DE69933131T2 - CELLS FOR THE PRODUCTION OF HELPER-DEPENDENT ADENOVIRUS VECTORS - Google Patents
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Abstract
Description
Gebiet der ErfindungTerritory of invention
Die vorliegende Erfindung betrifft das Gebiet der Gentherapie und insbesondere die Verwendung und die Entwicklung von Vektoren viralen Ursprungs und von Zelllinien zu deren Herstellung.The The present invention relates to the field of gene therapy, and more particularly the use and development of vectors of viral origin and of cell lines for their production.
Hintergrund der Erfindungbackground the invention
Ein wichtiger Aspekt bei der Entwicklung der Gentherapie ist die Entwicklung von Vektoren, welche zur Einführung von genetischem Material in Zielzellen in der Lage sind. Um effektiv zu sein, müssen diese Vektoren mehrere Merkmale besitzen: Sie müssen in der Lage sein, große oder mehrere Transgene, einschließlich Genregulationselemente, aufzunehmen, jedoch einfach manipulierbar bleiben, um deren Produktion in pharmazeutischem Maßstab zu ermöglichen. Darüber hinaus ist es essentiell, dass sie sicher und von niedriger Toxizität sind, jedoch das Vermögen zur Einführung der Transgene in effizienter und selektiver Weise in die Zielgewebe erhalten bleibt. Schließlich sollte der Vektor vorzugsweise mit einer geeigneten Retention, Expression und Regulation des Transgens in der Zielzelle kompatibel sein.One important aspect in the development of gene therapy is the development of vectors, which introduce of genetic material in target cells. To be effective they have to be Vectors have several features: You must be able to large or including several transgenes Gene regulatory elements, absorb, but easily manipulated remain to enable their production on a pharmaceutical scale. About that In addition, it is essential that they are safe and of low toxicity, but the fortune for the introduction the transgenes in an efficient and selective manner into the target tissues preserved. After all Preferably, the vector should be given a suitable retention, expression and regulation of the transgene in the target cell.
Derzeit scheinen die viralen Vektoren auf Adenovirus-Basis diejenigen zu sein, welche für Manipulationen am geeignetsten sind, die sie in die Lage versetzen, alle diese Anforderungen zu erfüllen. Bisher werden sie als effektivstes System zur Einführung heterologer Gene in Säugerzellen, sowohl in vivo als auch in Zellen, die in vitro kultiviert wurden, betrachtet (Hitt, M. M., et al. 1997, Advances in Pharmacol. 40, 137-206).Currently The adenovirus-based viral vectors seem to be those too be which for The most appropriate manipulations that enable them to to meet all these requirements. So far, they are becoming the most effective system for introducing heterologous Genes in mammalian cells, both in vivo and in cells cultured in vitro (Hitt, M.M., et al., 1997, Advances in Pharmacol., 40, 137-206).
Dies beruht auf einigen interessanten Eigenschaften der Adenoviren (Ad), welche eine DNA-Virus-Familie ausmachen (diejenigen, welche den Menschen infizieren, wurden in 57 Serotypen klassifiziert), die durch ein ikosaedrales Kapsid, dem eine äußere Hülle fehlt, gekennzeichnet ist: Sie sind sehr infektiös, aber relativ harmlos, infizieren hauptsächlich Epithelzellen, können jedoch auch Zellen anderer Gewebe infizieren, unabhängig davon, ob sie in der aktiven Replikationsphase vorliegen. Aufgrund ihrer hohen Infektivität in vitro von Zelllinien humanen Ursprungs können sie leicht in großen Mengen hergestellt werden. Darüber hinaus wurde bewiesen, dass Human-DNA-Inserts mittels Ad-Infektion effizient in humane Epithelzellen transferiert werden können (Horvitz, "Adenoviridae and their replication" in Virology, Field und Knipe, Hrsg. Raven Press, NY; 1990; Seiten 1679-1740).This based on some interesting properties of adenoviruses (Ad), which is a DNA virus family (those who infect humans were in 57 serotypes) characterized by an icosahedral capsid, which lacks an outer shell, They are very infectious, but relatively harmless, infecting mainly Epithelial cells, can but also infect cells of other tissues, regardless of whether they are in the active replication phase. Because of your high infectivity In vitro, from cell lines of human origin, they can easily in large quantities getting produced. About that In addition, it has been proven that human DNA inserts by means of ad infection can be efficiently transferred into human epithelial cells (Horvitz, "Adenoviridae and their replication "in Virology, Field and Knipe, ed. Raven Press, NY; 1990; Pages 1679-1740).
Bezüglich der molekularen Biologie des Virus hat Adenovirus, insbesondere das humane Adenovirus, ein lineares doppelsträngiges DNA-Genom von etwa 36 kB, das funktionell in zwei Bereiche, nicht-strukturell und strukturell, aufgeteilt ist. Der erste Bereich umfasst Bereiche, welche für Polypeptide codieren, die in den ersten Stadien der Infektion exprimiert werden, d.h. vor der viralen DNA-Replikation (E-Bereiche), der zweite umfasst Bereiche, welche für Polypeptide codieren, die in den nachfolgenden Stadien des viralen Zyklus exprimiert werden (L-Bereich). Nach der Infektion einer kompetenten Zelle, wenn die virale DNA den Kern erreicht, ist der erste zu transkribierende Bereich der E1a-Bereich, codierend für Proteine, die an der Transaktivierung der anderen Bereiche, sowohl E als auch L, der viralen DNA beteiligt sind. Der anschließend transkribierte E1b-Bereich codiert für Proteine, welche die RNA-Synthese, sowohl die virale als auch diejenige der Wirtszelle, regulieren und die letztere vor dem apoptotischen Effekt schützen, der ansonsten von E1a entfaltet wird. Deshalb sind die E1a/E1b-Funktionen für die virale Replikation essentiell.Regarding the molecular biology of the virus has adenovirus, in particular the human adenovirus, a linear double-stranded DNA genome of about 36 kB, which is functional in two areas, non-structural and structural, is divided. The first region comprises regions which code for polypeptides, which are expressed in the first stages of infection, i. before viral DNA replication (E regions), the second includes Areas which for Encode polypeptides that are in the subsequent stages of the viral Cycle are expressed (L-range). After infection of a competent Cell, when the viral DNA reaches the nucleus, is the first to be transcribed Area of the E1a region, coding for proteins involved in transactivation the other areas, both E and L, are involved in the viral DNA are. The following transcribed E1b region codes for proteins encoding RNA synthesis, Both the viral and the host cell, regulate and protect the latter from the apoptotic effect that otherwise unfolded by E1a. That's why the E1a / E1b functions are for the viral replication essential.
Der E2-Bereich codiert für Proteine, die direkt an der viralen Replikation beteiligt sind, wie z.B. die virale DNA-Polymerase, das präterminale Protein und Proteine, die an die virale DNA binden. Der E3-Bereich codiert für Proteine, welche für die virale Replikation in kultivierten Zellen nicht erforderlich sind, jedoch in vivo an der Regulation der antiviralen Immunreaktion beteiligt sind. Schließlich enthält der E4-Bereich Gruppen von Genen, deren Produkte die Genexpression der Wirtszelle verringern und die Transkription der E2- und L-Bereiche des viralen Genoms erhöhen.Of the E2 area coded for Proteins that are directly involved in viral replication, such as. the viral DNA polymerase, the preterminal protein and proteins, which bind to the viral DNA. The E3 region codes for proteins, which for viral replication in cultured cells are not required, however, involved in the regulation of the antiviral immune response in vivo are. After all contains the E4 region groups of genes whose products affect gene expression reduce the host cell and transcribe the E2 and L regions of the viral Increase genome.
Der L-Bereich des viralen Genoms codiert im Wesentlichen für Proteine des strukturellen Typs oder Proteine, die in irgendeiner Weise an der Assemblierung der viralen Partikel beteiligt sind.Of the L region of the viral genome essentially codes for proteins of the structural type or proteins, in any way involved in the assembly of viral particles.
In den ersten 40 Jahren nach der ersten Isolierung und Charakterisierung von Ad-Viren nahmen die relevanten Modifizierungen, welche sie zu effizienten Trägern für den Transfer von genetischem Material machten, zu.In the first 40 years after the first isolation and characterization Ad viruses took the relevant modifications they made efficient carriers for the Transfer of genetic material.
Insbesondere wurden die Eingriffe an dem Ad-Genom zuerst durchgeführt, um:
- – das Vermögen des viralen Genoms zur Akzeptanz des Einbaus heterologer Gene zu erhöhen; und
- – intrazelluläre Toxizität, welche sich aus der Expression von Adenovirus-Genen ergibt, zu eliminieren.
- To increase the ability of the viral genome to accept the incorporation of heterologous genes; and
- - to eliminate intracellular toxicity resulting from the expression of adenovirus genes.
Solche Eingriffe bestehen hauptsächlich in der Bereitstellung progressiver Deletionen viraler Bereiche, deren Funktionen in trans bereitgestellt werden.Such Interventions mainly exist in the provision of progressive deletions of viral regions, whose functions are provided in trans.
In Vektoren der ersten Generation (abgeleitet von den humanen Ad-Serotypen 2 und 5) beinhaltete die Deletion den E1-Bereich, welches das Virus hinsichtlich des Replikationsvermögens defizient macht, wenn die von einer solchen transkriptionalen Einheit produzierten Proteine nicht in trans bereitgestellt werden.In vectors of the first generation (deriv from human Ad serotypes 2 and 5), the deletion involved the E1 region, which renders the virus deficient in replicability if the proteins produced by such a transcriptional entity are not provided in trans.
Eine Erhöhung der Größe des heterologen Gens, welches inseriert werden soll, und die Beschränkung der Vermehrung der rekombinanten Viren in Zelllinien, welche einen solchen Defekt komplementieren, da sie Gene des viralen E1-Bereichs konstitutiv exprimieren, wurde erhalten.A increase the size of the heterologous gene, which is to be inserted and the restriction of the multiplication of the recombinant Viruses in cell lines that complement such a defect, as they constitutively express genes of the viral E1 region was receive.
Jedoch ist die Deletion von E1 nicht per se ausreichend, um die Expression anderer Gene der E- und L-Bereiche vollständig zu eliminieren und um die Replikation viraler DNA zu verhindern. Es folgt, dass in Tieren, die mit diesen Vektoren infiziert wurden, die Anwesenheit viraler Antigene und der Beginn von Immunreaktionen, welche auf die Zerstörung der infizierten Zellen abzielen, nachgewiesen werden (Yang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91:4407-4411; 1994). Dies führt zu dem Verlust des Gens von therapeutischem Interesse und zum Beginn von Entzündungsreaktionen. Darüber hinaus kann das Bestehenbleiben eines immunologischen Gedächtnisses dieser Reaktionen die Wirksamkeit einer zweiten Verabreichung eines Adenovirus-Vektors dieses Typs stark verringern (Kozarsky et al., J. Biol. Chem. 269:1-8; 1994).however the deletion of E1 is not sufficient per se for expression completely eliminate other genes of the E and L regions and vice versa to prevent the replication of viral DNA. It follows that in animals, infected with these vectors, the presence of viral Antigens and the onset of immune reactions, which are related to the destruction of are detected (Yang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91: 4407-4411; 1994). This leads to the loss of the gene of therapeutic interest and the onset of inflammatory reactions. About that In addition, the persistence of an immunological memory of these reactions the effectiveness of a second administration of a Strongly reduce adenovirus vector of this type (Kozarsky et al., J. Biol. Chem. 269: 1-8; 1994).
Somit wurden neue adenovirale Vektoren der zweiten Generation, welche verschiedene Kombinationen von Deletionen früher Gene tragen, konstruiert, um das Sicherheitsprofil von Adenovirus-Vektoren zu verbessern. Von Vektoren, die unterschiedlich E1-, E2-, E3- und/oder E4-Deletionen kombinieren, wurde demonstriert, dass sie weniger zytotoxisch in vitro und stabiler in der Mausleber als die klassischen ΔE1-Vektoren der ersten Generation sind (Gao, G-P., 1996, J. Virol. 70:8934-8943; Dedieu, J-F., 1997, J. Virol. 71:4626-4637; Gorziglia, M. I., 1996, J. Virol. 70:4173-4178; Amalfitano, A., 1998, J. Virol. 72:926-933). in vifro-Experimente demonstrierten, dass solche Deletionen die Toxizität effektiv verringerten, jedoch nicht eliminierten.Consequently were new adenoviral vectors of the second generation, which carry different combinations of deletions of early genes, constructed, to improve the safety profile of adenovirus vectors. Of vectors that combine different E1, E2, E3 and / or E4 deletions, has been demonstrated to be less cytotoxic in vitro and more stable in the mouse liver than the classical first generation ΔE1 vectors (Gao, G-P., 1996, J. Virol. 70: 8934-8943; Dedieu, J-F., 1997, J. Virol. 71: 4626-4637; Gorziglia, M.I., 1996, J. Virol. 70: 4173-4178; Amalfitano, A., 1998, J. Virol. 72: 926-933). in vifro experiments demonstrated that such deletions effectively reduced toxicity, but not eliminated.
Darüber hinaus wurden Vektoren, die zusätzliche Deletionen trugen, welche das Vermögen des viralen Genoms zur Akzeptanz der Insertion heterologer Gene weiter erhöhten, hergestellt (Englehardt et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91:6196-6200; 1994; Bett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91:8802-8806; 1994; Yeh, P., et al. 1996, J. Virol. 70:559-565). Jedoch überstieg die maximale Kapazität eines Adenovirus-Vektors der ersten Generation nicht 8 kb, wohingegen diejenigen eines ΔE1/E3/E4-Vektors 11 kb erreicht und die fremden Gene gleichermaßen in den Bereich E1 oder E3 insertiert werden können.Furthermore were vectors that extra Deletions contributed to the capacity of the viral genome Acceptance of the insertion of heterologous genes further increased (Englehardt et al., Proc. Natl. Acad Sci. 91: 6196-6200; 1994; Bett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91: 8802-8806; 1994; Yeh, P., et al. 1996, J. Virol. 70: 559-565). However, the maximum capacity exceeded one First generation adenovirus vector not 8 kb, whereas those of a ΔE1 / E3 / E4 vector Reached 11 kb and the foreign genes equally in the range E1 or E3 can be inserted.
In diesem Zusammenhang wurden nach der Entdeckung, dass ein minimaler Anteil, etwa 600 bp, der viralen DNA unbedingt für die Replikation und die Verpackung rekombinanter Vektoren erforderlich ist, vollständig defiziente Adenovirus-Vektoren, die folglich vollständig von der Anwesenheit von Helferviren für die Replikation und ihre Assemblierung in virale Partikel abhängen, entwickelt.In This connection was after the discovery that a minimal Share, about 600 bp, of viral DNA strictly for replication and packaging recombinant vectors is required, completely deficient adenovirus vectors, consequently complete from the presence of helper viruses for replication and theirs Depend on assembly into viral particles.
Derartige helfer-abhängige Adenovirus-Vektoren (AdHD) tragen minimale Ad-Sequenzen, welche die für die Replikation und die Verpackung ausreichenden Signale enthalten. Alle anderen Faktoren, welche für die Virion-Produktion erforderlich sind, werden in trans von einem Helfervirus bereitgestellt. Das Helfergenom ist in einer solchen Weise konstruiert, dass seine Sequenzen, die Verpackungssignale enthalten, in vivo durch die Verwendung spezifischer Rekombinationssysteme, wie z.B. das cre/lox-System (WO97/32481), unschwer eliminiert werden können.such helper-dependent Adenovirus vectors (AdHD) carry minimal Ad sequences, which the for the replication and packaging contain sufficient signals. All other factors which for The virion production required are in trans from one Helper virus provided. The helper genome is in such a Way constructed, that its sequences, the packaging signals contained in vivo through the use of specific recombination systems, such as. the cre / lox system (WO97 / 32481) can be easily eliminated can.
Dementsprechend basieren die relevanten Strategien für die Herstellung von helferabhängigen Adenovirus-Virionen (adenoHD) im Wesentlichen auf der Verwendung von drei Elementen:
- – Zelllinien, welche transformiert sind, um sie zur Expression der Gene, welche für die Gruppe von Adenovirus-E1-Proteinen und eine Rekombinase, gewöhnlich "cre", codieren, zu befähigen;
- – einem Helfer-Adenovirus, worin der E1-Bereich deletiert ist und worin die viralen DNA-Sequenzen, welche für dessen Verpackung im Inneren des reifen Virions erforderlich sind, von Rekombinationsstellen flankiert werden, welche als Substrate für die Rekombinase ("IoxP" im Falle von "cre") fungieren;
- – dem adenoHD-Vektor, welcher das Transgen von Interesse trägt.
- Cell lines transformed to enable them to express the genes encoding the group of adenovirus E1 proteins and a recombinase, usually "cre";
- A helper adenovirus, wherein the E1 region is deleted, and wherein the viral DNA sequences required for its packaging inside the mature virion are flanked by recombination sites which serve as substrates for the recombinase ("IoxP" in the case of from "cre");
- The adenoHD vector carrying the transgene of interest.
Obwohl diese Strategie eine bemerkenswerte Verbesserung gegenüber den bei den Vektoren der ersten Generation verwendeten Strategien darstellt, bringt sie trotzdem gewisse Probleme mit sich. Für eine Produktion im pharmazeutischen Maßstab bringt das Erfordernis der Kontrolle dreier unabhängiger Komponenten (die Zelllinie, das Helfer-Adenovirus und der transgene Vektor) Schwierigkeiten mit sich, welche schwer zu überwinden sind, und inakzeptable Produktionskosten.Even though this strategy is a notable improvement over the represents strategies used in the vectors of the first generation still brings some problems with it. For a production in the pharmaceutical Scale brings the requirement of controlling three independent components (the cell line, the helper adenovirus and the transgenic vector), which are difficult to overcome are, and unacceptable production costs.
Zunächst katalysieren die Rekombinasen vom cre-Typ sowohl die Deletion als auch die Insertion der von den IoxP-Stellen flankierten DNA-Bereiche. Die Ausschnittsreaktion ist normalerweise bis zu 20fach effizienter als die gegenteilige, jedoch kann eine vollständige Entfernung des Helfers aus der viralen Produktion niemals erzielt werden. Dies ist insbesondere in der pharmazeutischen Praxis nicht akzeptabel und eine Helfer-Kontaminierung von Präparationen zur therapeutischen Anwendung ist ein sehr schwerwiegendes Problem.First, the cre-type recombinases catalyze both the deletion and insertion of the DNA regions flanked by the IoxP sites. The cleavage reaction is usually up to 20-fold more efficient than the opposite, but complete removal of the helper from viral production can never be achieved. This is unacceptable especially in pharmaceutical practice and a helper contamination of Präpa Therapeutic use is a very serious problem.
Eine zweite Beschränkung dieses Strategietyps beruht auf der Schwierigkeit, die quantitativen Verhältnisse zwischen Helfervirus und helfer-abhängigem Virus während des Amplifizierungsverfahrens zu optimieren. Somit erreicht die Vektor-Amplifizierung selten die Effizienz der Vektoren der ersten Generation und oft werden Ausbeuten von bis zu einer Größenordnung weniger erhalten. Wie im vorherigen Fall, ist dieses Problem dramatisch, wenn eine Produktion im industriellen Maßstab erforderlich ist und die Kosten praktisch untragbar werden.A second restriction This strategy type is based on the difficulty, the quantitative relationships between helper virus and helper-dependent virus during the To optimize the amplification process. Thus, the vector amplification achieves rarely the efficiency of the first generation vectors and often yields of up to an order of magnitude less are obtained. As in the previous case, this problem is dramatic when one Production on an industrial scale is necessary and the costs become practically unsustainable.
