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Succinilcoenzima A: diferenças entre revisões

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A succinil CoA sintetase catalisa a seguinte reação reversível:
A succinil CoA sintetase catalisa a seguinte reação reversível:


=== Succinil CoA + Pi + NDP ↔ Succinato + CoA + NTP ===
== Succinil CoA + Pi + NDP ↔ Succinato + CoA + NTP ==
onde Pi denota fosfato inorgânico, NDP denota nucleosídeo difosfato (PIB ou ADP) e NTP denota nucleosídeo trifosfato (GTP ou ATP). Como mencionado, a enzima facilita o acoplamento da conversão de succinil CoA em succinato com a formação de NTP a partir de NDP e Pi. A reação tem uma mudança de energia livre de estado bioquímico padrão de -3,4 kJ / mol. [4] A reação ocorre por um mecanismo de três etapas [3]. O primeiro passo envolve o deslocamento de CoA de succinil CoA por uma molécula de fosfato inorgânico nucleofílico para formar foscinato de succinil. A enzima utiliza então um resíduo de histidina para remover o grupo fosfato do succinil fosfato e gerar succinato. Finalmente, a histidina fosforilada transfere o grupo fosfato para um difosfato de nucleosídeo, que gera o trifosfato de nucleosídeo transportador de alta energia.
onde Pi denota fosfato inorgânico, NDP denota nucleosídeo difosfato (PIB ou ADP) e NTP denota nucleosídeo trifosfato (GTP ou ATP). Como mencionado, a enzima facilita o acoplamento da conversão de succinil CoA em succinato com a formação de NTP a partir de NDP e Pi. A reação tem uma mudança de energia livre de estado bioquímico padrão de -3,4 kJ / mol. [4] A reação ocorre por um mecanismo de três etapas [3]. O primeiro passo envolve o deslocamento de CoA de succinil CoA por uma molécula de fosfato inorgânico nucleofílico para formar foscinato de succinil. A enzima utiliza então um resíduo de histidina para remover o grupo fosfato do succinil fosfato e gerar succinato. Finalmente, a histidina fosforilada transfere o grupo fosfato para um difosfato de nucleosídeo, que gera o trifosfato de nucleosídeo transportador de alta energia.
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== Papel na doença ==
== Papel na doença ==
Acidose láctica infantil fatal: A SCS defeituosa tem sido implicada como causa da acidose láctica infantil fatal, uma doença em bebês caracterizada pelo acúmulo de níveis tóxicos de ácido lático. A condição (quando é mais grave) resulta em morte geralmente dentro de 2 a 4 dias após o nascimento. [7] Foi determinado que pacientes com a condição exibem uma deleção de dois pares de bases no gene conhecido como SUCLG1 que codifica a subunidade α da SCS. [7] Como resultado, a SCS funcional está ausente no metabolismo, causando um grande desequilíbrio no fluxo entre a glicólise e o ciclo do ácido cítrico. Como as células não possuem um ciclo funcional de ácido cítrico, a acidose ocorre porque as células são forçadas a escolher a produção de ácido lático como o principal meio de produção de ATP.
Acidose láctica infantil fatal: A SCS defeituosa tem sido implicada como causa da acidose láctica infantil fatal, uma doença em bebês caracterizada pelo acúmulo de níveis tóxicos de ácido lático. A condição (quando é mais grave) resulta em morte geralmente dentro de 2 a 4 dias após o nascimento. [7] Foi determinado que pacientes com a condição exibem uma deleção de dois pares de bases no gene conhecido como SUCLG1 que codifica a subunidade α da SCS. [7] Como resultado, a SCS funcional está ausente no metabolismo, causando um grande desequilíbrio no fluxo entre a glicólise e o ciclo do ácido cítrico. Como as células não possuem um ciclo funcional de ácido cítrico, a acidose ocorre porque as células são forçadas a escolher a produção de ácido lático como o principal meio de produção de ATP.
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== LINKS EXTERNOS (específicos para o número CE 6.2.1.4) ==
[https://www.enzyme-database.org/query.php?ec=6.2.1.4 ExplorEnz]

[https://enzyme.expasy.org/EC/6.2.1.4 ExPASy]

[https://www.kegg.jp/dbget-bin/www_bget?ec:6.2.1.4 KEGG]

