d},{f,m},{c,g,l},{e,n,p},{t,i},{u,h,o},{v,w},
{x,y,q,z},{s,j,k},{r}}. Supongamos que estamos
interesados en determinado subconjunto de
Q llamado A, el cual es: A={a,b,c,d,e,f,g}.

Entonces podemos empezar a calcular las

propiedades topológicas de A.

Figura 4. A) Diagrama de Venn del

subconjunto A y de b) su clausura.

Conjunto derivado de un subconjunto.

Este conjunto es aquel que contiene todos
los elementos tal que al retirar el elemento
de su vecindad, la vecindad sigue relacionada
con A, es decir, la vecindad sin el elemento
continúa intersecando al conjunto A. En otras
palabras, el conjunto derivado del
subconjunto A contiene los elementos de Q
que se relacionan con A no por ellos mismos
sino por sus vecinos (Figura 5). Lo anterior,
en notación matemática, es:
A'={a,b,c,d,g,l,m,n,p}.

Figura 3. Dendrograma del ejemplo 1.

Clausura de un subconjunto.
Para calcular la clausura de A (Figura 4a)
necesitamos conocer los elementos de Q que
comparten sus vecindades con los elementos
de A. Estos elementos son llamados puntos
de clausura. Como tenemos las vecindades
en la base topológica B4, entonces buscamos
en B 4 todos los elementos de Q que
comparten sus vecindades con los elementos Figura 5. Conjunto derivado de A.
de A. Debido a que el procedimiento
quimiotopológico define los elementos de Q Frontera de un subconjunto.
de acuerdo con las propiedades de cada En este conjunto tenemos los elementos de
elemento, entonces el significado de la Q cuyas vecindades tienen elementos tanto
clausura es: el conjunto de todos los en A como en el complemento de A. En la
elementos de Q que tienen propiedades frontera de A se encuentran los elementos
semejantes a las de los elementos de A cuyas propiedades son semejantes a las
(Figura 4b). Esto en notación matemática es: propiedades de los elementos de A y a las
propiedades del resto de los elementos que
no pertenecen a A (Figura 6). Esto es lo que

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ISSN 0120 - 4211 Bistua Vol. 3 No. 1

ocurre con las propiedades de los Exterior de un subconjunto.

semimetales, las cuales están entre las En este conjunto tenemos todos los
propiedades de los metales y las de los no elementos de Q cuyas vecindades no
metales. Lo anterior, en términos contienen elementos de A. Esto quiere decir,
matemáticos puede escribirse como: b(A) = el conjunto de todos los elementos de Q que
{c,e,f,g,n,p,m,l}. no tienen ninguna relación de semejanza con
los elementos de A (Figura 8). En términos
matemáticos esto puede escribirse como:
Ext(A)={h,i,j,k,o,q,r,s,t,u,v,w,x,y,z}.

Figura 6. Frontera de A.

Interior de un subconjunto.
En este conjunto se encuentran todos los
elementos de Q cuyas vecindades contienen Figura 8. Exterior de A.
sólo elementos de A. En otros términos, el
interior de A contiene los elementos de Q que CONCLUSIONES
según sus propiedades únicamente se
parecen a los elementos de A y no a ningún Realizamos un recorrido histórico y filosófico
otro elemento (Figura 7). Si tenemos un del sentido de la matematización de la
elemento cuya vecindad contiene elementos química, resaltando a lo largo de la discusión
de A y además elementos de Ac, entonces las posiciones de Kant, Comte, Brown y Dirac.
este elemento no es un punto interior y no El primero de ellos, teniendo en cuenta el
pertenece al interior de A. Lo anterior puede grado de matematización de las actividades,
escribirse en términos matemáticos como: dotó de carácter científico a las actividades
Int(A) = {a,b,d}. mismas. Así, afirmó que la química del siglo
XVIII no era una ciencia dado el escaso
carácter matemático de dicha actividad
humana. Posteriormente Comte arguyó que
la química nunca podría llegar a ser una
ciencia natural dada la imposibilidad o
irracionalidad de los métodos matemáticos
aplicados a sus conocimientos. A
continuación mostramos cómo las
matemáticas fueron encontrando aplicación
en la química y mencionamos algunos
pensamientos vanguardistas de Brown sobre
la matematización de la química. De esta
Figura 7. Interior de A.

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forma llegamos a los años 20 del siglo XX en texto, que la química de principios del siglo
los cuales el desarrollo de la teoría cuántica XXI ha logrado un alto grado de
fisicalizó el carácter teórico de la química y matematización y según el criterio de Kant
según Dirac convirtió a la química en un caso es una ciencia natural. Actualmente, gracias
particular de la física. Realizamos una al trabajo de grandes pensadores estamos
discusión en la que mostramos que la logrando mover el velo de lo fortuito para
cuantización de la química se ha convertido encontrar la ancestral belleza matemática
en nuestros días en un esnob más que en esperándonos en el hogar de la química.
una actividad científica y que la mayoría de
los estudios cuánticos en la química se han Apéndice
alejado de los fundamentos de la química
A1. Sea Q un conjunto no vacío y una
teórica que buscan las raíces de esta ciencia,
sus pilares y su relación con otras ciencias. colección de subconjuntos de Q tal que :
Mostramos que un grupo de científicos a 1)
finales de los años 1970, como producto de 2) ∅ ∈ τ
la fisicalización de la química, fundó una
n
nueva forma de hacer química teórica y 3) Si , entonces I O ∈τ
j =1 j
posteriormente química aplicada con bases
teóricas. Esta nueva corriente ideológica y 4) Si α ∈ I , , entonces Uα Oα ∈ τ
∈I
matemática en la química teórica se
denominó química matemática y abarca toda Así τ es una topología, la pareja (X, ) es
aplicación no trivial de las matemáticas a la llamada un espacio topológico y los
química. Posteriormente mostramos algunas elementos de son llamados conjuntos
de las aplicaciones diferentes a la abiertos.
matemática continua que han tenido las
matemáticas en la química. A2. Sea B una colección de subconjuntos de
un conjunto no vacío Q, tal que:
En la segunda parte de este artículo
describimos el procedimiento matemático del 1)
Laboratorio de Química Teórica de la 2) Si B1 , B2 ∈ B , entonces B1 ∩ B2 es la
Universidad de Pamplona, el cual se ha
denominado "quimiotopología" por su relación unión de elementos de B, entonces B es
con la quimiometría y la topología. Mostramos llamada una base para la topología ,
cómo esta metodología plantea la posibilidad donde .
de hacer química teórica soportada en la
química experimental, es decir que brinda la
posibilidad de realizar química teórica sin A3. Para n = 1 tenemos B1 = {{E} | E ∈ Q}, y
llegar a reducciones físicas de los fenómenos
. es conocida como la topología
como lo proponía Dirac en 1929. Finalmente
mostramos el procedimiento discreta, donde E es un objeto y Q es el
quimiotopológico y el significado de las conjunto de objetos.
propiedades topológicas que pueden
calcularse a través de él. A4. Para n=|Q| tenemos y

Es posible afirmar, según lo dicho en este τ |Q | = {Q, ∅} . τ |Q| es llamada la topología

indiscreta o grosera, donde Q es un conjunto
de objetos.
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