Zur Lösung des Problems, welches sich aus der Kontaminierung mit Helfervirus ergibt, und zur Verringerung der Anzahl von Komponenten ist eine alternative Strategie, die im Stand der Technik bekannt ist, diejenige, Zelllinien zu manipulieren, um sie zur Expression aller Faktoren, welche für die Verpackung des defekten Virus erforderlich sind, in die Lage zu versetzen, um somit das Helfervirus zu eliminieren.to solution of the problem resulting from the contamination with helper virus and reducing the number of components is an alternative Strategy known in the art, that cell lines to manipulate them to express all the factors involved in the packaging the defective virus are needed to enable so as to eliminate the helper virus.
Im Stand der Technik gibt es mehrere Beschreibungen von Zellen, welche ein oder mehrere virale(s) Protein(e) exprimieren (siehe beispielsweise WO98/13499). Solche Zelllinien können zur Produktion von Adenovirus-Vektoren verwendet werden, denen die komplementären viralen Proteine fehlen. Jedoch ist es gemäß dieser Strategie äußerst schwierig, die exakte Koordination der Ereignisse zwischen der viralen DNA-Replikation und der Expression der Strukturproteine zu erzielen, so dass die natürliche Infektion zu der massiven Produktion von Viruspartikeln führt, welche für die lytische Phase typisch ist. Dementsprechend kann unter Adoption dieser Strategien der virale Zellzyklus nicht nachgeahmt werden. In dessen Abwesenheit kann nur eine begrenzte Ausbeutekapazität erreicht werden.in the Prior art there are several descriptions of cells which express one or more viral protein (s) (see for example WO98 / 13499). Such cell lines can used to produce adenovirus vectors to which the complementary missing viral proteins. However, according to this strategy, it is extremely difficult the exact coordination of events between viral DNA replication and to achieve the expression of the structural proteins, so that the natural infection leads to the massive production of virus particles, which are responsible for the lytic Phase is typical. Accordingly, with adoption of these strategies the viral cell cycle can not be mimicked. In his absence Only a limited yield capacity can be achieved.
Zusammenfassung der ErfindungSummary the invention
Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist eine Helferzelllinie, welche die Produktion von helferabhängigen Adenovirus-Vektoren in der vollständigen Abwesenheit irgendeiner Art von Helfervirus ermöglicht. Solch eine Zelllinie wurde in der Tat konstruiert, damit alle essentiellen Funktionen für die Ad-Virus-Replikation in den Zellen enthalten sind, insbesondere aufgespalten in zwei genetische Einheiten, welches eine strikt regulierte Expression davon erlaubt.task The present invention is a helper cell line, which the Production of helper-dependent Adenovirus vectors in the complete absence of any Type of helper virus allows. Such a cell line was indeed constructed to be all essential Functions for the ad virus replication are contained in the cells, in particular split into two genetic units, one strictly regulated Expression allowed.
Die erste genetische Einheit umfasst mindestens ein defektes Adenovirus-Genom, bei dem die invertierten terminalen Repeats (ITRs) in einer Kopf-zu-Schwanz-Konfiguration vorliegen und das Verpackungssignal und mindestens einer der nicht-strukturellen Bereiche inaktiviert ist.The first genetic unit comprises at least one defective adenovirus genome, in which the inverted terminal repeats (ITRs) are in a head-to-tail configuration present and the packaging signal and at least one of the non-structural Areas is disabled.
Solche nicht-strukturellen Bereiche können exprimierte Bereiche oder cis-wirkende Elemente sein. Die exprimierten Bereiche können sowohl nicht-translatierte Nicht-Strukturgene sein, wie z.B. die VA-Gene, oder translatierte Nicht-Strukturgene wie die E1-, E2- und E4-Gene.Such non-structural areas can be expressed Be areas or cis-acting elements. The expressed areas can both non-translated non-structural genes, e.g. the VA genes, or translated non-structural genes such as the E1, E2 and E4 genes.
In einer bevorzugten Ausführungsform erfolgt die Inaktivierung durch vollständige oder, bevorzugter, durch partielle Deletion mindestens eines solchen Bereichs; das Verpackungssignal wird ebenfalls vorzugsweise durch vollständige oder partielle Deletion inaktiviert.In a preferred embodiment the inactivation is carried out by complete or, more preferably, by partial deletion of at least one such region; the packaging signal is also preferably by full or partial deletion inactivated.
Eine solche erste genetische Einheit kann auf einer episomalen Einheit lokalisiert sein oder in das Genom der Wirtszellen integriert sein.A such first genetic entity may be on an episomal unit be localized or integrated into the genome of the host cells.
Im ersten Fall muss die episomale Einheit mindestens ein Element umfassen, welches die Replikation der episomalen Einheit selbst mit einer niedrigen Kopienzahl ermöglicht. Ein solches Element kann aus Sequenzen, welche die DNA-Replikation und deren Retention im Kern vermitteln, aufgebaut sein (Calos, M. P., 1996, Trends Genet. 12:463-466) oder aus dem Replikationsursprung des Ursprungs des Replikationssystems eines Virus, aktiviert durch mindestens einen Aktivierungsfaktor.in the In the first case, the episomal unit must comprise at least one element, which replicates the episomal unit itself with a low copy number allows. Such an element may consist of sequences involving DNA replication and their retention in the core, be built (Calos, M. P., 1996, Trends Genet. 12: 463-466) or from the replication origin the origin of the replication system of a virus activated by at least an activation factor.
Der Replikationsursprung muss in jedem Fall auf der episomalen Einheit lokalisiert sein; der Aktivierungsfaktor kann stattdessen in die Zelle eingeführt sein oder das relevante Gen kann auf der episomalen Einheit, einschließlich der ersten genetischen Einheit, (oder in irgendeiner anderen replizierenden Einheit innerhalb der Zelle) lokalisiert sein oder kann in das Genom der Wirtszelle integriert sein. In jedem Fall soll das Gen, welches für den Akti vierungsfaktor innerhalb der Zellen der vorliegenden Erfindung codiert, exprimiert werden, um die Replikation der ersten genetischen Einheit in der episomalen Einheit zu erlauben.Of the Replication origin must in any case be on the episomal unit be localized; the activation factor may instead be in the Cell introduced or the relevant gene may be on the episomal unit, including the first genetic unit, (or in any other replicating unit within the cell) or can be located in the genome of the Host cell be integrated. In any case, the gene should be for the Akti vierungsfaktor within the cells of the present invention encoded, expressed to replicate the first genetic To allow unity in the episomal unit.
Ein Beispiel eines Ursprungs eines Replikationssystems, der für die vorliegende Erfindung funktionell ist, ist das relevante System des Epstein-Barr-Virus (welches das bevorzugte ist), worin der Replikationsursprung das OriP-Element ist und der Aktivierungsfaktor das EBNA-1-Protein ist. Jedoch sind unterschiedliche Systeme, wie z.B. dasjenige des Rinder-Papillomavirus (BPV) (Calos, M. P. (1998), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:4084), oder diejenigen aus Vektoren, welche auf einem SV40-Ursprung-T-Antigen-System basieren, ebenfalls geeignet.One Example of an origin of a replication system used for the present Invention is functional, is the relevant system of Epstein-Barr virus (which is the preferred), wherein the origin of replication is the OriP element and the activation factor is the EBNA-1 protein. however are different systems, e.g. that of bovine papillomavirus (BPV) (Calos, M.P. (1998), Proc Natl Acad Sci., USA 95: 4084), or those from vectors based on an SV40 origin T-antigen system, also suitable.
Die Anwesenheit eines solchen Ursprungs eines Replikationssystems erlaubt der ersten genetischen Einheit die Replikation in einer geringen Kopienzahl, während die ITRs in der ersten genetischen Einheit die Replikation in einer hohen Kopienzahl in Anwesenheit der von den E2-Bereichen codierten Proteine erlaubt.The presence of such origin of a replication system allows the first geneti low copy number replication, whereas the ITRs in the first genome allow replication in a high copy number in the presence of the proteins encoded by the E2 regions.
Falls stattdessen die erste genetische Einheit in das Genom der Wirtszellen integriert ist, müssen ITR-Sequenzen in einer Kopf-zu-Schwanz-Konfiguration an beiden Enden der ersten genetischen Einheit vorliegen. Solche ITRs erlauben in der Tat die Freisetzung und Replikation der ersten genetischen Einheit in hoher Kopienzahl in Anwesenheit der regulatorischen Proteine, welche von den oben genannten Genen der E2-Bereiche codiert werden.If instead, the first genetic unit in the genome of the host cells integrated ITR sequences in a head-to-tail configuration at both ends the first genetic unit. Such ITRs allow in indeed the release and replication of the first genetic unit in high copy number in the presence of the regulatory proteins, which are encoded by the above genes of the E2 regions.
In jedem Fall können ferner regulatorische Elemente, welche die Expression von mindestens einem der nicht-strukturellen Bereiche in der ersten genetischen Einheit steuern, in einer solchen ersten genetischen Einheit enthalten sein oder können auch in der Zelle, vorzugsweise im Zellgenom integriert, vorliegen.In any case can furthermore, regulatory elements which inhibit the expression of at least one of the non-structural areas in the first genetic Control unit, contained in such a first genetic unit be or can also in the cell, preferably integrated in the cell genome.
Ein Beispiel solcher regulatorischer Elemente sind die Elemente, welche von Rittner (Rittner, K., et al. (1997), J. Virol. 71:3307-3311) beschrieben wurden.One Examples of such regulatory elements are the elements which by Rittner (Rittner, K., et al., (1997) J. Virol 71: 3307-3311) have been described.
Die zweite genetische Einheit umfasst eine induzierbare Transkriptionseinheit, welche die viralen nicht-strukturellen Bereiche, die in dem defekten Ad-Genom der ersten genetischen Einheit inaktiviert sind, unter der Kontrolle eines auf eine strikte Regulation ansprechenden induzierbaren Promotors umfasst. Solche Bereiche können beispielsweise E1, E2A, E2B und/oder E4 sein.The second genetic unit comprises an inducible transcription unit, which are the viral non-structural regions present in the defective ad genome the first genetic unit are inactivated, under control an inducible promoter responsive to strict regulation includes. Such areas can for example, be E1, E2A, E2B and / or E4.
Ein induzierbarer Promotor in den genetischen Einheiten der vorliegenden Erfindung und insbesondere in der zweiten genetischen Einheit ist ein Promotor, der von einem Induktor induziert wird. Ein Beispiel ist der Tetracyclin-Promotor, welcher der bevorzugte ist, und Promotoren, welche durch die Anwesenheit anderer Induktoren wie Ecdyson, Rapamycin, RU486, Dexamethason oder ein Schwermetall wie Zn oder Cd reguliert werden, sind gleichermaßen geeignet.One inducible promoter in the genetic units of the present Invention and in particular in the second genetic unit a promoter induced by an inducer. An example is the tetracycline promoter, which is the preferred, and promoters, which is due to the presence of other inducers such as ecdysone, rapamycin, RU486, dexamethasone or a heavy metal such as Zn or Cd regulated be, are alike suitable.
Ein solcher Promotor kann funktionsfähig mit regulatorischen Elementen, wie z.B. auf Tetracyclin ansprechende Transaktivatoren und/oder Silencer (rtTA und tTS), welche beide die strenge Regulierung der Transkriptionseinheit ermöglichen, verknüpft sein.One such promoter can be functional with regulatory elements, e.g. responsive to tetracycline Transactivators and / or silencers (rtTA and tTS), both enable the strict regulation of the transcription unit, be linked.
Die zweite genetische Einheit kann in die Wirtszelle durch einen Vektor eingeführt werden, welcher ein Virus oder Plasmid sein kann, in das Genom der Wirtszelle integriert oder auf einer episomalen Einheit vorliegen kann; in jedem Fall muss sie während der Wachstumsphase der Zelllinie inaktiv gehalten werden, um die zytotoxische Wirkung der viralen Proteine zu vermeiden. Zu diesem Zweck können spezifische regulatorische Elemente, welche die spezifische Repression der Transkriptionseinheit ermöglichen, in der zweiten genetischen Einheit eingeschlossen sein. Ein Beispiel eines solchen Repressors ist das Tet/krab-Fusionsprotein.The second genetic unit can enter the host cell through a vector introduced which may be a virus or plasmid into the genome of the Host cell integrated or present on an episomal unit can; In any case, she must during the growth phase of the cell line are kept inactive to the to avoid cytotoxic effect of viral proteins. To this Purpose can be specific regulatory elements affecting the specific repression of the transcription unit enable, to be included in the second genetic unit. An example such a repressor is the Tet / krab fusion protein.
Solche Repressor-Elemente sind in jedem Fall funktionell mit dem induzierbaren Promotor und dem regulatorischen Element, welches die Expression der oben beschriebenen Transkriptionseinheit erhöht, koordiniert.Such Repressor elements are in each case functional with the inducible Promoter and the regulatory element expressing the expression the transcription unit described above, coordinated.
In Abwesenheit des Induktors, welcher auf den relevanten induzierbaren Promotor der zweiten genetischen Einheit (Transkriptionseinheit) einwirkt, werden die darin enthaltenen nicht-strukturellen Bereiche tatsächlich nicht exprimiert, die erste genetische Einheit ist inaktiv und somit gibt es keine Produktion von viralem Protein, welches für die Zelle toxisch ist.In Absence of the inducer, indicating the relevant inducible Promoter of the second genetic unit (transcription unit) the non-structural areas contained in it indeed not expressed, the first genetic unit is inactive and thus There is no production of viral protein, which is responsible for the cell is toxic.
Zum Starten der Produktion des helfer-abhängigen Adenovirus-Vektors wird die Helferzelllinie mit dem helfer-abhängigen Adenovirus-Vektor infiziert, der in großen Mengen hergestellt werden soll, und in der Zwischenzeit (jedoch auch vor oder nach der Infektion mit dem defekten Adenovirus-Vektor) wird der Induktor der induzierbaren Promotoren der zweiten genetischen Einheit, die in der Zelle vorliegt, zugegeben oder deren Expression innerhalb der Zelle induziert.To the Start production of helper-dependent adenovirus vector infecting the helper cell line with the helper-dependent adenovirus vector, in big Quantities to be produced, and in the meantime (however also before or after infection with the defective adenovirus vector) the inducer of the inducible promoters of the second genetic Unit present in the cell added or their expression induced within the cell.
Das Ergebnis eines solcher Aktion wird die Produktion der adenoviralen Proteine, die von den frühen Bereichen, die in der zweiten genetischen Einheit eingeschlossen sind, codiert werden, sein, was die Aktivierung der transkriptionalen Kaskade von Adenoviren, welche mit der ITR-vermittelten Replikation der ersten genetischen Einheit assoziiert ist, mit sich bringt.The Result of such an action will be the production of the adenoviral Proteins from the early Areas included in the second genetic unit are, be coded, what the activation of the transcriptional Cascade of adenoviruses implicated in ITR-mediated replication associated with the first genetic unit.
Die Folge dieser koordinierten Reihe von Ereignissen ist die Anhäufung großer Mengen Strukturproteine des Virus, ähnlich der, welche während der natürlichen Infektion auftritt. Die viralen Proteine werden bei der Konstruktion des viralen Partikels festgehalten und führen folglich zur effizienten Produktion des helfer-abhängigen viralen Vektors.The The consequence of this coordinated series of events is the accumulation of large quantities Structural proteins of the virus, similar the one who during the natural one Infection occurs. The viral proteins are used in the construction of the viral particle and thus lead to efficient Production of the helper-dependent viral vector.
In diesem Zusammenhang sollte betont werden, dass für die Zwecke der vorliegenden Erfindung ein helfer-abhängiger Adenovirus-Vektor ein Adenovirus-Vektor ist, dessen Viruszyklus in Abwesenheit eines Helfers nicht vervollständigt werden kann, insbesondere ein Adenovirus-Vektor, bei dem das virale Genom vollständig oder teilweise deletiert wurde, mit Ausnahme des Verpackungssignals und der invertierten terminalen Repeats (ITRs). Für die Zwecke der vorliegenden Erfindung werden sie hier danach und zuvor als helfer-abhängiges Adenovirus oder helfer-abhängige Adenovirus-Virionen bezeichnet.In this regard, it should be emphasized that for the purposes of the present invention, a helper-dependent adenovirus vector is an adenovirus vector whose viral cycle can not be completed in the absence of a helper, particularly an adenovirus vector in which the viral genome is complete or partially deleted, with Exception of the packaging signal and the inverted terminal repeats (ITRs). For the purposes of the present invention they are referred to hereafter and previously as helper-dependent adenovirus or helper-dependent adenovirus virions.
Im Wesentlichen zielt diese Strategie auf die Nachbildung des Phänomens der viralen Latenz ab; in der Helferzelle wird ein virales Genom durch Suppression der Expression von Genen, welche der Adenovirus-Transkriptionskaskade zugrunde liegen, in einer latenten Phase gehalten. Zum Zeitpunkt der Infektion/Transformation mit dem defekten Adenovirus-Vektor, welcher produziert werden soll, wird die lytische Phase aktiviert durch Induktion der Expression der Proteine, welche von den frühen Genen codiert werden, die von dem Ad-Genom, das in der ersten genetischen Einheit eingeschlossen ist, deletiert und unter die strenge Transkriptionskontrolle in der zweiten genetischen Einheit gestellt wurden.in the Essentially, this strategy aims to replicate the phenomenon of viral latency; in the helper cell, a viral genome gets through Suppression of expression of genes encoding the adenovirus transcription cascade underlying, held in a latent phase. At the time infection / transformation with the defective adenovirus vector that produces is to be activated, the lytic phase is activated by induction of Expression of Proteins Encoded by the Early Genes from the ad genome, which is included in the first genetic unit, deleted and under the strict transcriptional control in the second genetic Unit were made.
Das vorher latente Adenovirus-Genom, das in der ersten genetischen Einheit eingeschlossen ist, tritt deshalb in die aktive Replikation und Transkription ein, jedoch nur der helfer-abhängige Vektor, welcher produziert werden soll, wird verpackt, da nur er ein funktionelles Verpackungssignal besitzt.The previously latent adenovirus genome present in the first genetic unit is therefore involved in active replication and Transcription, but only the helper-dependent vector that produces is to be packed, since only he is a functional packaging signal has.
Als Konsequenz der Tatsache, dass das System, welches Gegenstand der vorliegenden Erfindung ist, zwei anstelle von drei Elementen einschließt, ist die Produktion des helferabhängigen Adenovirus-Vektors stark erleichtert, welches nach einer Präparation in großem Maßstab eine Endausbeute von Titerniveaus zwischen 109 und 1012 Partikel/Milliliter erlaubt.As a consequence of the fact that the system object of the present invention includes two instead of three elements, the production of the helper-dependent adenovirus vector is greatly facilitated, which after a large scale preparation yields a final yield of titer levels between 10 9 and 10 12 particles / milliliter allowed.
Eine solche Eigenschaft der Zelllinien der vorliegenden Erfindung ist insbesondere relevant, wenn sie in großmaßstäblichen Produktionen wie denjenigen der pharmazeutischen Industrie eingesetzt werden. Dementsprechend erlaubt die vorliegende Erfindung eine verbesserte Produktion der Vektoren, welche therapeutische Gene, geeignet zur Behandlung von menschlichen oder tiermedizinischen Erkrankungen, transferieren.A such property of the cell lines of the present invention particularly relevant when used in large-scale productions such as those used in the pharmaceutical industry. Accordingly the present invention allows for improved production of the vectors, which therapeutic genes suitable for the treatment of human or veterinary diseases.
