CD44

CD44 (англ. CD44 molecule (Indian blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 742 амінокислот, а молекулярна маса — 81 538.

CD44
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1POZ, 1UUH, 2I83, 4PZ3, 4PZ4
Ідентифікатори
Символи	CD44, CDW44, CSPG8, ECMR-III, HCELL, HUTCH-I, IN, LHR, MC56, MDU2, MDU3, MIC4, Pgp1, CD44 molecule (Indian blood group)
Зовнішні ІД	OMIM: 107269 MGI: 88338 HomoloGene: 508 GeneCards: CD44
Онтологія гена Молекулярна функція • collagen binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hyaluronic acid binding • GO:0016518 cytokine receptor activity • transmembrane signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • комплекс Ґольджі • macrophage migration inhibitory factor receptor complex • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • екзосома • гіалоплазма • secretory granule membrane • apical plasma membrane • lamellipodium membrane • cell projection • Мікроворсинки • basolateral plasma membrane Біологічний процес • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • monocyte aggregation • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion • hyaluronan catabolic process • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator • interferon-gamma-mediated signaling pathway • extracellular matrix disassembly • extracellular matrix organization • negative regulation of apoptotic process • cellular response to fibroblast growth factor stimulus • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • cartilage development • адгезія клітин • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation • cell-matrix adhesion • positive regulation of monocyte aggregation • leukocyte migration • neutrophil degranulation • wound healing, spreading of cells • regulation of lamellipodium morphogenesis • cell-cell adhesion • inflammatory response • cell migration • T cell activation • positive regulation of kinase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	960	12505
Ensembl	ENSG00000026508	ENSMUSG00000005087
UniProt	P16070	P15379
RefSeq (мРНК)	NM_000610 NM_001001389 NM_001001390 NM_001001391 NM_001001392 NM_001202555 NM_001202556 NM_001202557	NM_001039150 NM_001039151 NM_001177785 NM_001177786 NM_001177787 NM_009851
RefSeq (білок)	NP_000601 NP_001001389 NP_001001390 NP_001001391 NP_001001392 NP_001189484 NP_001189485 NP_001189486	NP_001034239 NP_001034240 NP_001171256 NP_001171257 NP_001171258 NP_033981
Локус (UCSC)	Хр. 11: 35.14 – 35.23 Mb	Хр. 2: 102.64 – 102.73 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDKFWWHAAW		GLCLVPLSLA		QIDLNITCRF		AGVFHVEKNG		RYSISRTEAA
DLCKAFNSTL		PTMAQMEKAL		SIGFETCRYG		FIEGHVVIPR		IHPNSICAAN
NTGVYILTSN		TSQYDTYCFN		ASAPPEEDCT		SVTDLPNAFD		GPITITIVNR
DGTRYVQKGE		YRTNPEDIYP		SNPTDDDVSS		GSSSERSSTS		GGYIFYTFST
VHPIPDEDSP		WITDSTDRIP		ATTLMSTSAT		ATETATKRQE		TWDWFSWLFL
PSESKNHLHT		TTQMAGTSSN		TISAGWEPNE		ENEDERDRHL		SFSGSGIDDD
EDFISSTIST		TPRAFDHTKQ		NQDWTQWNPS		HSNPEVLLQT		TTRMTDVDRN
GTTAYEGNWN		PEAHPPLIHH		EHHEEEETPH		STSTIQATPS		STTEETATQK
EQWFGNRWHE		GYRQTPKEDS		HSTTGTAAAS		AHTSHPMQGR		TTPSPEDSSW
TDFFNPISHP		MGRGHQAGRR		MDMDSSHSIT		LQPTANPNTG		LVEDLDRTGP
LSMTTQQSNS		QSFSTSHEGL		EEDKDHPTTS		TLTSSNRNDV		TGGRRDPNHS
EGSTTLLEGY		TSHYPHTKES		RTFIPVTSAK		TGSFGVTAVT		VGDSNSNVNR
SLSGDQDTFH		PSGGSHTTHG		SESDGHSHGS		QEGGANTTSG		PIRTPQIPEW
LIILASLLAL		ALILAVCIAV		NSRRRCGQKK		KLVINSGNGA		VEDRKPSGLN
GEASKSQEMV		HLVNKESSET		PDQFMTADET		RNLQNVDMKI		GV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Stamenkovic I., Amiot M., Pesando J.M., Seed B. (1989). A lymphocyte molecule implicated in lymph node homing is a member of the cartilage link protein family. Cell. 56: 1057—1062. PMID 2466575 DOI:10.1016/0092-8674(89)90638-7
• Harn H.-J., Isola N., Cooper D.L. (1991). The multispecific cell adhesion molecule CD44 is represented in reticulocyte cDNA. Biochem. Biophys. Res. Commun. 178: 1127—1134. PMID 1840487 DOI:10.1016/0006-291X(91)91009-2
• Dougherty G.J., Lansdorp P.M., Cooper D.L., Humphries R.K. (1991). Molecular cloning of CD44R1 and CD44R2, two novel isoforms of the human CD44 lymphocyte 'homing' receptor expressed by hemopoietic cells. J. Exp. Med. 174: 1—5. PMID 2056274 DOI:10.1084/jem.174.1.1
• Kugelman L.C., Ganguly S., Haggerty J.G., Weissman S.M., Milstone L.M. (1992). The core protein of epican, a heparan sulfate proteoglycan on keratinocytes, is an alternative form of CD44. J. Invest. Dermatol. 99: 886—891. PMID 1281868 DOI:10.1111/1523-1747.ep12614896
• Tanabe K.K., Nishi T., Saya H. (1993). Novel variants of CD44 arising from alternative splicing: changes in the CD44 alternative splicing pattern of MCF-7 breast carcinoma cells treated with hyaluronidase. Mol. Carcinog. 7: 212—220. PMID 8352881 DOI:10.1002/mc.2940070403
• Chiu R.K., Carpenito C., Dougherty S.T., Hayes G.M., Dougherty G.J. (1999). Identification and characterization of CD44RC, a novel alternatively spliced soluble CD44 isoform that can potentiate the hyaluronan binding activity of cell surface CD44. Neoplasia. 1: 446—452. PMID 10933060 DOI:10.1038/sj.neo.7900045

Див. також

• Хромосома 11