ILF2

ILF2 (англ. Interleukin enhancer binding factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 390 амінокислот, а молекулярна маса — 43 062.

ILF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4AT7, 4AT8, 4AT9, 4ATB
Ідентифікатори
Символи	ILF2, NF45, PRO3063, interleukin enhancer binding factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603181 MGI: 1915031 HomoloGene: 26894 GeneCards: ILF2
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • DNA binding • double-stranded RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ATP binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • ядерце • мембрана • клітинне ядро • specific granule lumen • tertiary granule lumen • ficolin-1-rich granule lumen • extracellular region • Рибонуклеопротеїни Біологічний процес • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • transcription, DNA-templated • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3608	67781
Ensembl	н/д	ENSMUSG00000001016
UniProt	Q12905	Q9CXY6
RefSeq (мРНК)	NM_004515 NM_001267809	NM_026374
RefSeq (білок)	NP_001254738 NP_004506	NP_080650
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 3: 90.38 – 90.4 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRGDRGRGRG		GRFGSRGGPG		GGFRPFVPHI		PFDFYLCEMA		FPRVKPAPDE
TSFSEALLKR		NQDLAPNSAE		QASILSLVTK		INNVIDNLIV		APGTFEVQIE
EVRQVGSYKK		GTMTTGHNVA		DLVVILKILP		TLEAVAALGN		KVVESLRAQD
PSEVLTMLTN		ETGFEISSSD		ATVKILITTV		PPNLRKLDPE		LHLDIKVLQS
ALAAIRHARW		FEENASQSTV		KVLIRLLKDL		RIRFPGFEPL		TPWILDLLGH
YAVMNNPTRQ		PLALNVAYRR		CLQILAAGLF		LPGSVGITDP		CESGNFRVHT
VMTLEQQDMV		CYTAQTLVRI		LSHGGFRKIL		GQEGDASYLA		SEISTWDGVI
VTPSEKAYEK		PPEKKEGEEE		EENTEEPPQG		EEEESMETQE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ting N.S.Y., Kao P.N., Chan D.W., Lintott L.G., Lees-Miller S.P. (1998). DNA-dependent protein kinase interacts with antigen receptor response element binding proteins NF90 and NF45. J. Biol. Chem. 273: 2136—2145. PMID 9442054 DOI:10.1074/jbc.273.4.2136
• Reichman T.W., Muniz L.C., Mathews M.B. (2002). The RNA binding protein nuclear factor 90 functions as both a positive and negative regulator of gene expression in mammalian cells. Mol. Cell. Biol. 22: 343—356. PMID 11739746 DOI:10.1128/MCB.22.1.343-356.2002
• Harashima A., Guettouche T., Barber G.N. (2010). Phosphorylation of the NFAR proteins by the dsRNA-dependent protein kinase PKR constitutes a novel mechanism of translational regulation and cellular defense. Genes Dev. 24: 2640—2653. PMID 21123651 DOI:10.1101/gad.1965010

Див. також

• Хромосома 1