In jedem Fall ist anzumerken, dass die beiden genetischen Einheiten zu unterschiedlichen Zeiten in die Zelle eingeführt werden können. Dementsprechend werden Zelllinien offenbart, welche mindestens nur die erste genetische Einheit enthalten, und Zelllinien, welche mindestens nur die zweite genetische Einheit enthalten. Die zweite genetische Einheit im ersten Fall und die erste genetische Einheit im zweiten Fall können in der Tat vor oder gleichzeitig mit der Transfektion der Zelle durch den helfer-abhängigen Adenovirus-Vektor hinzugefügt werden.In In any case, it should be noted that the two genetic units can be introduced into the cell at different times. Accordingly Cell lines are disclosed which are at least only the first genetic Contain unit, and cell lines, which are at least only the second contain genetic unit. The second genetic unit in the first Case and the first genetic unit in the second case can be found in indeed before or simultaneously with the transfection of the cell the helper-dependent Added adenovirus vector become.
In Verbindung mit dem oben und im folgenden offenbarten Gegenstand der vorliegenden Erfindung sind deshalb die Zellen, welche zur Produktion von helfer-abhängigen Adenovirus-Vektoren geeignet sind, dadurch gekennzeichnet, dass sie mindestens eine der folgenden genetischen Einheiten einschließen:
- – eine erste genetische Einheit, umfassend ein defektes Adenovirus-Genom, bei dem die invertierten terminalen Repeats in einer Kopf-zu-Schwanz-Konfiguration vorliegen und bei dem sowohl das Verpackungssignal als auch mindestens einer der nicht-strukturellen Bereiche inaktiviert sind;
- – eine zweite genetische Einheit, umfassend mindestens einen induzierbaren Promotor und mindestens einen der in der ersten genetischen Einheit inaktivierten Bereiche, wobei die Bereiche unter der Kontrolle des induzierbaren Promotors stehen;
- A first genetic unit comprising a defective adenovirus genome in which the inverted terminal repeats are in a head-to-tail configuration and in which both the packaging signal and at least one of the non-structural regions are inactivated;
- A second genetic unit comprising at least one inducible promoter and at least one of the regions inactivated in the first genetic unit, said regions being under the control of the inducible promoter;
Weitere Gegenstände der vorliegenden Erfindung sind die oben beschriebenen Zellen, worin die erste genetische Einheit in das Genom integriert ist und die ITRs auf beiden Enden der ersten genetischen Einheit in einer Kopf-Schwanz-Konfiguration vorliegen; die oben beschriebenen Zellen, worin die erste genetische Einheit in einer episomalen Einheit eingeschlossen ist, die ein Element umfasst, welches die Replikation der genetischen Einheit in einer geringen Kopienzahl ermöglicht. Im letzteren Fall sind spezielle Fälle Zellen, in denen das Element, welches die Replikation der episomalen Einheit ermöglicht, der Replikationsursprung des Ursprungs des Replikationssystems eines Virus ist oder davon abgeleitet ist; der Fall, in dem der relevante Aktivierungsfaktor von außerhalb der Zelle in die Zelle eingeführt wird; die Fälle, in denen das Gen, welches für den Aktivierungsfaktor codiert, sich auf der episomalen Einheit befindet oder in einer anderen transkriptionalen Einheit innerhalb der Zelle oder alternativ in das Genom der Wirtszelle integriert ist.Further objects The present invention relates to the cells described above, wherein the first genetic unit is integrated into the genome and the ITRs present at both ends of the first genetic unit in a head-tail configuration; the cells described above, wherein the first genetic unit enclosed in an episomal unit that is an element which involves the replication of the genetic unit in one low copy number allows. In the latter case, special cases are cells in which the element, which allows the replication of the episomal unit, the Replication origin of the replication system origin Virus is or is derived from it; the case where the relevant Activation factor from outside the cell is introduced into the cell becomes; the cases in which the gene, which for encodes the activation factor located on the episomal unit or in another transcriptional unit within the cell or alternatively integrated into the genome of the host cell.
Der oben beschriebene Ursprung des Replikationssystems kann derjenige des Epstein-Barr-Virus (EBV) sein und der Ursprung des Replikationselements ist OriP und der Aktivierungsfaktor ist EBNA-1.Of the The origin of the replication system described above may be that of Epstein-Barr virus (EBV) and the origin of the replication element is OriP and the activation factor is EBNA-1.
Weitere spezielle Fälle in Bezug auf jeden Fall oben sind die folgenden: der Fall, in dem das Verpackungssignal und/oder die nicht-strukturellen Bereiche der ersten genetischen Einheit vollständig oder partiell deletiert sind; der Fall, in dem die Bereiche, welche in der ersten genetischen Einheit inaktiviert sind und in der zweiten genetischen Einheit vorliegen, mindestens einen der frühen Bereiche darstellen, welche aus der Gruppe, die aus E1-, E2A-, E2B und E4-Bereichen besteht, ausgewählt sind, spezieller der Fall, in dem die Bereiche E1 und E4 sind, der Fall, in dem die Bereiche E1, E4 und E2A sind, der Fall, in dem die Bereiche E1, E4 und E2B-Polymerase sind, und der Fall, in dem die Bereiche E1, E4 und präterminales E2B-Protein (PTP) sind.Other specific cases with respect to each case above are the following: the case where the packaging signal and / or the non-structural Areas of the first genetic unit are completely or partially deleted; the case where the regions inactivated in the first genetic entity and present in the second genetic entity represent at least one of the early regions consisting of the group consisting of E1, E2A, E2B and E4 regions More specifically, the case where the regions are E1 and E4 are the case where the regions are E1, E4 and E2A, the case where the regions are E1, E4 and E2B polymerase, and the case in which are the regions E1, E4 and preterminal E2B protein (PTP).
Weitere Fälle sind diejenigen, in denen die viralen Bereiche, welche in der ersten genetischen Einheit vorliegen, funktionsfähig mit mindestens einem regulatorischen Element verknüpft sind, welches die strenge Kontrolle ihrer Expression ermöglicht; Zellen, in denen es sich bei dem Promotor auf der zweiten genetischen Einheit speziell um den Tetracyclin-Operator, die Promotoren, welche von Steroidhormon-Rezeptoren reguliert werden, den Promotor, welcher von dem Ecdyson-Rezeptor reguliert wird, den von Rapamycin regulierten Promotor, den von RU486 regulierten Promotor und den von Metallionen regulierten Metallothionein-Promotor handelt; in diesen Fällen werden die relevanten Induktoren von Tetracyclin, Ecdyson, Rapamycin, Dexamethason RU486 bzw. einem Schwermetall wie Zn oder Cd gebildet; Zellen, in denen die viralen Bereiche in der zweiten genetischen Einheit funktionsfähig mit Elementen verknüpft sind, welche die Expression der darauf befindlichen nicht-strukturellen Bereiche steuern, und insbesondere der Fall, in dem solche Elemente auf Tetracyclin ansprechende Transaktivatoren und/oder Silencer sind; die Zellen, in denen mindestens einer der nicht-strukturellen Bereiche in der zweiten genetischen Einheit vollständig oder teilweise von einem Adenovirus-Genom, vorzugsweise Human-Adenovirus, insbesondere Adenoviren der Serotypen AD2 oder AD5, abgeleitet ist. In diesen letzteren Fällen können die unterschiedlichen Abschnitte der nicht-strukturellen Bereiche, die auf der zweiten genetischen Einheit vorliegen, von Adenoviren des gleichen Serotyps oder von Adenoviren eines unterschiedlichen Serotyps stammen.Further Cases are those in which the viral areas, which in the first genetic unit, functional with at least one regulatory Linked item which allows the strict control of their expression; Cells in which the promoter on the second genetic Unit specifically for the tetracycline operator, the promoters of which Steroid hormone receptors are regulated, the promoter from the ecdysone receptor regulated by rapamycin Promoter, RU486 regulated promoter and metal ions regulated metallothionein promoter is; in these cases will be the relevant inducers of tetracycline, ecdysone, rapamycin, dexamethasone RU486 or a heavy metal such as Zn or Cd formed; Cells, in which the viral areas in the second genetic unit are functional with Linked elements which are the expression of the non-structural Control areas, and in particular the case in which such elements Tetracycline-responsive transactivators and / or silencers are; the cells in which at least one of the non-structural Areas in the second genetic unit complete or in part from an adenovirus genome, preferably human adenovirus, in particular Adenoviruses of serotypes AD2 or AD5. In these latter cases can the different sections of the non-structural areas, present on the second genetic unit, of adenoviruses of the same serotype or of adenoviruses of a different one Serotype originate.
Weitere Fälle von Interesse sind die Zellen, in denen das Adenovirus-Genom der ersten genetischen Einheit vollständig oder teilweise von dem Adenovirus-Genom von Säuger-Adenoviren abgeleitet ist, vorzugsweise Human-Adenoviren, bevorzugt eines Adenovirus des Serotyps AD2 und AD5. In diesen letzteren Fällen können die unterschiedlichen Abschnitte des Adenovirus-Genoms, die auf der ersten genetischen Einheit vorliegen, von Adenoviren des gleichen Serotyps oder von Adenoviren eines unterschiedlichen Serotyps stammen.Further Cases of Interest are the cells in which the adenovirus genome of the first complete genetic unit or is derived in part from the adenovirus genome of mammalian adenoviruses, preferably Human adenoviruses, preferably adenovirus of the serotype AD2 and AD5. In these latter cases can the different sections of the adenovirus genome on of the first genetic unit, of adenoviruses of the same Serotype or from adenoviruses of a different serotype.
Die genetischen Einheiten der vorliegenden Erfindung können in mindestens einem Vektor, vorzugsweise einem Plasmid, das/der in episomaler Phase gehalten wird oder nicht, in die Zellen eingeführt werden; sowohl in dem Fall, in dem sie in das Wirtsgenom integriert werden, als auch in dem Fall, in dem sie auf einer replizierenden Einheit innerhalb der Zelle vorliegen, können solche ersten und zweiten genetischen Einheiten funktionsfähig mit genomischen Sequenzen, welche die Expression der Funktionen, die von mindestens einer der Einheiten codiert werden, in regulierter Weise sicherstellen, verknüpft sein.The Genetic units of the present invention can be used in at least one vector, preferably a plasmid, which in held in the episomal phase or not, are introduced into the cells; both in the case where they are integrated into the host genome, as well as in the case where they are on a replicating unit within the cell such first and second genetic units are functional with genomic sequences encoding the expression of the functions are coded by at least one of the units, in regulated Make sure you're linked be.
Ferner können alle oben beschriebenen Zellen eukaryotische Zellen sein, vorzugsweise Säugerzellen, bevorzugt humane Zellen, und in diesem letzteren Fall auch vorzugsweise Zellen, welche die Adenovirus-Replikation gestatten. Insbesondere ist die Zelllinie A549 (Human-Lungenkarzinom ATCC CLL 185) für die Ableitung der Zellen der vorliegenden Erfindung geeignet.Further can all cells described above are eukaryotic cells, preferably Mammalian cells, preferably human cells, and in this latter case also preferably Cells that allow adenovirus replication. Especially is the cell line A549 (human lung carcinoma ATCC CLL 185) for the derivative the cells of the present invention.
Ebenfalls offenbart ist ein Verfahren zur Produktion der obengenannten Zellen, welches die vorliegenden Schritte umfasst:
- a) Einführen der ersten genetischen Einheit wie oben beschrieben in eine Zelllinie;
- b) Einführen der zweiten genetischen Einheit wie oben beschrieben in die Zelllinie von Schritt a).
- a) introducing the first genetic unit into a cell line as described above;
- b) introducing the second genetic unit into the cell line of step a) as described above.
Spezielle Fälle werden repräsentiert durch ein solches Verfahren, in dem die erste genetische Einheit von Schritt a) und die zweite genetische Einheit von Schritt b) in einem Plasmid- oder Virusvektor eingeführt werden. Speziell bezüglich der Plasmidvektoren, welche für die vorliegende Erfindung geeignet sind, kommen Klonierungsvektoren wie pUC, pBluescript und pLitmus in Betracht.Specific Cases become represents by such a procedure, in which the first genetic unit of step a) and the second genetic unit of step b) in a plasmid or virus vector. Especially regarding the Plasmid vectors, which for the present invention are suitable, come cloning vectors such as pUC, pBluescript and pLitmus into consideration.
Speziell bezüglich der viralen Vektoren, welche für die vorliegende Erfindung geeignet sind, kommen retrovirale Vektoren, adeno-assoziierte virale Vektoren, Herpes simplex-Vektoren und vom Epstein-Barr-Virus abgeleitete Vektoren in Betracht.specially in terms of of the viral vectors, which for the present invention are suitable, there are retroviral vectors, adeno-associated viral vectors, herpes simplex vectors and from Epstein-Barr virus derived vectors.
Auch solche Verfahren können vorzugsweise mit einer eukaryotischen Zelllinie von Säugern durchgeführt werden, vorzugsweise mit einer humanen Zelllinie und bevorzugt mit der Zelllinie A549 (Human-Lungenkarzinom ATCC CLL 185).Also such methods can preferably be carried out with a mammalian eukaryotic cell line, preferably with a human cell line and preferably with the cell line A549 (human lung carcinoma ATCC CLL 185).
Ebenfalls offenbart ist die Verwendung der obengenannten Zellen zur Produktion von helferabhängigen adenoviralen Vektoren oder der Zelllinie A549 (Human-Lungenkarzinom ATCC CLL 185), sowohl in vivo als auch in vitro.Also discloses the use of the above cells for production of helper-dependent adenoviral vectors or the cell line A549 (human lung carcinoma ATCC CLL 185), both in vivo and in vitro.
Ebenfalls offenbart ist die Verwendung der obengenannten Zellen zur Produktion der helferabhängigen Adenovirus-Vektoren gemäß einer im Stand der Technik bekannten Technik.Also disclosed is the use of the above cells to produce the helferab pending adenovirus vectors according to a technique known in the art.
Solche helfer-abhängigen Adenovirus-Vektoren sollen mindestens ein Gen enthalten, welches vorzugsweise ein Gen von therapeutischem Interesse sein kann, dessen Produkte insbesondere für die Gentherapie von Nutzen sind, speziell gerichtet gegen humane oder veterinärmedizinische Erkrankungen. Spezielle Fälle sind die folgenden, bei denen die helfer-abhängigen Adenovirus-Vektoren mindestens ein Gen von Interesse bei gentechnischen Verfahren oder bei Verfahren zur Herstellung transgener Tiere einschließen; der Fall, in dem die Produkte der Aktivität des Gens Peptide oder Ribozyme sind.Such helper dependent Adenovirus vectors should contain at least one gene, which preferably may be a gene of therapeutic interest, its products especially for the gene therapy are useful, especially directed against human or veterinary Diseases. Special cases are the following where the helper-dependent adenovirus vectors at least one gene of interest in genetic engineering or in methods of producing transgenic animals; of the Case in which the products of the activity of the gene peptides or ribozymes are.
Ein weiterer Gegenstand der vorliegenden Erfindung sind Zusammensetzungen, welche die zuvor beschriebene Zelle und ein Vehikel oder einen Träger umfassen, dadurch gekennzeichnet, dass die Zusammensetzung 99 % bis 100 % frei von Helferviren ist.One Another object of the present invention are compositions, which comprise the previously described cell and a vehicle or a carrier, characterized in that the composition is 99% to 100% is free of helper viruses.
Zusammensetzungen, welche ein Vehikel oder einen Träger und eine der oben beschriebenen Zellen umfassen, wobei die Zellen die ersten und zweiten genetischen Einheiten und den helfer-abhängigen Adenovirus-Vektor enthalten, sind ein Gegenstand der vorliegenden Erfindung. Ein solches Vehikel oder ein solcher Träger kann Wasser, Glycerin, Ethanol, Salzlösung oder dgl. oder Kombinationen davon sein.compositions which a vehicle or a carrier and one of the cells described above, wherein the cells the first and second genetic units and the helper-dependent adenovirus vector are included, are an object of the present invention. Such a vehicle or such a carrier may be water, glycerin, ethanol, saline or the like or combinations be of it.
Besonders relevante Fälle sind diejenigen, in denen das Vehikel oder der Träger in allen diesen Zusammensetzungen mit dem aktiven Wirkungsprinzip, welches der oben genannte helfer-abhängige Adenovirus-Vektor und eine der oben beschriebenen Zellen darstellen, pharmazeutisch annehmbar und kompatibel ist. Pharmazeutisch annehmbare Träger sind die im Stand der Technik wohlbekannten, d.h. sterile wässrige Lösungen, welche das aktive Wirkungsprinzip enthalten können oder ferner Puffer, wie z.B. Natriumphosphat bei einem physiologischen pH-Wert und/oder eine physiologische Salzlösung, wie z.B. phosphatgepufferte Salzlösung, einschließen können. Darüber hinaus können andere Exzipienten, wie z.B. ein Benetzungsmittel oder Emulgator, lösungsförderndes Mittel, pH-Pufferungsmittel, Stabilisatoren und Färbemittel oder dgl. oder irgendein anderes im Stand der Technik bekanntes Additiv, in solchen Zusammensetzungen eingeschlossen sein.Especially relevant cases are those in which the vehicle or vehicle in all these compositions with the active principle of action, which the above helper-dependent Adenovirus vector and one of the cells described above, is pharmaceutically acceptable and compatible. Pharmaceutically acceptable carrier are well known in the art, i. sterile aqueous solutions, which may contain the active principle or also buffers, such as e.g. Sodium phosphate at a physiological pH and / or a physiological saline solution, such as. phosphate buffered saline. Furthermore can other excipients, e.g. a wetting agent or emulsifier, promoting solution Agents, pH buffering agents, stabilizers and colorants or the like or any other known in the art Additive to be included in such compositions.
In diesem Zusammenhang beziehen sich pharmazeutisch annehmbare oder kompatible Träger oder Vehikel auf die Materialien, welche im Stand der Technik dafür bekannt sind, zur Verabreichung an oder auf ein Individuum, beispielsweise einen Säuger, insbesondere einen Menschen, ohne Hervorrufung einer unerwünschten physiologischen Wirkung geeignet zu sein. Beispiele solcher Wirkungen sind Übelkeit, Magenverstimmung, Schwindel und dgl.In In this context, pharmaceutically acceptable or compatible carriers or Vehicle to the materials known in the art for administration to or on an individual, for example a mammal, especially a human, without causing an undesirable physiological effect to be suitable. Examples of such effects are nausea, Upset stomach, dizziness and the like.
Die Herstellung solcher Zusammensetzungen, welche pharmazeutische oder pharmakologische Zusammensetzungen sein können, in denen die aktiven Wirkungsprinzipien gelöst oder dispergiert sind, ist im Stand der Technik wohlbekannt. Im Allgemeinen werden solche Zusammensetzungen für die parenterale Verabreichung hergestellt oder in jedem Fall als injizierbare Zusammensetzungen, entweder als flüssige Lösungen oder Suspension. In jedem Fall können feste Formen, geeignet für Lösungen oder Suspension in Flüssigkeit vor der Verwendung, hergestellt werden. Präparationen, die für andere gewünschte Verabreichungswege gemäß im Stand der Technik wohlbekannten Verfahren geeignet sind, wie z.B. die orale Route, dermale Pflaster, Zäpfchen oder auch eine emulgierte Präparation, sind in der vorliegenden Erfindung eingeschlossen.The Preparation of such compositions, which pharmaceutical or may be pharmacological compositions in which the active Action principles solved or dispersed, is well known in the art. In general such compositions are for parenteral administration or in any case as injectable compositions, either as liquid solutions or suspension. In any case, you can solid forms, suitable for solutions or suspension in liquid before use. Preparations for others desired Routes of administration according to Stand techniques well known in the art, e.g. the oral route, dermal plasters, suppositories or also an emulsified preparation included in the present invention.