[https://metacyc.org/META/substring-search?type=NIL&object=6.2.1.4 MetaCyc]

[http://sabiork.h-its.org/newSearch?q=ecnumber:6.2.1.4 SABIO-RK]

NCBI: [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?SUBMIT=y&term=6.2.1.4%5BEC%2FRN%20Number%5D PubMed], [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein?SUBMIT=y&term=6.2.1.4%5BEC%2FRN%20Number%5D Protein], [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nucleotide?SUBMIT=y&term=6.2.1.4%5BEC%2FRN%20Number%5D Nucleotide], [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/structure?SUBMIT=y&term=6.2.1.4%5BEC%2FRN%20Number%5D Structure], [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?SUBMIT=y&term=6.2.1.4%5BEC%2FRN%20Number%5D Gene], [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim?SUBMIT=y&term=succinate-CoA+ligase+(GDP-forming) OMIM]

[https://www.qmul.ac.uk/sbcs/iubmb/enzyme/EC6/2/1/4.html IUBMB Enzyme Nomenclature]

[https://www.uniprot.org/uniprot/?query=ec:6.2.1.4&sort=score UniProt]

[https://www.rcsb.org/pdb/search/smart.do?smartSearchSubtype_0=EnzymeClassificationQuery&Enzyme_Classification_0=6.2.1.4 PDB]

[https://prosite.expasy.org/cgi-bin/prosite/prosite_search_full.pl?SEARCH=6.2.1.4 PROSITE Database of protein families and domains]

[https://www.ebi.ac.uk/interpro/ISearch?query=6.2.1.4&mode=all InterPro (database of protein families, domains and functional sites)]
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Edição atual tal como às 01h05min de 21 de janeiro de 2024

Succinilcoenzima A
Alerta sobre risco à saúde
Identificadores
Número CAS 604-98-8
PubChem 1111
MeSH succinyl-coenzyme+A
Propriedades
Fórmula molecular C25H40N7O19P3S
Massa molar 867.608
Página de dados suplementares
Estrutura e propriedades n, εr, etc.
Dados termodinâmicos Phase behaviour
Solid, liquid, gas
Dados espectrais UV, IV, RMN, EM
Exceto onde denotado, os dados referem-se a
materiais sob condições normais de temperatura e pressão

Referências e avisos gerais sobre esta caixa.
Alerta sobre risco à saúde.

EC 6 - Ligases

EC 6.2 - Formação de ligações carbono-enxofre

EC 6.2.1 - Ligases ácido-tiol

EC 6.2.1.4 - Succinato - CoA ligase (formação do PIB)

Nome aceito: succinato - CoA ligase (formação de PIB)

Outros nomes: G-STK, Enzima P, SCS, succinato de tioquinase, enzima foscinato-succinato, tioquinase succínica, succinil CoA sintetase, succinil coenzima A sintetase, succinil coenzima A sintetase (formadora de PIB), succinil coenzima A sintetase (formador de difosfato de guanosina), succinil-CoA sintetase (formadora de PIB)

Nome sistemático: succinato: CoA ligase (formação do PIB)


Succinil-Coenzima A, abreviado como Succinil-CoA ou SucCoA, é um tioéster, uma combinação de ácido succínico e coenzima A.


A succinil coenzima A sintetase (SCS, também conhecida como succinil-CoA sintetase ou succinato tioquinase ou succinato-CoA ligase) é uma enzima que catalisa a reação reversível da succinil-CoA para succinar. [3] A enzima facilita o acoplamento desta reação à formação de uma molécula de nucleosídeo trifosfato (GTP ou ATP) a partir de uma molécula inorgânica de fosfato e uma molécula nucleosídeo de difosfato (PIB ou ADP). Desempenha um papel fundamental como um dos catalisadores envolvidos no ciclo do ácido cítrico, uma via central no metabolismo celular, e está localizado na matriz mitocondrial de uma célula. [4]

A succinil CoA sintetase catalisa a seguinte reação reversível:

Succinil CoA + Pi + NDP ↔ Succinato + CoA + NTP

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onde Pi denota fosfato inorgânico, NDP denota nucleosídeo difosfato (PIB ou ADP) e NTP denota nucleosídeo trifosfato (GTP ou ATP). Como mencionado, a enzima facilita o acoplamento da conversão de succinil CoA em succinato com a formação de NTP a partir de NDP e Pi. A reação tem uma mudança de energia livre de estado bioquímico padrão de -3,4 kJ / mol. [4] A reação ocorre por um mecanismo de três etapas [3]. O primeiro passo envolve o deslocamento de CoA de succinil CoA por uma molécula de fosfato inorgânico nucleofílico para formar foscinato de succinil. A enzima utiliza então um resíduo de histidina para remover o grupo fosfato do succinil fosfato e gerar succinato. Finalmente, a histidina fosforilada transfere o grupo fosfato para um difosfato de nucleosídeo, que gera o trifosfato de nucleosídeo transportador de alta energia.

Regulação e Inibição

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Em algumas bactérias, a enzima é regulada no nível transcricional. [5] Foi demonstrado que o gene para SCS (sucCD) é transcrito junto com o gene da α-cetoglutarato desidrogenase (sucAB) sob o controle de um promotor chamado sdhC, que faz parte do operon succinato desidrogenase. Esse operon é regulado pela presença de oxigênio e responde a uma variedade de fontes de carbono. Drogas antibacterianas que impedem a fosforilação da histidina, como a molécula LY26650, são inibidores potentes das SCS bacterianas. [6]

Papel na doença

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Acidose láctica infantil fatal: A SCS defeituosa tem sido implicada como causa da acidose láctica infantil fatal, uma doença em bebês caracterizada pelo acúmulo de níveis tóxicos de ácido lático. A condição (quando é mais grave) resulta em morte geralmente dentro de 2 a 4 dias após o nascimento. [7] Foi determinado que pacientes com a condição exibem uma deleção de dois pares de bases no gene conhecido como SUCLG1 que codifica a subunidade α da SCS. [7] Como resultado, a SCS funcional está ausente no metabolismo, causando um grande desequilíbrio no fluxo entre a glicólise e o ciclo do ácido cítrico. Como as células não possuem um ciclo funcional de ácido cítrico, a acidose ocorre porque as células são forçadas a escolher a produção de ácido lático como o principal meio de produção de ATP.

1.   Fraser ME, Hayakawa K, Hume MS, Ryan DG, Brownie ER (Apr 2006). "Interactions of GTP with the ATP-grasp domain of GTP-specific succinyl-CoA synthetase". The Journal of Biological Chemistry. 281 (16): 11058–65. doi:10.1074/jbc.M511785200. PMID 16481318.

2.   Fraser ME, James MN, Bridger WA, Wolodko WT (Jan 1999). "A detailed structural description of Escherichia coli succinyl-CoA synthetase". Journal of Molecular Biology. 285(4): 1633–53. doi:10.1006/jmbi.1998.2324. PMID 9917402.

3.   Voet, Donald J. (2011). Biochemistry / Donald J. Voet ; Judith G. Voet. New York, NY: Wiley, J. ISBN 978-0-470-57095-1.

4.   Berg, Jeremy M. (Jeremy M.); Tymoczko, John L.; Stryer, Lubert.; Stryer, Lubert. Biochemistry. (2002). Biochemistr. New York: W.H. Freeman. pp. 475–477. ISBN 0-7167-3051-0.

5.   Kruspl W, Streitmann B (Feb 1975). "[Knotty reticulosis with keloid formation]". Zeitschrift für Hautkrankheiten. 50 (3): 117–25. PMID 179232.

6.   Hunger-Glaser I, Brun R, Linder M, Seebeck T (May 1999). "Inhibition of succinyl CoA synthetase histidine-phosphorylation in Trypanosoma brucei by an inhibitor of bacterial two-component systems". Molecular and Biochemical Parasitology. 100 (1): 53–9. doi:10.1016/s0166-6851(99)00032-8. PMID 10376993.

7.   Ostergaard E, Christensen E, Kristensen E, Mogensen B, Duno M, Shoubridge EA, Wibrand F (Aug 2007). "Deficiency of the alpha subunit of succinate-coenzyme A ligase causes fatal infantile lactic acidosis with mitochondrial DNA depletion". American Journal of Human Genetics. 81 (2): 383–7. doi:10.1086/519222. PMC 1950792. PMID 17668387.

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