ChEBI
Hemijski entitet sa biološkim značajem (ChEBI)[1][2] je baza podataka i ontologija molekulskih entiteta za fokusom na 'mala' hemijska jedinjenja.[3] Ta jedinjenja su bilo prirodni ili sintetički proizvodi koji se koriste za pravljenje promena u procesima živih organizama. Molekuli koji su direktno kodirani genomom, kao što su nukleinske kiseline, proteini i peptidi izvedeni iz proteina proteolitičkim razlaganjem, se po pravilu ne unose u ChEBI.
Kontent | |
---|---|
Opis | Hemijska baza podataka |
Tipovi podataka | Hemijski entitet sa biološkim značajem |
Kontakt | |
Istraživački centar | Evropska laboratorija za molekularnu biologiju |
Laboratorija | Evropski bioinformatički institut |
Primarna citacija | [1] |
Pristup | |
Veb stranica | ChEBI |
URL za preuzimanje | Preuzimanje |
Veb servis URL | Veb servis |
SPARQL krajnja tačka | BIO2RDF |
Alati | |
Veb | ChEBI vebsajt |
Razno | |
Frekvencija objavljivanja podataka | mesečno |
Sadašnja smernica | manualna anotacija |
Literatura
uredi- ↑ 1,0 1,1 De Matos, P.; Alcantara, R.; Dekker, A.; Ennis, M.; Hastings, J.; Haug, K.; Spiteri, I.; Turner, S. i dr.. (2009). „Chemical Entities of Biological Interest: An update”. Nucleic Acids Research 38 (Database issue): D249–54. DOI:10.1093/nar/gkp886. PMC 2808869. PMID 19854951.
- ↑ Degtyarenko K., De Matos P., Ennis M., Hastings J., Zbinden M., McNaught A., Alcantara R., Darsow M., Guedj M. (2007). „ChEBI: A database and ontology for chemical entities of biological interest”. Nucleic Acids Research 36 (Database issue): D344–50. DOI:10.1093/nar/gkm791. PMC 2238832. PMID 17932057.
- ↑ Međunarodna unija za čistu i primenjenu hemiju. "molecular entity". Kompendijum Hemijske Terminologije Internet edition.