Spezielle Fälle stellen die Zusammensetzungen dar, welche den helfer-abhängigen Adenovirus-Vektor oder mindestens eine der Zellen der vorliegenden Erfindung, die helfer-abhängige Adenovirus-Vektoren einschließen, enthalten, umfassend mindestens ein Gen, das für Moleküle von therapeutischem Interesse codiert, Moleküle, welche auch Peptide oder Ribozyme sein können, insbesondere von Nutzen in der Gentherapie, spezieller gegen menschliche Erkrankungen gerichtet.Specific Ask cases the compositions containing the helper-dependent adenovirus vector or at least one of the cells of the present invention, the helper-dependent adenovirus vectors lock in, containing at least one gene suitable for molecules of therapeutic interest encoded, molecules, which may also be peptides or ribozymes, in particular of use in gene therapy, more specifically directed against human diseases.
Ebenfalls offenbart ist die Verwendung der Zellen der vorliegenden Erfindung als Medikament und insbesondere zur Herstellung der obengenannten Zusammensetzungen, insbesondere für pharmazeutische oder pharmakologische Zusammensetzungen, welche für die Gentherapie geeignet sind.Also discloses the use of the cells of the present invention as a medicament and in particular for the production of the abovementioned Compositions, in particular for pharmaceutical or pharmacological Compositions suitable for the gene therapy are suitable.
Ebenfalls offenbart ist das Verfahren zur Herstellung mindestens einer der oben beschriebenen Zusammensetzungen, welche pharmazeutische Zusammensetzungen oder Materialzusammensetzungen sein können.Also discloses the process for producing at least one of compositions described above, which are pharmaceutical compositions or material compositions.
Ebenfalls offenbart sind Kits, umfassend mindestens eine der oben beschriebenen Zusammensetzungen zur Produktion der helfer-abhängigen Adenovirus-Vektoren gemäß der vorliegenden Erfindung in vitro, in vivo oder ex vivo. Von speziellem Interesse ist der Kit, welcher umfasst:
- – eine Zusammensetzung, umfassend mindestens eine oder oben beschriebenen Zellen, einschließlich einer ersten genetischen Einheit, einer zweiten genetischen Einheit und eines helfer-abhängigen Adenovirus-Vektors;
- – eine Zusammensetzung, umfassend einen Induktor, welcher zur Aktivierung des induzierbaren Promotors in der zweiten genetischen Einheit in der Lage ist.
- A composition comprising at least one or above-described cells, including a first genetic unit, a second genetic unit and a helper-dependent adenovirus vector;
- A composition comprising an inducer which is capable of activating the inducible promoter in the second genetic unit.
Von besonderem Interesse ist auch der Fall, in dem der Kit einschließt:
- – eine Zusammensetzung, umfassend mindestens eine der oben beschriebenen Zellen, einschließlich einer ersten genetischen Einheit und einer zweiten genetischen Einheit;
- – eine Zusammensetzung, umfassend mindestens einen helfer-abhängigen Adenovirus-Vektor, einschließlich eines heterologen Gens, insbesondere von therapeutischem Interesse; und gegebenenfalls
- – eine Zusammensetzung, umfassend einen Induktor, welcher zur Aktivierung des induzierbaren Promotors in der zweiten genetischen Einheit in der Lage ist.
- A composition comprising at least one of the cells described above, including a first genetic unit and a second genetic unit;
- A composition comprising at least one helper-dependent adenovirus vector, including a heterologous gene, in particular of therapeutic interest; and optionally
- A composition comprising an inducer which is capable of activating the inducible promoter in the second genetic unit.
Die hier offenbarten Kits können ein Kit für die therapeutische Verwendung (Produktion in vivo oder ex vivo des helfer-abhängigen Adenovirus-Vektors, der mindestens ein Gen von therapeutischem Interesse, insbesondere in der Gentherapie, umfasst) und ein Kit zur Produktion in vitro eines helfer-abhängigen Adenovirus-Vektors, der mindestens ein Gen, vorzugsweise von therapeutischem Interesse, enthält, sein.The Kits disclosed herein may a kit for the therapeutic use (production in vivo or ex vivo of the helper-dependent adenovirus vector, the at least one gene of therapeutic interest, in particular in gene therapy) and a kit for in vitro production a helper-dependent Adenovirus vector containing at least one gene, preferably of therapeutic Interest, contains, be.
Die Erfindung wird mit Hilfe der als Anhang beigefügten Figuren näher beschrieben werden.The The invention will be described in more detail with the aid of the appended figures become.
Beschreibung der FigurenDescription of the figures
- A) Karte des AD5-Shuttle-Vektors (erste genetische Einheit): Ad5ΔΨΔE1/E4 repräsentiert das Genom eines humanen Adenovirus, vollständig mit Ausnahme der Deletion der E1-, E4-Bereiche und desjenigen, der das Verpackungssignal einschließt (Ψ); AdITRs repräsentieren die Ad5-ITR-Gensequenzen in Kopf-Schwanz-Konfiguration; Hygror repräsentiert das Hygromycinresistenzgen; Ampr das Ampicillinresistenzgen; EBNA-1 den viralen Transaktivator des Epstein-Barr-Virus (EBV) und OriP repräsentiert den Ursprung der latenten Replikation des EBV-Virus.
- B) Karte des E1/E4-Vektors (zweite genetische Einheit): wobei E1 und E4 DNA-Sequenzen repräsentieren, die den E1- und E4-Adenovirus-Bereichen entsprechen, MSC I und II Sequenzen sind, welche Mehrfachklonierungsstellen einschließen; PminCMV die minimalen Promotoren des Cytomegalovirus (CMV) sind, TRE (Tetracyclin-Response-Element) sieben wiederholte Sequenzen des Operators des E. coli-Tetracyclinresistenzgens repräsentiert; β-Globin-polyA die Polyadenylierungsstelle des β-Globins ist; ColE1ori der Replikationsursprung von E. coli ist; SV40-polyA die SV40-Virus-Polyadenylierungsstelle ist.
- C) Karte des pTet-On/Off-Vektors (regulatorisches Element): wobei Pcmv und Psv40 die Promotoren von CMV bzw. SV40 sind, (r)tTa den steuerbaren Transaktivator von Tetracyclin (oder den invertierten, d.h., denjenigen, der nur von einem Tetracyclin aktiviert wird) anzeigt. Dieser Transaktivator besteht wiederum aus dem Gen, welches für den Tetracyclin-Repressor (oder dessen Mutante rtetR der entgegengesetzten Funktion) in Fusion mit der VP16AD-Domäne des Herpes-simplex-Virus codiert. Neor repräsentiert das Neomycinresistenzgen.
- D) Karte des pTet-KRAB-Vektors (regulatorisches Element): im wesentlichen ähnlich dem pTet-On/Off-Vektor, wobei die für die VP16AD-Domäne des Herpes-simplex-Virus codierenden Sequenzen durch diejenigen der KRAB-Domäne des humanen Kox-Gens ersetzt sind.
- A) Map of the AD5 shuttle vector (first genetic unit): Ad5ΔΨΔE1 / E4 represents the genome of a human adenovirus, with the exception of the deletion of the E1, E4 regions and the one that includes the packaging signal (Ψ); AdITRs represent the Ad5 ITR gene sequences in the head-tail configuration; Hygro r represents the hygromycin resistance gene; Amp r the ampicillin resistance gene; EBNA-1 is the viral transactivator of Epstein-Barr virus (EBV) and OriP represents the origin of latent replication of the EBV virus.
- B) Map of the E1 / E4 vector (second genetic unit): wherein E1 and E4 represent DNA sequences corresponding to the E1 and E4 adenovirus regions, MSC I and II are sequences which include multiple cloning sites; PminCMV are the minimal promoters of cytomegalovirus (CMV), TRE (tetracycline response element) represents seven repeated sequences of the operator of the E. coli tetracycline resistance gene; β-globin-polyA is the polyadenylation site of β-globin; ColE1ori is the replication origin of E. coli; SV40 polyA is the SV40 virus polyadenylation site.
- C) map of the pTet-on / off vector (regulatory element): where Pcmv and Psv40 are the promoters of CMV and SV40, respectively (r) tTa the controllable transactivator of tetracycline (or the inverted, ie, the only of a tetracycline is activated). This transactivator again consists of the gene encoding the tetracycline repressor (or its mutant rtetR of opposite function) in fusion with the VP16AD domain of the herpes simplex virus. Neo r represents the neomycin resistance gene.
- D) Map of the pTet-KRAB vector (regulatory element): substantially similar to the pTet-on / off vector, wherein the sequences coding for the VP16AD domain of the herpes simplex virus are characterized by those of the KRAB domain of the human Kox Gene are replaced.
- A) Karte des AD/EBV-Shuttle-Vektors pSA-1 (erste genetische Einheit): Ad5 repräsentiert das Genom eines humanen Adenovirus, vollständig mit Ausnahme der Deletion der E1-, E4-Bereiche und desjenigen, der das Verpackungssignal einschließt (Ψ); AdITRs repräsentieren die Ad5-ITR-Gensequenzen in Kopf-Schwanz-Konfiguration: Hygror repräsentiert das Hygromycinresistenzgen; Ampr repräsentiert das Ampicillinresistenzgen; OriP repräsentiert den Ursprung der latenten Replikation des EBV-Virus; Tet-Eptamer repräsentiert ein Eptamer von Tetracyclin-Repressor-DNA-Bindungsstellen. Die DNA-Sequenzen, welche deletiert wurden, um eine unterschiedliche ΔE2-Version dieses Vektors zu erzeugen, sind ebenfalls angegeben: DBP-Deletion repräsentiert die Deletion der gesamten codierenden Sequenz des DNA-bindenden Proteins; Polymerase-Deletion repräsentiert die Deletion von 608 bp innerhalb des Aminoterminus des Polymerasegens; pTP-Deletion repräsentiert die Deletion von zwei DNA-Segmenten innerhalb des Hauptexons des Gens des präterminalen Proteins.
- B) Karte des AD/EBV-Shuttle-Vektors pSA-2 (erste genetische Einheit), das einzige Element, welches pSA-2 von pSA-1 unterscheidet, ist die Insertion des EBNA-1-Gens neben dem OriP-Replikationsursprung.
- C) Karte von pIREStTS/rtTApuro (regulatorisches Element): wobei CMV-IE den "immediateearly"-Promotor des Human-Cytomegalovirus repräsentiert; rtTA DNA-Sequenzen repräsentiert, die dem reversen Tetracyclin-Transaktivator entsprechen; IRES die Sequenz ist, welche die interne Ribosomeneintrittsstelle einschließt; tTS-Kid die Sequenz repräsentiert, welche der Fusion zwischen dem tet-Repressor und einer Silencer-Domäne von Kid-1 entspricht; Kid-1-S-Domäne die Silencer-Domäne von Kid-1 ist; SV40-PuroR-polyA die Puromycinresistenzgen-Expressionskassette repräsentiert; Amp das Ampicillinresistenzgen ist.
- A) Map of the AD / EBV Shuttle Vector pSA-1 (First Genetic Unit): Ad5 represents the human adenovirus genome, with the exception of the deletion of the E1, E4 regions and the one including the packaging signal (Ψ) ; AdITRs represent the Ad5 ITR gene sequences in head-tail configuration: Hygro r represents the hygromycin resistance gene; Amp r represents the ampicillin resistance gene; OriP represents the origin of latent replication of the EBV virus; Tet-Eptamer represents an eptamer of tetracycline repressor DNA binding sites. The DNA sequences which have been deleted to produce a different ΔE2 version of this vector are also indicated: DBP deletion represents the deletion of the entire coding sequence of the DNA-binding protein; Polymerase deletion represents the deletion of 608 bp within the amino terminus of the polymerase gene; pTP deletion represents the deletion of two DNA segments within the major exon of the protein of the pre-terminal protein.
- B) Map of the AD / EBV shuttle vector pSA-2 (first genetic unit), the only element that distinguishes pSA-2 from pSA-1, is the insertion of the EBNA-1 gene next to the OriP origin of replication.
- C) Map of pIREStts / rtTApuro (regulatory element): where CMV-IE represents the "immediateearly" promoter of human cytomegalovirus; rtTA represents DNA sequences corresponding to the reverse tetracycline transactivator; IRES is the sequence that includes the internal ribosome entry site; tTS-Kid represents the sequence corresponding to the fusion between the tet repressor and a silencer domain of Kid-1; Kid-1-S domain the Silen cer domain of Kid-1; SV40 PuroR polyA represents the puromycin resistance gene expression cassette; Amp is the ampicillin resistance gene.
Detaillierte Beschreibung der Erfindungdetailed Description of the invention
Offenbart ist die Konstruktion und Verwendung der ersten genetischen Einheit wie in der Zusammenfassung der Erfindung beschrieben für die Ableitung der Helferzellen der vorliegenden Erfindung.Disclosed is the construction and use of the first genetic unit as described in the summary of the invention for the derivation the helper cells of the present invention.
Die erste genetische Einheit kann als Plasmidvektor durch Anwendung der rekombinanten DNA-Standardtechniken konstruiert werden. Eine Modifizierung (Insertionen, Deletionen, Mutation) der ersten genetischen Einheit kann nach dem von A. F. Stuart und Mitarbeitern (Zhang et al., Nat. Genet. 1998; 20:123-126) beschriebenen Verfahren erhalten werden.The first genetic unit can be applied as a plasmid vector of standard recombinant DNA techniques. A modification (Insertions, deletions, mutation) of the first genetic unit can be prepared according to the method described by A.F. Stuart and coworkers (Zhang et al., Nat. Genet. 1998; 20: 123-126).
Die erste genetische Einheit, wenn sie in das Genom der Wirtszelle integriert ist, umfasst typischerweise:
- i) ein Adenovirus-Genom, vollständig mit Ausnahme der Deletion von mindestens einem der nicht-strukturellen Bereiche, welche für den Ablauf der Adenovirus-Transkriptionskaskade essentiell sind, und desjenigen, der das Verpackungssignal einschließt;
- ii) zwei Sequenzen von invertierten terminalen Repeats von Ad (ITRs) in einer Kopf-zu-Schwanz-Konfiguration, welche das Adenovirus-Genom flankieren; und im Allgemeinen ist auch
- iii) ein Selektionsmarker, wie z.B. ein G418-Resistenzgen, Hygromycin B-Resistenzgen, Puromycinresistenzgen, Bleomycinresistenzgen, vorhanden, der zur Selektion einer Zelllinie, welche die Einheit stabil aufrechterhält, verwendet werden kann.
- i) an adenovirus genome, with the sole exception of the deletion of at least one of the non-structural regions essential for the course of the adenovirus transcription cascade and the one involving the packaging signal;
- ii) two sequences of inverted terminal repeats of Ad (ITRs) in a head-to-tail configuration flanking the adenovirus genome; and in general, too
- iii) a selection marker such as a G418 resistance gene, hygromycin B resistance gene, puromycin resistance gene, bleomycin resistance gene present, which can be used to select a cell line which stably maintains the unit.
Zelllinien, welche die erste genetische Einheit in das Wirtschromosom integriert enthalten, können durch Transformation der Zelle mit der Vektor-DNA unter Anwendung von Standard-DNA-Transfektionsverfahren und Kultivierung der transformierten Zellen in einem selektiven Medium (+ G418 oder Hygromycin B oder Bleomycin oder Puromycin) nach den im Stand der Technik bekannten einschlägigen Techniken erhalten werden.Cell lines which integrates the first genetic unit into the host chromosome can contain by transforming the cell with the vector DNA using of standard DNA transfection methods and culturing the transformed cells in a selective manner Medium (+ G418 or hygromycin B or bleomycin or puromycin) obtained by the techniques known in the art.
Die Transkription und Replikation eines Adenovirus-Vektors, der in das Wirtschromosom zwischen zwei ITR-Verbindungsstellen in einer Kopf-zu-Schwanz-Konfiguration inseriert ist, kann auch aktiviert werden durch Bereitstellung von deletierten viralen Faktoren und/oder der viralen Funktionen, die in dem Adenovirus-Genom inaktiviert wurden, in trans unter Einsatz von DNA-Transfektion oder Infektion mit viralen Vektoren oder direkter Einführung aktiver viraler Polypeptide.The Transcription and replication of an adenovirus vector inserted into the Host chromosome between two ITR junctions in a head-to-tail configuration can also be activated by providing deleted viral factors and / or viral functions, the in the adenovirus genome were inactivated in trans DNA transfection or infection with viral vectors or direct introduction active viral polypeptides.
In dem Fall, in dem die erste genetische Einheit stattdessen auf einer episomalen Einheit gehalten wird, wurde der für die Einführung der ersten genetischen Einheit verwendete Vektor als ein "Shuttle-Vektor" bezeichnet, wobei ein solcher Shuttle-Vektor ein Vektor (Plasmid oder Virus) in einer episomalen Form ist und so konstruiert wurde, dass er die im Punkt i) oben angegebenen Elemente einschließt, im allgemeinen die im Punkt iii) oben angegebenen Elemente, und ferner umfasst:
- iv) den Ursprung der latenten Replikation eines Virus und insbesondere des Epstein-Barr-Virus (EBV);
- v) die invertierten terminalen Repeats (ITRs) von Ad-Gensequenzen in einer Kopf-Schwanz-Konfiguration.
- iv) the origin of latent replication of a virus, and in particular Epstein-Barr virus (EBV);
- v) the inverted terminal repeats (ITRs) of Ad gene sequences in a head-to-tail configuration.
Der Vektor in diesem Fall wurde aufgrund der charakterisierenden Anwesenheit der EBV-Elemente als "Ad/EBV-Shuttle-Vektor" bezeichnet. In der Tat ist auch das für das Protein EBNA-1 codierende Gen eingeschlossen.Of the Vector in this case was due to the characterizing presence the EBV elements referred to as "Ad / EBV shuttle vector". In the Act is also for including the gene encoding EBNA-1 protein.
In einer bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors sind in dem Adenovirus-Genom des Punkts i) die E1- und E4-Gene deletiert und die Grundaktivität des E2-Promotors ist durch Insertion einer Tet-Silencer-Bindungsstelle in das virale Chromosom stromaufwärts des E2-Promotors verringert. In einer zweiten bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors sind in dem Adenovirus-Genom die E1- und E4-Gene und E2A-Gene deletiert. In einer dritten bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors sind in dem Adenovirus-Genom die E1- und E4-Gene und E2B-Gene deletiert.In a preferred embodiment of such a vector are the E1 and E4 genes in the adenovirus genome of item i) deleted and the basic activity of the E2 promoter is by insertion of a Tet-Silencer binding site into the viral chromosome upstream of the E2 promoter. In a second preferred embodiment of such a vector are the E1 and E4 genes in the adenovirus genome and deleted E2A genes. In a third preferred embodiment of such a vector in the adenovirus genome are the E1 and E4 genes and E2B genes deleted.
Ein wesentliches Charakteristikum eines solchen "Shuttle-Vektors" ist das Replikationsvermögen, welches eine hohe Kopienzahl pro Zelle reproduziert, sobald die Transkription der Ad-Gene aktiviert wurde. Dies wird ermöglicht durch die Anwesenheit der invertierten terminalen Repeats (ITRs) von Adenovirus in einer Kopf-Schwanz-Konfiguration in dem Konstrukt.One The essential characteristic of such a "shuttle vector" is its ability to replicate a high copy number per cell reproduced as soon as the transcription the ad genes were activated. This is made possible by the presence the inverted terminal repeats (ITRs) of adenovirus in one Head-tail configuration in the construct.
In einer bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors ist das Ad-Genom dasjenige des Serotyps Ad5, in einer zweiten bevorzugten Ausführungsform umfasst ein solcher Vektor das Genom des Serotyps Ad2. Kombinationen mit anderen Serotyp-Genomen oder irgendeinem anderen Mitglied der Adenoviridae-Familie sind möglich und könnten in einigen Anwendungen bevorzugt sein.In a preferred embodiment of such a vector, the Ad genome is that of the serotype Ad5, in a second preferred embodiment, such comprises Vector the genome of the serotype Ad2. Combinations with other serotype genomes or any other member of the Adenoviridae family possible and could be preferred in some applications.
In einer bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors sind die ITRs diejenigen des Serotyps Ad5. In einer weiteren bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors sind die ITRs diejenigen des Serotyps Ad2. Kombinationen mit ITRs anderer Serotypen oder irgendeines anderen Mitglieds der Adenoviridae-Familie sind möglich und könnten in einigen Ausführungsformen bevorzugt sein.In a preferred embodiment of such a vector, the ITRs are those of the serotype Ad5. In a further preferred embodiment In this form of vector, the ITRs are those of the serotype Ad2. Combinations with ITRs of other serotypes or any other member of the Adenoviridae family are possible and may be preferred in some embodiments.
Eukaryotische Zellen können mit der ersten genetischen Einheit nach Transfektionsprotokollen wie dem Calciumphosphat-Verfahren oder Lipofektion oder unter Anwendung von DNA-Mikroinjektion transformiert werden. Zellen, welche die erste genetische Einheit enthalten, können unter Ausnutzung der Anwesenheit eines Selektionsmarkers auf dem Episom durch Zugabe des entsprechenden Antibiotikums zu dem Kulturmedium selektioniert werden. Permissive Zellen, welche die erste genetische Einheit in episomaler Form enthalten, können in Anwesenheit der viralen Funktionen, welche in dem defekten Ad-Genom, welches in der ersten genetischen Einheit vorliegt, deletiert oder inaktiviert wurden, die Vermehrung eines Adenovirus fördern.eukaryotic Cells can with the first genetic unit after transfection protocols like the calcium phosphate method or lipofection or using be transformed by DNA microinjection. Cells, which the first contain genetic unit, taking advantage of the presence of a selection marker on the episome by adding the appropriate Antibiotics are selected to the culture medium. permissive Cells containing the first genetic unit in episomal form, can in the presence of the viral functions present in the defective Ad genome present in the first genetic unit is present, deleted or inactivated were to promote the propagation of an adenovirus.
Eine wie oben beschrieben erhaltene Zelllinie kann für die Insertion der zweiten genetischen Einheit, in welcher die in der ersten genetischen Einheit inaktivierten Adenovirus-Funktionen unter einer strengen transkriptionalen Kontrolle stehen, verwendet werden.A cell line obtained as described above can be used for the insertion of the second genetic unit, in which in the first genetic unit inactivated adenovirus functions under a strict transcriptional Control are used.
Die zweite genetische Einheit kann nach Standardverfahren rekombinanter DNA-Techniken, wie z.B. direkte Klonierung von DNA-Fragmenten, erhalten durch DNA-Verdauung mit Restriktionsenzymen, in Vektoren, PCR oder durch homologe Rekombinationstechnik in E. coli oder eukaryotischen Zellen erhalten werden.The second genetic unit can be recombinant by standard methods DNA techniques, e.g. direct cloning of DNA fragments obtained by DNA digestion with restriction enzymes, in vectors, PCR or by homologous recombination technique in E. coli or eukaryotic Cells are obtained.
Die zur Einführung der zweiten genetischen Einheit verwendeten relevanten Vektoren enthalten dementsprechend als charakterisierende Elemente:
- I) die Nicht-Strukturbereiche, die in dem Adenovirus-Genom der ersten genetischen Einheit inaktiviert wurden, integriert in das Genom der Wirtszelle oder in einem "Shuttle-Vektor" vorliegend;
- II) einen induzierbaren Promotor, der streng regulierbar sein kann; und gegebenenfalls
- III) zwei Dimere von Isolatorsequenzen, welche die Transkriptionseinheit flankieren;
- IV) regulatorische Elemente, wie z.B. Tetracyclin-Response-Elemente.
- I) the non-structural regions inactivated in the adenovirus genome of the first genetic unit integrated into the genome of the host cell or in a "shuttle vector";
- II) an inducible promoter which may be strictly regulatable; and optionally
- III) two dimers of insulator sequences flanking the transcriptional unit;
- IV) regulatory elements, such as tetracycline response elements.
Ein wesentliches Charakteristikum eines solchen Vektors ist das Vermögen, während des Wachstumsschritts der Zelllinie strikt inaktiv gehalten zu werden, um die zytotoxische Wirkung der viralen Proteine zu vermeiden.One The essential characteristic of such a vector is the ability to acquire during the Growth step of the cell line to be kept strictly inactive, to avoid the cytotoxic effect of viral proteins.
In einer bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors sind die Ad-Bereiche diejenigen des Serotyps Ad5, in einer zweiten bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors sind die Ad-Bereiche diejenigen des Serotyps Ad2. Kombinationen mit Ad-Bereichen anderer Serotypen oder irgendeines anderen Mitglieds der Adenoviridae-Familie sind möglich und könnten in einigen Anwendungen bevorzugt sein.In a preferred embodiment of such a vector, the Ad regions are those of the serotype Ad5, in a second preferred embodiment of such a vector Ad areas are those of serotype Ad2. combinations with ad ranges of other serotypes or any other member The Adenoviridae family are possible and could be preferred in some applications.
In einer bevorzugten Ausführungsform eines solchen Vektors besteht der induzierbare Promotor aus einem Element, welches auf Tetracyclin anspricht. Die Regulation der Expression basiert in diesem Fall auf der Verwendung der beiden regulatorischen Elemente tetracyclin-gesteuerter reverser Transaktivator (rtTA) (Gossen, D., et al. (1995), Science 268:1766-1769) und hybrider transkriptionaler Repressor Tet-KRAB (Deuschle, U., et al. (1995), Mol. Cell. Biol. 15:1907-1914), modifiziert, um die Bildung eines rtTA/Tet-KRAB-Dimers zu verhindern (Freundlieb, S., et al., J. Gene Med. 1999; 1:1-13).In a preferred embodiment of such a vector, the inducible promoter consists of a Element that responds to tetracycline. The regulation of expression based in this case on the use of the two regulatory Elements of tetracycline-driven reverse transactivator (rtTA) (Gossen, D., et al. (1995), Science 268: 1766-1769) and hybrid transcriptional repressor Tet-KRAB (Deuschle, U., et al., (1995) Mol. Cell. Biol. 15: 1907-1914) modified to prevent the formation of an rtTA / Tet KRAB dimer (Freundlieb, S., et al., J. Gene Med. 1999; 1: 1-13).
Vorzugsweise wird die Verwendung eines Vektors, der ein einziges Tetracyclin-Response-Element in Form bidirektionaler Expression enthält, bereitgestellt, so dass die Grundaktivität durch den TetR-KRAB-Repressor strikt reprimiert wird. In Abwesenheit von Doxycyclin bindet der TetR-KRAB-Repressor stark an das Tetracyclin-Response-Element und stellt eine drastische Verringerung der Grundpromotoraktivität sicher. In Anwesenheit von Doxycyclin wird die Transkription durch Ablösung des Tet-KRAB-Repressors und die Bindung des rtTA-Aktivators an den Promotor aktiviert.Preferably The use of a vector that is a single tetracycline response element in the form of bidirectional Contains expression, provided basic activity by the TetR KRAB repressor is strictly repressed. In the absence of doxycycline, it binds TetR KRAB repressor strongly attached to the tetracycline response element and Ensures a drastic reduction in basic promoter activity. In the presence of doxycycline, transcription is triggered by detachment of the Tet-KRAB repressor and the binding of the rtTA activator activated to the promoter.
Alternativ kann das System auf einem reversen Silencer basieren, erhalten durch Fusionierung der KRAB-Domäne, welche für die transkriptionale Repression verantwortlich ist, und der DNA-Bindungsdomäne von rtTA in Kombination mit dem direkten Transaktivator tTA. In dieser zweiten Version des Regulationssystems findet die transkriptionale Repression durch Kultivierung der Zellen in Abwesenheit von Tetracyclin statt.alternative The system can be based on a reverse silencer obtained by Fusion of the KRAB domain, which for the transcriptional repression is responsible, and the DNA-binding domain of rtTA in combination with the direct transactivator tTA. In this second Version of the regulatory system finds the transcriptional repression by culturing the cells in the absence of tetracycline.
Andere Regulationssysteme sind im Stand der Technik beschrieben, wie z.B. diejenigen, welche auf der Verwendung anderer Liganden als Tetracyclin basieren, wie z.B. RU486 (Wang, K. E., et al. (1994), PNAS, 91:8180-8184), Ecdyson (No, D., et al. (1996), PNAS 93:3346-3351), Rapamycin (Spencer, D. M., et al. (1993), Science 262:1019-1024), und deren Verwendung kann unschwer an die vorliegende Erfindung angepasst werden. Für die Zwecke der vorliegenden Erfindung kann jeder beliebige Genexpressionsregulator verwendet werden, so lange er eine ausreichende Regulation gewährleistet und durch die Verwendung von Faktoren, welche in der pharmakologischen Praxis akzeptabel sind, induzierbar ist.Other Regulation systems are described in the art, e.g. those based on the use of ligands other than tetracycline, such as. RU486 (Wang, K.E., et al. (1994), PNAS, 91: 8180-8184), Ecdyson (No, D., et al. (1996), PNAS 93: 3346-3351), rapamycin (Spencer, D.A. M., et al. (1993), Science 262: 1019-1024), and their use can be easily adapted to the present invention. For the purpose Any gene expression regulator may be used in the present invention be used as long as it ensures adequate regulation and by the use of factors which are in the pharmacological Practice are acceptable, is inducible.
Die Anwesenheit von zwei DNA-Isolator-Dimeren verbessert die Stabilität der zweiten genetischen Einheit, was deren Induzierbarkeit erlaubt. Diese DNA-Elemente können vom Hühner-β-Globin-Locus abgeleitet sein und schützen bekanntermaßen eine transkriptionale Einheit vor konstitutiver Inaktivierung aufgrund von DNA-Methylierung und negativen oder positiven Einflüssen, welche auf der Insertionsstelle in dem Wirtschromosom beruhen.The presence of two DNA isolator di meren improves the stability of the second genetic unit, which allows its inducibility. These DNA elements may be derived from the chicken β-globin locus and are known to protect a transcriptional unit from constitutive inactivation due to DNA methylation and negative or positive influences which are due to the insertion site in the host chromosome.
Ferner können die Zellen der vorliegenden Erfindung eine zweite genetische Einheit in einer stabilen Form enthalten, wobei die Nicht-Strukturbereiche, die in dem Ad-Genom der ersten genetischen Einheit, welche in dem "Shuttle-Vektor" vorliegt, deletiert oder in irgendeiner Weise inaktiviert sind, funktionsfähig mit Sequenzen, vorzugsweise genomischen Sequenzen, die induzierbar deren Expression regulieren, verknüpft sind.Further can the cells of the present invention, a second genetic unit contained in a stable form, the non-structural regions, which is deleted in the ad genome of the first genetic unit present in the shuttle vector or inactivated in any way, functional with Sequences, preferably genomic sequences, which are inducible Regulate expression, linked are.
Die zweite genetische Einheit kann in einem oder mehreren Vektor(en) enthalten sein und durch Transfektionstechniken, Mikroinjektion etc., in die Zellen inseriert werden.The second genetic unit may be in one or more vector (s) be contained and by transfection techniques, microinjection etc., into which cells are inserted.
Eine Selektionsmarker, wie z.B. ein G418-Resistenzgen, Hygromycin B-Resistenzgen, Puromycinresistenzgen, Bleomycinresistenzgen, liegt im allgemeinen in beiden Einheiten vor und kann zur Selektion von Zelllinien, welche stabil eine oder beide der Einheiten aufrecht erhalten, verwendet werden, wobei in diesem letzteren Fall entweder von einer Zelle ausgegangen wird, die eine der Einheiten enthält, oder von Zellen, die keine der Einheiten enthalten, in jedem Fall entsprechend wohlbekannten Techniken auf diesem Gebiet.A Selection markers, such as e.g. a G418 resistance gene, hygromycin B resistance gene, puromycin resistance gene, Bleomycin resistance gene is generally in both units and can be used to select cell lines that are stable or both the units maintained, being used in this The latter case is assumed either by a cell that has a contains the units, or cells that do not contain any of the units, in any case according to well-known techniques in this field.
Die nach Transformation mit der zweiten genetischen Einheit erhaltenen Zellen sind charakterisiert durch das Vermögen zur Expression der darin enthaltenen Nicht-Strukturbereiche in einer streng kontrollierten Weise. Im Fall der Regulation von Nicht-Strukturbereichen unter Verwendung des Tet-Systems führt die Zugabe von Tetracyclin zu dem Kulturmedium zu einer Derepression des Tet-Promotors, vermittelt durch die tetracyclin-induzierte Dissoziation von tTS von der TetR-DNA-Bindungsstelle, gefolgt von einer vollständigen transkriptionalen Aktivierung aufgrund von rtTA-Bindung.The obtained after transformation with the second genetic unit Cells are characterized by the ability to express the information contained therein Non-structural areas in a strictly controlled manner. in the Case of regulation of non-structural areas using of the Tet system the addition of tetracycline to the culture medium for derepression of the Tet promoter mediated by tetracycline-induced dissociation of tTS from the TetR DNA binding site, followed by a complete transcriptional Activation due to rtTA binding.
Insbesondere umfasst diese Zelllinie in einer stabilen Form einen oder mehrere Vektor(en), umfassend die für E1 und E4 oder E1, E2 und E4 codierenden Gene, welche die Ad-Bereiche, die von dem "Ad/EBV-Shuttle-Vektor" eines humanen Ad-Virus wie oben beschrieben deletiert wurden, komplementieren können. Speziell sind die viralen Gene die des Ad5-Serotyps und das Expressionsregulationssystem basiert auf der Verwendung von sowohl dem tetracyclin-gesteuerten reversen Transaktivator (rtTA) als auch dem hybriden transkriptionalen Tet-KRAB-Repressor wie oben offenbart. Jedoch können genetische Sequenzen, die von irgendeinem anderen Mitglied der Adenoviridae-Familie abgeleitet sind, verwendet werden. In ihren bevorzugten Ausführungsformen ist diese Zelllinie vorzugsweise die Zelllinie A549 (Human-Lungenkarzinom, ATCC CLL 185) wie im Stand der Technik beschrieben, jedoch werden andere Zelllinien, welche die Adenovirus-Replikation erlauben, in der vorliegenden Erfindung ebenfalls in Betracht gezogen.Especially For example, this cell line comprises one or more in a stable form Vector (s) comprising the for E1 and E4 or E1, E2 and E4 coding genes which are the ad areas, that of the "ad / EBV shuttle vector" of a human ad virus like described above can be complemented. specially For example, the viral genes are those of the Ad5 serotype and the expression regulation system based on the use of both the tetracycline-driven reverse transactivator (rtTA) as well as the hybrid transcriptional Tet-KRAB repressor as disclosed above. However, you can genetic sequences from any other member of the Adenoviridae family derived are used. In their preferred embodiments this cell line is preferably the cell line A549 (human lung carcinoma, ATCC CLL 185) as described in the prior art other cell lines that allow adenovirus replication, in of the present invention also contemplated.
In irgendeinem der oben beschriebenen Fälle wird die Ableitung der Helferzelllinie mit einer eukaryotischen Zelllinie, vorzugsweise einer Säugerzelllinie, vorzugsweise humanen Ursprungs, welche die erste genetische Einheit in einer stabilen episomalen Form als Vektor einschließt (bezeichnet als "Shuttle-Plasmid"), wie oben offenbart durchgeführt.In In any of the cases described above, the derivative of the Helper cell line with a eukaryotic cell line, preferably a mammalian cell line, preferably of human origin, which is the first genetic unit in a stable episomal form as a vector (designated as a "shuttle plasmid") as disclosed above carried out.
In ihren bevorzugten Ausführungsformen ist diese Zelllinie vorzugsweise die Zelllinie A549 (Human-Lungenkarzinom, ATCC CLL 185) wie im Stand der Technik beschrieben, aber andere Zelllinien humanen Ursprungs oder auch nicht sind vom Umfang der vorliegenden Erfindung eingeschlossen, so lange sie die Adenovirus-Replikation erlauben.In their preferred embodiments this cell line is preferably the cell line A549 (human lung carcinoma, ATCC CLL 185) as described in the prior art, but others Cell lines of human origin or not are from the scope of as long as they support adenovirus replication allow.
In einem weiteren Aspekt der vorliegenden Erfindung wurden die so erhaltenen Helferzelllinien in einem Verfahren zur Produktion von adenovirus-abgeleiteten und helferabhängigen Vektoren eingesetzt, welches durch die folgenden Schritte gekennzeichnet ist:
- a') Kultivierung der vorgenannten Helferzelllinie unter Bedingungen, welche dazu geeignet sind, die Expression von Genen, welche von den im Inneren der Zelle enthaltenen Adenovirus-Bereichen codiert werden, zu verringern, wobei die Bedingungen die im Stand der Technik für jeden hier beschriebenen Promotor bekannten Bedingungen sind, wie z.B. die in den Beispielen beschriebenen Bedingungen. Wenn das Tet-System für die transkriptionale Kontrolle verwendet wird, wird die Zelllinie in Abwesenheit von Tetracyclin kultiviert werden;
- b') Insertion in die Helferzelllinie der genomischen DNA für ein helfer-abhängiges Adenovirus durch Vektor-DNA-Transfektion oder Infektion der Zelle wie beschrieben (Parks, R. J., L. Chen, M. Anton, U. Sankar, M. A. Rudnicki und F. L. Graham (1996), Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:13656-13570).
- c') Induktion der Expression der Gene, welche von den im Inneren der Zelle enthaltenen Adenovirus-Bereichen codiert werden. Im Falle der tet-kontrollierten Transkription durch Zugabe von Doxycyclin zu dem Kulturmedium.
- a ') cultivating the aforementioned helper cell line under conditions suitable for reducing the expression of genes encoded by the adenovirus regions contained within the cell, the conditions being those known in the art for each promoter described herein known conditions, such as the conditions described in the examples. When the Tet system is used for transcriptional control, the cell line will be cultured in the absence of tetracycline;
- b ') Insertion into helper cell line of genomic DNA for helper-dependent adenovirus by vector DNA transfection or cell infection as described (Parks, RJ, L. Chen, M. Anton, U. Sankar, MA Rudnicki and FL Graham (1996), Proc Natl Acad Sci., USA 93: 13656-13570).
- c ') Induction of the expression of the genes which are encoded by the adenovirus regions contained inside the cell. In the case of tet-controlled transcription by adding doxycycline to the culture medium.
Eine großmaßstäbliche Produktion eines vollständig deletierten HD-Adenovirus-Vektors wird erzielt durch reihenmäßiges Passagieren des Vektors wie bereits für Vektoren der ersten Generation beschrieben (Hitt, M. M., et al. 1995, Meth. Mol. Genet. 7, 13-30).A large-scale production of a completely deleted HD adenovirus vector is achieved by serial vectoring as previously described for first generation vectors (Hitt, MM, et al., 1995, Meth. Mol. Genet., 7, 13-30).
Speziell wird dieses Verfahren angewandt für die Produktion von helfer-abhängigen Adenovirus-Vektoren, welche für die Expression von Polypeptiden von therapeutischem Interesse codierende Gene enthalten, vorzugsweise zur Verwendung in der Gentherapie, bevorzugt zur Verwendung in der humanen Gentherapie.specially this method is used for the production of helper-dependent adenovirus vectors, which for expression of polypeptides of therapeutic interest encoding genes preferably for use in gene therapy for use in human gene therapy.
Bisher wurde eine allgemeine Beschreibung der vorliegenden Erfindung gegeben. Eine detailliertere Beschreibung einiger spezifischer Ausführungsformen davon wird hier im folgenden mit Hilfe der folgenden Beispiele gegeben, welche ein besseres Verständnis ihrer Ziele, charakteristischen Eigenschaften, Vorteile und Ausführungsformen geben sollen.So far A general description of the present invention has been given. A more detailed description of some specific embodiments this is given below with the help of the following examples, which a better understanding their goals, characteristics, advantages and embodiments should give.
Beispiel 1: Konstruktion eines E1- und E4-ExpressionsvektorsExample 1: Construction an E1 and E4 expression vector
Alle Plasmide können unter Anwendung von rekombinanten DNA-Standardtechniken konstruiert werden.All Plasmids can using standard recombinant DNA techniques.
Der E1-Bereich des Adenovirus 5 kann mittels PCR unter Verwendung der viralen genomischen DNA als Substrat erhalten werden und kann in das Plasmid pBI (Baron, U., et al. (1995), Nucleic Acids Res., 23 (17) 3605-3606), welches einen bidirektionalen Promotor enthält, der aus einem einzigen Tetracyclin-Response-Element (TRE), flankiert von zwei minimalen Cytomegalovirus (CMV)-Promotoren (Clontech), besteht, zwischen den Restriktionsstellen NotI und SalI inseriert werden, was das Plasmid pBI.E1 ergibt. Dann kann pBI.E1 durch Insertion der DNA, welche für den mittels PCR erhaltenen Adenovirus-E4-Bereich codiert, zwischen den Restriktionsstellen MluI und NheI modifiziert werden, um somit das Konstrukt pBI.E1/E4 zu erhalten.Of the E1 region of adenovirus 5 can be amplified by PCR using the viral genomic DNA can be obtained as a substrate and can be found in the plasmid pBI (Baron, U., et al. (1995), Nucleic Acids Res., 23 (17) 3605-3606) containing a bidirectional promoter, the flanked by a single tetracycline response element (TRE) of two minimal cytomegalovirus (CMV) promoters (Clontech), exists between the NotI and SalI restriction sites become what the plasmid pBI.E1 gives. Then pBI.E1 can be inserted the DNA, which for encodes the adenovirus E4 region obtained by PCR between the restriction sites MluI and NheI, thus construct pBI.E1 / E4 to obtain.
Beispiel 2: Konstruktion eines E1/E4-ExpressionsvektorsExample 2: Construction an E1 / E4 expression vector
Alle Plasmide können unter Anwendung der rekombinanten DNA-Standardtechniken konstruiert werden.All Plasmids can using standard recombinant DNA techniques.
Die
E4-ORF6-Gen-DNA wurde mittels PCR amplifiziert unter Verwendung
der Oligonukleotide 5'-TTATACGCGTGCCACCATGACTACGTCCG-3' und 5'-TTATGCTAGCGCGAAGGAGAAGTCCACG-3' und pFG140, enthaltend
virale genomische Ad5-DNA, als Substrat. Amplifizierte DNA wurde
in das Plasmid pBI (Clontech) (Baron, U., et al. (1995), Nucleic
Acids Res., 23 (17) 3605-3606), das einen bidirektionalen Promotor,
bestehend aus einem einzigen Tetracyclin-Response-Element (TRE),
flankiert von zwei minimalen Cytomegalovirus (CMV)-Promotoren, enthält, zwischen
den Restriktionsstellen MluI und NheI inseriert, welches das Plasmid
pBI.E4 ergibt. pBI.E4 wurde durch Insertion der DNA, welche für den unter
Verwendung der Oligonukleotide 5'-ATGCGCGGGCGCTGAGTTCCTCAAGAGG-3' und 5'-ATGCGTCGACCAGTACCTCAATCTGTATCTTC-3' mittels PCR erhaltenen
Adenovirus-E1-Bereich
codiert, zwischen den Restriktionsstellen NotI und SalI hergestellt,
wobei schließlich das
Konstrukt pBI.E1/E4 erhalten wurde (
Expressionsvektoren für E2a- und E2b-Gene wurden unter Befolgung derselben Strategie konstruiert, wobei das Plasmid pFG140 dazu verwendet wurde, um DNA-Bindungsproteingen-DNA zu amplifizieren, und pVACpoI und pVACpTP als Matrizen für die Amplifizierung der cDNA von Polymerase und präterminalem Protein (pTp). DBP-DNA wurde in pTRE (Clontech) zwischen den Restriktionsstellen EcoRI und XbaI kloniert. Ad-Polymerase und pTP wurden in denselben Vektor kloniert oder in Kombination in das pBI mit dem bidirektionalen Promotor unter der transkriptionalen Kontrolle des Tet-Operators.expression vectors for E2a and E2b genes were constructed following the same strategy, the plasmid pFG140 was used to prepare DNA binding protein gene DNA and pVACpoI and pVACpTP as templates for amplification the cDNA of polymerase and preterminal Protein (pTp). DBP DNA was inserted into pTRE (Clontech) between the restriction sites EcoRI and XbaI cloned. Ad polymerase and pTP were in the same Vector cloned or combined into the bi-directional pBI Promoter under the transcriptional control of the Tet operator.
Beispiel 3: Konstruktion eines Vektors, der tetracyclin-gesteuerte Transkriptionsregulatoren exprimiertExample 3: Construction a vector, the tetracycline-driven transcriptional regulators expressed
Das
Tet-Steuerungssystem erlaubt die Regulation von Genaktivitäten über ein
breites Größenspektrum
in Säugerzellen.
Ein transkriptionaler Silencer (tTS) wurde kürzlich durch Fusion der DNA-Bindungsdomäne des Tetracyclin-Repressors
mit der Silencer-Domäne
von Kid-1 entwickelt (Freundlieb, S., et al., J. Gene Med. 1999;
1:1-13). tTS und rtTA wurden in einem einzigen Expressionsvektor
wie folgt kombiniert. Ein EcoRI-ClaI-DNA-Fragment, enthaltend den
Tet-Silencer, wurde aus dem Plasmid pUHS6-1 isoliert und stromabwärts der
IRES-Sequenz in den Vektor pIRES-Neo (Clontech) unter Ersatz des
Neo-Gens inseriert. Der neue Vektor pIRES-tTS wurde mit der Insertion
des rtTA-Gens in die nur einmal vorkommende EcoRV-Restriktionsstelle stromabwärts des
Human-Cytomegalovirus-IE-Promotors
modifiziert, welches pIREStTS/rtTA ergab. Zur Einführung eines
Selektionsmarkers zur Isolierung von Zellklonen, welche stabil Tet-Proteine
exprimierten, wurde eine aus dem Vektor pPUR (Clontech) erhaltene
Puromycinresistenz-Expressionskassette in die XhoI-Stelle von pIREStTS/rtTA
inseriert, welches pIREStTS/rtTApuro ergab (
Beispiel 4: Konstruktion des Shuttle-PlasmidsExample 4: Construction of the shuttle plasmid
Ein 32462-bp-DNA-Fragment, enthaltend das gesamte Adenovirus 5-Genom, bei dem der E1-Bereich und das Verpackungssignal deletiert sind, kann durch Spalten des Plasmids pBHG10 (Bett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91:8802-8806; 1994) mit den Restriktionsenzymen XbaI und ClaI erhalten werden. Das resultierende Fragment kann in den Vektor pCEP4 (Invitrogen), welcher den Replikationsursprung von EBV Ori P und das Gen für den viralen Transaktivator EBNA-1 enthält, zwischen den Restriktionsstellen SspBI und BamHI inseriert werden, um somit das Plasmid pSC zu erhalten. Dann kann der E4-Bereich des Adenovirus-Genoms deletiert werden, wobei das DNA-Fragment, das zwischen den Nukleotiden 32810 und 35620 enthalten ist, eliminiert wird, und somit das Plasmid pSCΔE4 erzeugt werden. Anschließend können pSCΔE4-Modifikationen eingeführt werden, um die Vektoreigenschaften zu optimieren. Beispielsweise kann die erneute Insertion von Sequenzen aus dem AdS-Wt-E3-Bereich, welche im Kontext von pBHG10 deletiert wurden, in das virale Genom die Expressionsniveaus des für die Virusfaser codierenden Gens erhöhen. Darüber hinaus kann ein DNA-Fragment, das Mehrfachbindungsstellen des Tetracyclin-Repressors einschließt (tet-O), stromaufwärts der Transkriptionsstarts des E2-Bereiches inseriert werden, um die restliche Expression des Adenovirus-Genoms weiter abzuschwächen, wie von Rittner et al. (Rittner, K., et al. (1997), J. Virol. 71:3307-3311) beschrieben. In dieser Version des Shuttle-Plasmids pSCΔE4 ist dessen Expression weiter durch Tet-KRAB abgeschwächt, welches an den E2-Bereich in Abwesenheit von Tetracyclin bindet.A 32462 bp DNA fragment containing the entire adenovirus 5 genome in which the E1 region and the packaging signal are deleted can be obtained by digesting the plasmid pBHG10 (Bett et al., Proc. Natl. Acad Sci : 8802-8806, 1994) with the restriction enzymes XbaI and ClaI are obtained. The resulting fragment can be inserted into the vector pCEP4 (Invitrogen) containing the replication origin of EBV Ori P and the gene for the viral transactivator EBNA-1, between the restriction sites SspBI and BamHI, to thereby obtain the plasmid pSC. Then, the E4 region of the adenovirus genome can be deleted, eliminating the DNA fragment contained between nucleotides 32810 and 35620, and thus generating the plasmid pSCΔE4. Subsequently, pSCΔE4 modifications can be introduced to optimize the vector properties. For example, re-insertion of sequences from the AdS-Wt-E3 region deleted in the context of pBHG10 into the viral genome may increase expression levels of the gene encoding the viral fiber. In addition, a DNA fragment including tetracycline repressor multiple binding sites (tet-O) may be inserted upstream of the E2 region transcriptional starts to further attenuate the residual expression of the adenovirus genome as described by Rittner et al. (Rittner, K., et al., (1997) J. Virol 71: 3307-3311). In this version of the shuttle plasmid pSCΔE4 its expression is further attenuated by Tet-KRAB, which binds to the E2 region in the absence of tetracycline.
Beispiel 5: Konstruktion des Shuttle-PlasmidsExample 5: Construction of the shuttle plasmid
A: Subklonierung und Modifizierung des E4-Bereichs von Ad5A: Subcloning and modification of the E4 range of Ad5
Ein DNA-Fragment, enthaltend den gesamten Adenovirus 5-E4-Bereich, wurde erhalten durch Spalten des Plasmids pBHG10 (Bett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91:8802-8806; 1994) mit den Restriktionsenzymen SpeI und ClaI. Das isolierte Fragment wurde in den Vektor pBluescript (Stratagene) zwischen den Restriktionsstellen SpeI und ClaI ligiert, welches das Plasmid pBSE4 ergab. Dann wurde pBSE4 durch Insertion eines Eptamers von DNA-Bindungsstellen für den Tet-Repressor in die nur einmal vorkommende PacI-Restriktionsstelle modifiziert, welches pBSE4-ept ergab. Die Tet-Eptamer-DNA wurde mittels PCR unter Verwendung der Oligonukleotide 5'-CTGATTAATTAAATAGGCGTATCACGAGGCC-3' und 5'-CTGACGATCGCGTACACGCCTACTC-3' und des Plasmids pUHD10.3 als DNA-Matrize amplifiziert. Die Tet-Bindungsstelle wurde in die PacI-Restriktionsstelle von pBSE4 gerade stromaufwärts des E2-Promotors kloniert. Das Endziel war die Verringerung der Hintergrundexpression des E2-Promotors unter Nutzung des Silencer-Effekts des tetracyclin-kontrollierten transkriptionalen Silencers wie beschrieben von Rittner (Rittner, K., et al. (1997), J. Virol. 71:3307-3311). Der in PBSE4-ept vorliegende Ad5-E4-Bereich wurde dann eliminiert durch Verdauung mit den Restriktionsenzymen MfeI und ClaI, die Vektor-DNA wurde gelgereinigt und mit einer Tk-Hygromycin B-Resistenz-Expressionskassetten-DNA, erhalten mittels PCR mit den Oligonukleotiden 5'-AGTGCACAATTGATTTAAATAATCCGCGCGGTGG-3' und 5'-TGCAATCGATCAACGCGGGCATCC-3' unter Verwendung von pCEP-4-Plasmid-DNA als Matrize, ligiert, welches pBSΔE4 ergab. Die Adenovirus-ITRs in Kopf-zu-Schwanz-Konfiguration wurden dann mittels PCR unter Verwendung der Oligonukleotide 5'-TCGAATCGATACGCGAACCTACGC-3' und 5'-TCGACGTGTCGACTTCGAAGCGCACACCAAAAACGTC-3' und pFG140 (Microbix)-Plasmid-DNA als Matrize amplifiziert. Die Ad-ITRs wurden in die nur einmal vorkommende NruI-Stelle von pBSΔE4 kloniert, welches pBSΔE4J ergab.One DNA fragment containing the entire adenovirus 5-E4 region obtained by cleaving the plasmid pBHG10 (Bett et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 91: 8802-8806; 1994) with the restriction enzymes SpeI and ClaI. The isolated fragment was inserted into the vector pBluescript (Stratagene) ligated between the restriction sites SpeI and ClaI, which is the Plasmid pBSE4 resulted. Then pBSE4 was inserted by insertion of an eptamer of DNA binding sites for the Tet repressor into the unique PacI restriction site which resulted in pBSE4-ept. The Tet-Eptamer DNA was analyzed by PCR using the oligonucleotides 5'-CTGATTAATTAAATAGGCGTATCACGAGGCC-3 'and 5'-CTGACGATCGCGTACACGCCTACTC-3' and the plasmid pUHD10.3 amplified as DNA template. The Tet binding site was into the PacI restriction site of pBSE4 just upstream of the E2 promoter cloned. The ultimate goal was to reduce background expression of the E2 promoter using the silencer effect of the tetracycline-controlled transcriptional silencers as described by Rittner (Rittner, K., et al. (1997) J. Virol. 71: 3307-3311). The Ad5 E4 region present in PBSE4-ept was then eliminated by digestion with the restriction enzymes MfeI and ClaI, the vector DNA was gel purified and treated with a Tk-hygromycin B-resistance expression cassette DNA obtained by PCR with the Oligonucleotides 5'-AGTGCACAATTGATTTAAATAATCCGCGCGGTGG-3 'and 5'-TGCAATCGATCAACGCGGGCATCC-3' using of pCEP-4 plasmid DNA as template, which yielded pBSΔE4. The Adenovirus ITRs in head-to-tail configuration were then used PCR using the oligonucleotides 5'-TCGAATCGATACGCGAACCTACGC-3 'and 5'-TCGACGTGTCGACTTCGAAGCGCACACCAAAAACGTC-3' and pFG140 (Microbix) plasmid DNA as template amplified. Ad-ITRs were added to the unique NruI site from pBSΔE4 cloned, which gave pBSΔE4J.
B: Insertion von EBV-OriP in pLBG40B: insertion of EBV-OriP in pLBG40
Ein DNA-Fragment, enthaltend EBV-OriP, wurde aus dem Vektor pCEP4 durch MfeI-Verdauung isoliert und in pLitmus 28 (N. E. Biolabs), verdaut mit dem Restriktionsenzym EcoRI, subkloniert. Das resultierende Plasmid plit-OriP wurde dann mit XbaI verdaut, um ein 2476-bp-DNA-Fragment, enthaltend den EBV-OriP freizusetzen, welches in die nur einmal vorkommende XbaI-Stelle des Plasmids pLBG40 (Recchia, A., et al. 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. 96:2615-2620) kloniert wurde, welches pLBG-OriP ergab.One DNA fragment containing EBV OriP was carried out from the vector pCEP4 MfeI digestion isolated and in PI 28 (N.E. Biolabs) digested with the restriction enzyme EcoRI, subcloned. The resulting plasmid plit-OriP was then digested with XbaI to a 2476 bp DNA fragment containing the EBV OriP which is in the only once occurring XbaI site of the plasmid pLBG40 (Recchia, A., et al., 1999, Proc. Natl. Acad. Sci. 96: 2615-2620) which gave pLBG-OriP.
C: Construktion von Ad/EBV-Shuttle-PlasmidenC: Construct of Ad / EBV shuttle plasmids
Ein
Shuttle-Plasmid pSA-1 (
pSA-1 wurde weiter modifiziert durch Insertion des EBNA-1-Gens wie folgt. pREP10 (Invitrogen), ein Plasmid, das beide Elemente des latenten EBV-Replikationsursprungs enthält, EBNA-1 und OriP, wurde mit XbaI und NheI verdaut, um ein 429-bp-DNA-Fragment zu isolieren, welches SV40-polyA enthielt. Plasmid-DNA wurde vollständig aufgefüllt, gelgereinigt und ligiert, um pREP11 zu erzeugen. pREP11 wurde dann mit EcoRI und XhoI verdaut, um ein DNA-Fragment freizusetzen, welches sowohl das EBNA-1-Gen als auch den OriP enthielt. Dieses DNA-Fragment wurde in pLitmus28, verdaut mit EcoRI und XhoI, subkloniert, um pREP12 zu erhalten. pREP12 wurde mit EcoRI und MluI verdaut, gelgereinigt und mit dem 3627-bp-EcoRI-MluI-DNA-Fragment ligiert, welches aus pCEP4 isoliert worden war, um pREP13 zu erzeugen. pREP13 wurde mit XbaI und NheI verdaut, um ein DNA-Fragment mit XbaI-kompatiblen Enden freizusetzen, welches EBNA-1 und OriP enthält. Schließlich wurde dieses Fragment in pSA-1, verdaut mit XbaI, kloniert, um pSA-2 zu erzeugen.pSA-1 was further modified by insertion of the EBNA-1 gene as follows. pREP10 (Invitrogen), a plasmid containing both elements of the EBV origin of EBV replication, EBNA-1 and OriP, was digested with XbaI and NheI to isolate a 429 bp DNA fragment containing SV40 polyA. Plasmid DNA was completely filled in, gel purified and ligated to generate pREP11. pREP11 was then digested with EcoRI and XhoI to release a DNA fragment containing both the EBNA-1 gene and the OriP. This DNA fragment was subcloned into pLitmus28 digested with EcoRI and XhoI to obtain pREP12. pREP12 was digested with EcoRI and MluI, gel purified, and ligated to the 3627 bp EcoRI-MluI DNA fragment isolated from pCEP4 to generate pREP13. pREP13 was digested with XbaI and NheI to form a Release DNA fragment with XbaI compatible ends containing EBNA-1 and OriP. Finally, this fragment was cloned into pSA-1 digested with XbaI to generate pSA-2.
Beispiel 6: Ad/EBV-Shuttle-Plasmid-ModifizierungenExample 6: Ad / EBV Shuttle Plasmid Modifications
Die Ad/EBV-Shuttle-Plasmide (pSA-1 und pSA-2) wurden weiter modifiziert durch Deletion einer DNA-Sequenz, welche dem DNA-Bindungsprotein (DBP)-Gen (Nukleotide 22443-24032 der Ad5-Sequenz) entsprach. Die Deletion wurde durch homologe Rekombination in E. coli nach dem von A. F. Stuart und Mitarbeitern beschriebenen Verfahren (Zhang et al., Nat. Genet. 1998; 20:123-128) erhalten. Ein DNA-Fragment, enthaltend das Tn5-Kanamycinresistenzgen (neo), flankiert von DNA-Sequenzen, wurde mittels PCR mit den Oligonukleotiden 5'-GCGGTTAGGCTGTCCTTCTTCTCGACTGACTCCATGATCTTTTTCTGCCTATAGGAGAAG GAATCCCGGCGGATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3' und 5'-AAATGCTTTTATTTGTACACTCTCGGGTGATTATTTACCCCCACCCTTGCCGTCTGCGCC GTTCTGCAAACCCTATGCTACTCCGTCG-3', bestehend aus etwa 60 bp an Homologie zu dem DBP-Gen, und an den 3'-Enden PCR-Primern zur Amplifizierung des neo-Gens unter Verwendung von pGKfrt als Matrize erhalten. Lineare DNA, enthaltend das neo-Gen, wurde in Rekombinationsexperimenten eingesetzt, um das DBP-Gen aus Ad/EBV-Shuttle-Plasmiden zu deletieren. Dasselbe Verfahren wurde zur Konstruktion von Ad/EBV-Shuttle-Plasmiden angewandt, welche kein Ad-Polymerasegen und präterminales Protein exprimieren. Die Sequenz der zur Deletion des Polymerasegens verwendeten Oligonukleotide war 5'-ACGGCCTGGTAGGCGCAGCATCCCTTTTCTACGGGTAGCGCGTATGCCTGCGCGGCCT TCCGGTCTGCAAACCCTATGCTACTCCGTCG-3' und 5'-AGACCTATACTTGGATGGGGGCCTTTGGGAAGCAGCTCGTGCCCTTCATGCTGGTCAT GTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3'. Zwei Paare von Oligonukleotiden wurden zur Deletion der beiden Bereiche innerhalb des Hauptexons von pTP verwendet: 5'-CCGCCTCCCGGTGCGCCGTCGTCGCCGCCGTGTCCCCCCTCCCCCACCGTCCCGGCG GATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3' und 5'-GATCTCCGCGTCCGGCTCGCTCCACGGTGGCGGCGAGGTCGTTGGAAATGCGTCTGC AAACCCTATGCTACTCCGTCG-3', 5'-TCGACAGAAGCACCATGTCCTTGGGTCCGGCCTGCTGAATGCGCAGGCGGTCTGCAAA CCCTATGCTACTCCGTCG-3' und 5'-TCGCCCCCGGAGCCCCGGCCACCCTACGCTGGCCCCTCTACCGCCAGCCGCTCCCGG CGGATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3'.The Ad / EBV shuttle plasmids (pSA-1 and pSA-2) were further modified by deleting a DNA sequence corresponding to the DNA binding protein (DBP) gene (nucleotides 22443-24032 the Ad5 sequence) corresponded. The deletion was by homologous recombination in E. coli according to that described by A.F. Stuart and coworkers Methods (Zhang et al., Nat. Genet. 1998; 20: 123-128). A DNA fragment containing the Tn5 kanamycin resistance gene (neo), flanked by DNA sequences was amplified by PCR with the oligonucleotides 5'-GCGGTTAGGCTGTCCTTCTTCTCGACTGACTCCATGATCTTTTTCTGCCTATAGGAGAAG GAATCCCGGCGGATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3 'and 5'-AAATGCTTTATTTGTACACTCTCGGGGATTATTTACCCCCACCCTTGCCGTCTGCGCC GTTCTGCAAACCCTATGCTACTCCGTCG-3 ', consisting of about 60 bp homology to the DBP gene, and to the 3 'ends PCR primers for amplifying the neo gene using pGKfrt as Die received. Linear DNA containing the neo gene has been included in Recombination experiments were used to delete the DBP gene from Ad / EBV shuttle plasmids. The same procedure was used to construct Ad / EBV shuttle plasmids, which express no ad polymerase gene and preterminal protein. The sequence of the oligonucleotides used to delete the polymerase gene was 5'-ACGGCCTGGTAGGCGCAGCATCCCTTTTCTACGGGTAGCGCGTATGCCTGCGCGGCCT TCCGGTCTGCAAACCCTATGCTACTCCGTCG-3 'and 5'-AGACCTATACTTGGATGGGGGCCTTTGGGAAGCAGCTCGTGCCCTTCATGCTGGTCAT GTCCCGGCGGATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3 '. Two pairs of oligonucleotides were added deletion of the two regions within the main excretory pTP used: 5'-CCGCCTCCCGGTGCGCCGTCGTCGCCGCCGTGTCCCCCCTCCCCCACCGTCCCGGCG GATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3 'and 5'-GATCTCCGCGTCCGGCTCGCTCCACGGTGGCGGCGAGGTCGTTGGAAATGCGTCTGC AAACCCTATGCTACTCCGTCG-3 ', 5'-TCGACAGAAGCACCATGTCCTTGGGTCCGGCCTGCTGAATGCGCAGGCGGTCTGCAAA CCCTATGCTACTCCGTCG-3 'and 5'-TCGCCCCCGGAGCCCCGGCCACCCTACGCTGGCCCCTCTACCGCCAGCCGCTCCCGG CGGATTTGTCCTACTCAGGAGAGCG-3 '.
Das gleiche Verfahren kann auf andere Bereiche von genomischer Adenovirus-DNA angewandt werden, die für die Erzielung einer Verringerung zytotoxischer Wirkungen, welche durch Expression viraler Gene in der infizierten Zelle hervorgerufen werden, von Bedeutung sind.The same procedure may apply to other areas of genomic adenovirus DNA be applied for the achievement of a reduction in cytotoxic effects caused by expression of viral genes in the infected cell become, are of importance.
Beispiel 7: Beurteilung von E1/E4-ExpressionExample 7: Assessment of E1 / E4 expression
Zur Ermittlung der Regulation der E1-Genexpression in Zellen, die Tet-Proteine produzieren, wurden HeLa-Zellen auf 6-Mulden-Platten ausgesät und mit pBI.E1/E4 in Kombination mit pIREStTS/rtTApuro transfiziert. Das Experiment erfolgte in doppelter Ausführung mit und ohne Doxycyclin. 48 h nach der Transfektion wurden HeLa-Zellen geerntet und Zelllysate mittels Westernblots unter Verwendung eines monoklonalen Antikörpers, der gegen E1-Proteine gerichtet war, analysiert. 293-Zellen, welche konstitutiv den E1-Bereich exprimieren, wurden als positive Kontrolle verwendet.to Determination of the regulation of E1 gene expression in cells containing Tet proteins HeLa cells were seeded on 6-well plates and cultured with pBI.E1 / E4 transfected in combination with pIREStTS / rtTApuro. The Experiment was done in duplicate with and without doxycycline. 48 h after transfection HeLa cells were harvested and cell lysates using Western blots using a monoclonal antibody, the directed against E1 proteins was, analyzed. 293 cells constitutively expressing the E1 region, were used as a positive control.
Eine Leck-Expression von E1-Proteinen war in Zellen nachweisbar, die nur mit pBI.E1/E4 transfiziert worden waren. Erwartungsgemäß wurde in Anwesenheit von Tet-Regulationsfaktoren eine starke Expression von E1-Proteinen, induziert durch Doxycyclin, beobachtet, während in Abwesenheit des Wirkstoffs die Expression nicht nachweisbar war. Dieses Ergebnis demonstriert, dass die Expression von Tet-Silencer die Genaktivität aktiv reprimiert und somit die Hintergrundexpression eliminiert. Eine gleichzeitige Expression von tTS und rtTA beeinflusste die Geninduktion über rtTA in Gegenwart von Doxycyclin nicht. Dieses Ergebnis wurde durch ein zweites Experiment bestätigt, in dem HeLa-Zellen mit einem ΔE1-Ad-Vektor, der β-Galactosidase exprimierte, infiziert und dann mit pBI.E1/E4 und pIREStTS/rtTApuro transfiziert wurden. 48 h nach der Transfektion wurden HeLa-Zellen geerntet und ein Lysat wurde durch Aufbrechen der Zellen mittels Einfrieren und Auftauen erhalten. Monoschichten von A549-Zellen wurden mit einem Aliquot des Zelllysats inkubiert und nach 24 h wurde die β-Gal-Aktivität wie beschrieben (Parks, R. J., et al. 1996; Proc. Natl. Acad. Sci. 91:8802-8806) nachgewiesen. Nachdem HeLa-Zellen nicht vollständig permissiv für die Replikation von Vektoren der ersten Generation sind, wurden keine viralen Abkömmlinge in den Zellen nachgewiesen, die nur infiziert waren, während der ΔE1-Vektor in Zellen, die mit beiden Vektoren (pBI.E1/E4 und pIREStTS/rtTApuro) transfiziert worden waren, in Anwesenheit von Doxycyclin vollständig komplementiert wurde, wie demonstriert durch den Nachweis von IacZ-transduzierenden Partikeln im Zelllysat. Ein niedriger β-Galactosidase-Transduktionstiterwurde nach Transfektion mit pBI.E1/E4 als Ergebnis von Tet-Promotor-Grundaktivität nachgewiesen. Im Gegensatz dazu wurden keine transduzierenden Partikel in Zellen nachgewiesen, die in Abwesenheit von Doxycyclin nach Cotransfektion von pBI.E1/E4 und pIREStTS/rtTApuro und Infektion mit Ad-ΔE1-βgal aufrecht erhalten wurden. Dieses Ergebnis bestätigt, dass eine Modulation der E1-Genexpression durch Kombination von Tet-Silencer- und rtTA-Aktivität erhalten werden kann. Darüber hinaus reprimiert die tTS-Expression die E1-Produktion unterhalb des erforderlichen Niveaus, um eine virale Replikation des ΔE1-Ad-Vektors nachzuweisen.Leak expression of E1 proteins was detectable in cells transfected with pBI.E1 / E4 only. As expected, strong expression of E1 proteins induced by doxycycline was observed in the presence of Tet regulatory factors, whereas expression was undetectable in the absence of the drug. This result demonstrates that the expression of Tet-Silencer actively represses gene activity and thus eliminates background expression. Concomitant expression of tTS and rtTA did not affect gene induction via rtTA in the presence of doxycycline. This result was confirmed by a second experiment in which HeLa cells were infected with a ΔE1 Ad vector expressing β-galactosidase and then transfected with pBI.E1 / E4 and pIREStTS / rtTApuro. 48 h after transfection, HeLa cells were harvested and a lysate was obtained by disrupting the cells by freezing and thawing. Monolayers of A549 cells were incubated with an aliquot of the cell lysate and after 24 hours β-gal activity was detected as described (Parks, RJ, et al., 1996, Proc Natl Acad Sci., 91: 8802-8806) , Since HeLa cells are not completely permissive for replication of first generation vectors, no viral progeny were detected in the cells that were only infected, whereas the ΔE1 vector was detected in cells spiked with both vectors (pBI.E1 / E4 and pIREStTS / rtTApuro) was fully complemented in the presence of doxycycline, as demonstrated by the detection of lacZ-transducing particles in the cell lysate. A low β-galactosidase transduction titer was detected after transfection with pBI.E1 / E4 as a result of Tet promoter basal activity. In contrast, no transducing particles were detected in cells maintained in the absence of doxycycline after cotransfection of pBI.E1 / E4 and pIREStTS / rtTApuro and infection with Ad-ΔE1-βgal. This result confirms that modulation of E1 gene expression can be obtained by combining Tet-Silencer and rtTA activity. In addition, tTS expression represses E1 production below the level required to detect viral replication of the ΔE1 ad vector.
Beispiel 8: Komplementierungsfunktion von Ad/EBV-Shuttle-PlasmidenExample 8: Complementation Function of Ad / EBV shuttle plasmids
Zum Testen der Ad-Helferfunktion von Ad/EBV-Plasmiden wurden die Plasmide in A549EBNA- und 293EBNA-Zelllinien in Kombination mit dem helfer-abhängigen Ad-Plasmid C4E1E4gfp kotransfiziert. Dieser Vektor enthält E1- und E4-Adenovirus-Bereiche sowie eine Expressionskassette für Grünes Fluoreszenzprotein (GFP). Wenn beide Plasmide in die gleiche Zelle eingeführt wurden, aktivierte die Expression der E1- und E4-Gene das Ad/EBV-Plasmid, welches die Replikation beider Vektoren, jedoch nur die Verpackung von C4E1/E4gfp-DNA erlaubt. Zwei parallele Experimente wurden unter Verwendung beider Zelllinien durchgeführt. 72 h nach der Transfektion wurde episomale DNA aus einer Gewebekulturschale nach dem Hirt-Verfahren extrahiert. Transfizierte Zellen wurden von der zweiten Schale geerntet und mittels Einfrieren und Auftauen aufgebrochen, um ein rohes Zelllysat zu erhalten.To the Testing of Ad helper function of Ad / EBV plasmids were the plasmids in A549EBNA and 293EBNA cell lines in combination with the helper-dependent Ad plasmid C4E1E4gfp cotransfected. This vector contains E1 and E4 adenovirus regions and an expression cassette for green fluorescent protein (GFP). If both plasmids were introduced into the same cell, the expression of the E1 and E4 genes activated the Ad / EBV plasmid, which replicates both vectors, but only the packaging allowed by C4E1 / E4gfp DNA. Two parallel experiments were performed Use of both cell lines performed. 72 hours after transfection was episomal DNA from a tissue culture dish according to the Hirt method extracted. Transfected cells were harvested from the second dish and broken up by freezing and thawing to give a crude cell lysate to obtain.
Episomale DNA wurde mit den Restriktionsenzymen HindIII und DpnI verdaut und mittels Southernblots analysiert. Filter wurden mit einer Hygromycin-B-DNA-Sonde hybridisiert, welche für das Ad/EBV-Plasmid spezifisch war, und dann, nach Ablösung, mit einer zweiten DNA-Sonde, abgeleitet von C4E1E4gfp, welche beide Plasmide erkennt, rehybridisiert. Parallel dazu wurde eine Monoschicht von 293-Zellen mit Aliquots an Zelllysat inkubiert, um die Produktion von gfp transduzierenden Partikeln zu ermitteln. Die Ergebnisse demonstrierten, dass sich Ad/EBV-Plasmide in zirkulärer Form sowie in linearer Form replizieren, wenn sowohl Ad (E1/E4) als auch viraler EBV (EBNA-1)-Transaktivator exprimiert werden. Darüber hinaus führte die Aktivierung des Ad-Transkriptionsprogramms zu C4E1E4gfp-DNA-Replikation und Verpackung in reife Virionen, wie demonstriert durch die Beobachtung von fluoreszentem GFP exprimierenden Zellen in der 293-Monoschicht, die mit dem Zelllysat inkubiert wurde.episomal DNA was digested with the restriction enzymes HindIII and DpnI and analyzed by Southern blots. Filters were probed with a hygromycin B DNA probe hybridizes which for the Ad / EBV plasmid was specific, and then, after detachment, with a second DNA probe derived from C4E1E4gfp, both Plasmids recognize, rehybridized. Parallel to this was a monolayer of 293 cells with aliquots of cell lysate incubated to produce to detect gfp-transducing particles. The results demonstrated that Ad / EBV plasmids are circular in shape and replicate in linear form when both Ad (E1 / E4) and viral EBV (EBNA-1) transactivator. Furthermore led activation of the ad transcription program to C4E1E4gfp DNA replication and packaging in mature virions, as demonstrated by the observation of fluorescent GFP expressing cells in the 293 monolayer that interact with the cell lysate was incubated.
Beispiel 9: Konstruktion einer Zelllinie, die Regulationsproteine exprimiertExample 9: Construction a cell line expressing regulatory proteins
A549-Zellen (Human-Lungenkarzinom, ATCC CLL 185), welche sowohl den tetracyclinkontrollierten reversen Transaktivator (Gossen, D., et al. (1995), Science 268:1766-1769) als auch den hybriden transkriptionalen tet-KRAB-Repressor (Deuschle, U., et al. (1995), Mol.A549 cells (Human lung carcinoma, ATCC CLL 185), which control both the tetracycline reverse transactivator (Gossen, D., et al. (1995), Science 268: 1766-1769) as well as the hybrid transcriptional tet-KRAB repressor (Deuschle, U., et al. (1995), Mol.
Cell. Biol. 15:1907-1914) exprimieren, können durch Cotransfektion der beiden Plasmide pTet-On (Clontech) und pTetKRAB erhalten werden. Anschließend können die durch Selektion mit dem Antibiotikum G-418 erhaltenen Zellklone getestet werden, um durch Verwendung irgendeines Vektors, in dem ein Reportergen unter der Kontrolle des Tet-Operators inseriert ist, die Expression beider transregulierender Proteine zu ermitteln.Cell. Biol. 15: 1907-1914) can be expressed by co-transfection of the both plasmids pTet-On (Clontech) and pTetKRAB are obtained. Subsequently, the cell clones obtained by selection with the antibiotic G-418 be tested by using any vector in which a reporter gene is inserted under the control of the Tet operator, expression to determine both transregulating proteins.
Ein Adenovirus-Vektor der ersten Generation wurde konstruiert, indem in die PacI-Stelle des Plasmids pLBG40 eine Expressionskassette, welche das unter die Kontrolle des Tet-Operators gestellte Luciferasegen enthielt, inseriert wurde, wodurch das Plasmid pLBGluc erhalten wurde.One Adenovirus vector of the first generation was constructed by into the PacI site of the plasmid pLBG40 an expression cassette, which contained the luciferase gene placed under the control of the Tet operator, was inserted, whereby the plasmid pLBGluc was obtained.
Dieses Plasmid umfasst das gesamte Adenovirus-Genom, bei dem die E1- und E3-Bereiche deletiert sind, und ist deshalb infektiös, falls es mittels Transfektion in 293-Zellen inseriert wird. Das Virus (AdLBGluc), das in den Plaques, die etwa 10 Tage nach der Transfektion in 293-Zellen, die in Monoschicht kultiviert wurden, erschienen, enthalten ist, wurde expandiert, titriert und einem Assay hinsichtlich Luciferase-Enzym-Expression unterworfen.This Plasmid comprises the entire adenovirus genome, in which the E1 and E3 areas are deleted, and is therefore infectious if it is inserted into 293 cells by transfection. The virus (AdLBGluc), that in the plaques, which occurs about 10 days after transfection into 293 cells, which were cultivated in monolayer, appeared, is contained expanded, titrated and assayed for luciferase enzyme expression subjected.
Etwa 104-Zellen eines jeden Klons, erhalten durch Resistenz gegenüber G418, können in 24-Mulden-Platten ausgesät und mit AdLBGluc-Virus bei einer MOI von 20 infiziert werden. Dieselbe Anzahl an Zellen wurde als Duplikat auf eine zweite Platte ausgesät und in Gegenwart von Doxycyclin vor der Infektion kultiviert. 48 h nach der Infektion wurden die Zellen geerntet und lysiert. Die Expressionsniveaus des Luciferasegens wurden unter Verwendung des natürlichen Substrats Luciferin ermittelt. Die Klone, in denen das beste Verhältnis zwischen der Aktivierung der Luciferaseexpression in Gegenwart von Doxycyclin und dem Grundniveau in Abwesenheit von Ligand beobachtet wurde, wurden ausgewählt und expandiert. Ein Klon, welcher gemäß diesem Verfahren hergestellt worden war, wurde expandiert, um weiter charakteristische Eigenschaften von Wachstum, Stabilität und Expressionsniveaus der Regulationsproteine zu definieren. Deshalb wurden geeignete Banken eingefrorener Zellen präpariert, um die Aufrechterhaltung einer Zelllinie sicherzustellen, welche die Regulationsproteine der Transkription rtTA und Tet-KRAB exprimiert.Approximately 10 4 cells of each clone, obtained by resistance to G418, can be seeded in 24-well plates and infected with AdLBGluc virus at an MOI of 20. The same number of cells were seeded as a duplicate on a second plate and cultured in the presence of doxycycline prior to infection. 48 h after infection, the cells were harvested and lysed. The expression levels of the luciferase gene were determined using the natural substrate luciferin. The clones in which the best relationship between the activation of luciferase expression in the presence of doxycycline and the basal level in the absence of ligand was observed were selected and expanded. A clone prepared according to this method has been expanded to further define characteristic properties of growth, stability and expression levels of regulatory proteins. Therefore, suitable banks of frozen cells were prepared to ensure the maintenance of a cell line expressing the regulatory proteins of the transcription rtTA and Tet-KRAB.
Beispiel 10: Konstruktion der E1/E4-induzierbaren ZelllinieExample 10: Construction the E1 / E4-inducible cell line
Das Plasmid pBI.E1/E4 (siehe Beispiel 1) kann in die Zellen des zuvor selektionierten Klons zusammen mit einem Plasmid, welches Resistenz gegenüber dem Antibiotikum Puromycin exprimiert, transfiziert werden. Die Zellen sind selektierbar durch Wachstum auf einem Medium, welches das Antibiotikum enthält, und werden hinsichtlich ihrer Expression von frühen Adenovirus-Proteinen unter der Kontrolle von Tetracyclin einem Assay unterworfen. Für diesen Zweck kann ein Adenovirus-Vektor der zweiten Generation, bei dem sowohl der E1- als auch der E4-Bereich deletiert ist, konstruiert werden wie in der Literatur beschrieben (Brough, D. E., et al. (1996), J. Virol. 70:6497-6501). Die durch Insertion der transkriptionalen Einheit E1/E4 in die Zelle erhaltenen Zellklone können auf Basis ihres Vermögens, den helfer-abhängigen defekten Adenovirus zu komplementieren und somit dessen Replikation zu erlauben, selektioniert werden. Puromycin-resistente Klone können in 24-Mulden-Platten als Duplikat ausgesät werden. Anschließend können die Zellen mit dem ΔE1/E4-Virus infiziert und dann mit und ohne Zugabe von Doxycyclin zum Kulturmedium kultiviert werden. In Anwesenheit von Doxycyclin kann die E1- und E4-Transkriptions-aktivierung Zellen hinsichtlich viraler Replikation permissiv machen und somit den damit verbundenen zytopatischen Effekt belegen. Die Klone, in welchen der AdΔE1/E4-Vektor ausschließlich in Gegenwart von Doxycyclin replizieren kann, können expandiert und zur Feststellung einer dauerhaften Produktion des defekten Virus weiter charakterisiert werden.The plasmid pBI.E1 / E4 (see Example 1) can be inserted into the cells of the previously selected clone together with a plasmid expressing resistance to the antibiotic puromycin, be transfected. The cells are selectable by growth on a medium containing the antibiotic and are assayed for their expression of adenovirus early proteins under the control of tetracycline. For this purpose, a second generation adenovirus vector deleted of both the E1 and E4 regions can be constructed as described in the literature (Brough, DE, et al., (1996) J. Virol. 70: 6497-6501). The cell clones obtained by insertion of the transcriptional unit E1 / E4 into the cell can be selected on the basis of their ability to complement the helper-dependent defective adenovirus and thus permit its replication. Puromycin-resistant clones can be seeded in 24-well plates as a duplicate. Subsequently, the cells can be infected with the ΔE1 / E4 virus and then cultured with and without addition of doxycycline to the culture medium. In the presence of doxycycline, E1 and E4 transcriptional activation may render cells permissive for viral replication, thus demonstrating the cytopathic effect associated therewith. The clones in which the AdΔE1 / E4 vector can replicate only in the presence of doxycycline can be expanded and further characterized to detect persistent production of the defective virus.
Beispiel 11: Konstruktion einer EBNA-1-exprimierenden A549-ZelllinieExample 11: Construction an EBNA-1-expressing A549 cell line
Eine A549-Zelllinie, welche ein EBNA-1-Gen exprimiert, wurde durch stabile Transfektion des Vektors pEB (Ramage, A. D., et al., 1997, Gene 197:83-89) erzeugt. pEB wurde durch MluI-Verdauung linearisiert und in A549 unter Verwendung des Reagenzes Fugene 6 (Boehringer) transfiziert. 72 h nach der Transfektion wurden A549-Zellen in einem Verhältnis 1:20 in selektivem Medium, enthaltend 600 μg/ml G418, aufgeteilt. 10 resistente Klone wurden expandiert und hinsichtlich episomaler Replikation des Plasmids pCEP-EBNAde1, enthaltend den EBV-Ori-P und eine Hygromycin-Resistenzgen-Expressionskassette, getestet.A A549 cell line expressing an EBNA-1 gene was characterized by stable Transfection of the vector pEB (Ramage, A.D., et al., 1997, Gene 197: 83-89) generated. pEB was linearized by MluI digestion and into A549 transfected using the reagent Fugene 6 (Boehringer). 72 h after transfection, A549 cells were in a 1:20 ratio in selective medium containing 600 μg / ml G418. 10 resistant Clones were expanded and for episomal replication of the plasmid pCEP-EBNAde1, containing the EBV-Ori-P and a hygromycin resistance gene expression cassette, tested.
Beispiel 12: Konstruktion der HelferzelllinieExample 12: Construction the helper cell line
Das Shuttle-Plasmid pSCΔE4 kann durch Transfektionstechniken in die Zelllinie, welche die E1/E4-induzierbare transkriptionale Einheit einschließt, inseriert werden. Die resistenten Zellklone, welche durch Kultivierung der transfizierten Zellen in Gegenwart des Antibiotikums Hygromycin B erhalten wurden, können expandiert und weiter hinsichtlich ihres Vermögens zur induzierbaren Expression der Adenovirus-Gene und zur Aufrechterhaltung der Propagation eines helfer-abhängigen Ad-Vektors charakterisiert werden. Zunächst kann die induzierbare Expression des Adenovirus-Genoms überwacht werden, wobei der vermittelte zytopathische Effekt durch Kultivierung der Zellen in Gegenwart von Tetracyclin ermittelt wird. Die Produktion der Adenovirus-Strukturproteine kann quantitativ mittels Westernblots und Immunpräzipitationstechniken mit spezifischen Antikörpern, wie bereits in der Literatur beschrieben, bestimmt werden. Die Kapazität der Zellklone, welche das Episom pSCΔE4 einschließen, eine Replikation von helfer-abhängigen Vektoren zu erlauben, kann unter Verwendung verschiedener Vektoren, welche die Reportergene, die für das Grüne Fluoreszenzprotein (GFP) oder für die β-Galactosidase oder irgendein anderes Gen mit einer leicht nachweisbaren Aktivität codieren, untersucht werden. Die Zellen können mit einer unterschiedlichen MOI des helfer-abhängigen Virus infiziert werden, dann geerntet, wenn der zytopathische Effekt ersichtlich ist, nach tetracyclin-induzierter Expression des Adenovirus-Genoms. Die Virusausbeute kann unter Verwendung des zellulären Lysats, wie von Parks in PNAS 1996 beschrieben, bestimmt werden. Die Ermittlung des Verhältnisses zwischen der Anzahl der gebildeten transduzierenden viralen Partikel, welche die verpackenden Zelllinien infizieren, und derjenigen, welche in dem verwendeten viralen Impfgut vorliegen, kann eine Abschätzung der Virusproduktionseffizienz in den verschiedenen erhaltenen Klonen ermöglichen.The Shuttle plasmid pSCΔE4 can be induced by transfection techniques into the cell line which is the E1 / E4 inducible transcriptional unit, be inserted. The resistant ones Cell clones obtained by culturing the transfected cells in the presence of the antibiotic hygromycin B can be expanded and further in terms of their capacity for inducible expression the adenovirus genes and to maintain the propagation of a helper dependent Ad vectors are characterized. First, the inducible expression of the adenovirus genome be, with the mediated cytopathic effect by culturing the cells is detected in the presence of tetracycline. The production The adenovirus structural proteins can be quantified by Western blotting and immunoprecipitation techniques with specific antibodies, as already described in the literature. The capacity of cell clones, which the episome pSCΔE4 lock in, a replication of helper-dependent Vectors can be constructed using different vectors, which the reporter genes responsible for the green Fluorescent protein (GFP) or for the β-galactosidase or encode any other gene with a readily detectable activity, to be examined. The cells can be infected with a different MOI of the helper-dependent virus, then harvested, if the cytopathic effect is evident, after tetracycline-induced expression of the adenovirus genome. The virus yield can using the cellular Lysates as described by Parks in PNAS 1996. The determination of the ratio between the number of transducing viral particles formed, which infect the packaging cell lines and those which are in the viral inoculum used, an estimate of the Virus production efficiency in the various clones obtained enable.
Beispiel 13: Konstruktion von Zelllinien, die Ad/EBV-Shuttle-Vektor enthaltenExample 13: Construction of cell lines containing Ad / EBV shuttle vector
A. A549-EBNA-Klone, die Ad/EBV-Shuttle-Vektor enthaltenA. A549 EBNA clones Ad / EBV shuttle vector included
Ad/EBV-Shuttle-Plasmid wurde in die A549-EBNA-Zelllinie unter Einsatz des Transfektionsreagenzes Fugene-6 (Boehringer) oder des Calciumphosphat-Verfahrens eingeführt. Ad/EBV-Plasmid wurde alleine oder in Kombination mit pIREStTS/rtTApuro oder pUHS6-1 transfiziert. Die Cotransfektion des Ad/EBV-Shuttle-Vektors mit Plasmiden, welche den Tet-Silencer exprimieren, sollte das Auftreten von Ad-Gen-Leck-Expression durch Repression des E2-Promotors weiter reduzieren. A549-EBNA-Zellen wurden in selektives Medium, das 400 μg/ml an G-418 und 200 μg/ml an Hygromycin-B enthielt, 48-72 h nach der Transfektion eingebracht. Isolierte hygromycin-B-resistente Klone wurden in 24-Mulden-Platten überführt und expandiert.Ad / EBV shuttle plasmid was transferred to the A549 EBNA cell line using the transfection reagent Fugene-6 (Boehringer) or the calcium phosphate method. Ad / EBV plasmid was used alone or in combination with pIREStTS / rtTApuro or pUHS6-1 transfected. Cotransfection of the Ad / EBV shuttle vector with Plasmids containing the tet-silencer should express the occurrence of ad gene leak expression by Further reduce repression of the E2 promoter. A549 EBNA cells were transferred to selective medium containing 400 μg / ml G-418 and 200 μg / ml hygromycin-B contained 48-72 h after transfection. Isolated hygromycin B resistant Clones were transferred to 24-well plates and expanded.
Zum Testen von A549-Ad/EBV-Klonen hinsichtlich des Vermögens zur Komplementierung und Propagierung eines helfer-abhängigen Ad-Vektors wurde ein neues Plasmid C4E1E4gfp konstruiert. Dieses helfer-abhängige Plasmid enthält E1- und E4-Adenovirusbereiche sowie eine Expressionskassette für Grünes Fluoreszenzprotein. Der HDC4E1E4gfp-Vektor wurde freigesetzt und amplifiziert unter Verwendung von 293CRE4-Zellen wie beschrieben (Parks, R. J., et al. 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. 93:13565-13570). Eine gereinigte Präparation von HDC4E1E4gfp wurde zur Infektion von A549-Ad/EBV-Klonen bei einer niedriger Multiplizität der Infektion verwendet.To test A549 Ad / EBV clones for the ability to complement and propagate a helper-dependent Ad vector, a novel plasmid C4E1E4gfp was constructed. This helper-dependent plasmid contains E1 and E4 adenovirus regions as well as a green fluorescent protein expression cassette. The HDC4E1E4gfp vector was released and amplified using 293CRE4 cells as described (Parks, RJ, et al., 1996, Proc. Natl. Acad. Sci. 93: 13565-13570). A purified preparation of HDC4E1E4gfp was used to infect A549 Ad / EBV clones at a low multiplicity of infection.
Klone, die nach Ad/EBV-Cotransfektion mit pIREStTS/rtTApuro oder pUHS6-1 isoliert worden waren, wurden in doppelter Ausführung mit oder ohne 1 μg/ml Doxycyclin getestet. Die Expression von E1- und E4-Genen erlaubte die Aktivierung des Ad-Transkriptionsprogrammes nur in Klonen, die eine intakte Kopie des Ad/EBV-Shuttle-Plasmids enthielten. Das Ergebnis war die Induktion eines zytopathischen Effekts (cpe) und HD-Vektor-Propagation.Clones after Ad / EBV cotransfection with pIREStTS / rtTApuro or pUHS6-1 were duplicate with or without 1 μg / ml doxycycline tested. Expression of E1 and E4 genes allowed activation of the ad transcription program only in clones that are intact Contained copy of the Ad / EBV shuttle plasmid. The result was the Induction of a cytopathic effect (cpe) and HD vector propagation.
B. Konstruktion verschiedener Zelllinien, die den Ad/EBV-Shuttle-Vektor II enthieltenB. Construction of various Cell lines containing the Ad / EBV shuttle vector II
pSA-2 inkorporiert eine EBNA-1-Expressionskassette und ist somit in der Lage, in irgendeiner Zelllinie, die hinsichtlich episomaler Aufrechterhaltung permissiv ist, vermittelt durch einen latenten EBV-Replikationsursprung zu replizieren. Er wurde dann zur Identifizierung neuer, von A549EBNA verschiedenen Zelllinien mit verbesserten biologischen Eigenschaften eingesetzt. Eine Anzahl unterschiedlicher Zelllinien wurde transfiziert und hygromycin-B-resistente Klone wurden isoliert und untersucht wie bereits für die Klone, die aus A549EBNA-Zellen erhalten worden waren, beschrieben.pSA-2 incorporates an EBNA-1 expression cassette and is thus in the Able, in any cell line, in terms of episomal maintenance is permissive, mediated by a latent EBV origin of replication to replicate. He was then identified for newer, by A549EBNA different cell lines with improved biological properties used. A number of different cell lines were transfected and hygromycin B resistant Clones were isolated and examined as for the clones, obtained from A549EBNA cells been described.
Beispiel 14: Isolierung eines Zellklons, der E1- und E4-Proteine in einer durch tet regulierten Weise exprimiertExample 14: Isolation of a cell clone that regulates E1 and E4 proteins in a tet-regulated manner Way expressed
A549EBNA-Zellen, welche sowohl den tetracyclin-kontrollierten reversen Transaktivator (Gossen, D., et al. (1995), Science 268:1766-1769) als auch den transkriptionalen tTS-Silencer (Deuschle, U., et al. (1995), Mol. Cell. Biol. 15:1907-1914; Freundlieb, S., et al., J. Gene Med. 1999; 1:1-13) exprimieren, wurden durch Transfektion von pIREStTS/rtTApuro erhalten. Anschließend wurden die durch Selektion mit dem Antibiotikum Puromycin erhaltenen Zellklone getestet, um die Expression der beiden transregulierenden Proteine durch Verwendung irgendeines Vektors, in dem ein Reportergen unter der Kontrolle des Tet-Operators eingebaut ist, zu ermitteln.A549EBNA cells which is both the tetracycline-controlled reverse transactivator (Gossen, D., et al. (1995), Science 268: 1766-1769) as well as the transcriptional tTS silencer (Deuschle, U., et al., (1995), Mol. Cell. Biol. 15: 1907-1914; Freundlieb, S., et al., J. Gene Med. 1999; 1: 1-13) were expressed by Transfection of pIREStTS / rtTApuro received. Subsequently were the cell clones obtained by selection with the antibiotic puromycin tested the expression of the two transregulating proteins by using any vector in which a reporter gene is under the control of the Tet operator is installed to determine.
Ein Adenovirus-Vektor der ersten Generation wurde konstruiert durch Insertion einer Expressionskassette, die das Luciferasegen unter die Kontrolle des Tet-Operators gestellt enthält, welche durch PvuII-Verdauung von pABS-Tetluc erhalten worden war, in die XbaI-Stelle des Plasmids pLBG40, wodurch das Plasmid pLBGTetluc erhalten wurde.One Adenovirus vector of the first generation was constructed by Insertion of an expression cassette containing the luciferase gene contains the control provided by the Tet operator, which by PvuII digestion from pABS-Tetluc into the XbaI site of plasmid pLBG40, thereby the plasmid pLBGTetluc was obtained.
Dieses Plasmid umfasst das gesamte Adenovirus-Genom, bei dem die E1- und E3-Bereiche deletiert sind, und ist deshalb infektiös bei Transfektion in 293-Zellen. Isolierte Plaques waren 10 Tage nach 293-Transfektion sichtbar. Drei Plaques wurden gepickt und durch HindIII-Verdauung nach dem von Graham, F. L., und Mitarbeitern, 1995, Methods in Molecular Genetics 7:13-20, beschriebenen Verfahren analysiert. Alle drei Plaques zeigten das korrekte Restriktionsmuster. Ein virales Isolat wurde expandiert, titriert und hinsichtlich Luciferaseenzym-Expression einem Assay unterworfen.This Plasmid comprises the entire adenovirus genome, in which the E1 and E3 areas are deleted, and is therefore infectious in transfection in 293 cells. Isolated plaques were 10 days after 293 transfection visible, noticeable. Three plaques were picked and by HindIII digestion after that by Graham, F.L., and coworkers, 1995, Methods in Molecular Genetics 7: 13-20, described procedures. All three Plaques showed the correct restriction pattern. A viral isolate was expanded, titrated and for luciferase enzyme expression subjected to an assay.
Etwa 104 Zellen eines jeden Klons, erhalten durch Resistenz gegenüber Puromycin, wurden als Duplikat in 24-Mulden-Platten ausgesät und mit dem AdLBGluc-Virus in einer MOI von 20 infiziert. Eine Platte wurde in Gegenwart von Doxycyclin vor der Infektion kultiviert. Die Zellen wurden 48 h nach der Infektion geerntet und lysiert. Die Expressionsniveaus des Luciferasegens wurden unter Verwendung des natürlichen Substrats Luciferin ermittelt. Die Klone, in denen das beste Verhältnis zwischen der Aktivierung der Luciferase-Expression in Gegenwart von Doxycyclin und dem Grundniveau in Abwesenheit von Ligand beobachtet wird, wurden ausgewählt und expandiert. Ein Klon, der gemäß dieser Prozedur hergestellt worden war, wurde expandiert, um weiter charakteristische Eigenschaften von Wachstum, Stabilität und Expressionsniveaus der Regulationsproteine zu definieren. Deshalb wurden geeignete Banken eingefrorener Zellen präpariert, um die Aufrechterhaltung einer Zelllinie, welche die Regulationsproteine der Transkription rtTA und Tet-KRAB exprimiert, sicherzustellen.About 10 4 cells of each clone, obtained by resistance to puromycin, were seeded as a duplicate in 24-well plates and infected with AdLBGluc virus at an MOI of 20. A plate was cultured in the presence of doxycycline prior to infection. The cells were harvested 48 hours after infection and lysed. The expression levels of the luciferase gene were determined using the natural substrate luciferin. The clones, in which the best ratio between the activation of luciferase expression in the presence of doxycycline and the basal level in the absence of ligand is observed, were selected and expanded. A clone prepared according to this procedure was expanded to further define characteristic properties of growth, stability and expression levels of regulatory proteins. Therefore, suitable banks of frozen cells were prepared to ensure the maintenance of a cell line expressing the regulatory proteins of the transcription rtTA and Tet-KRAB.
Beispiel 15: Konstruktion der E1/E4-induzierbaren ZelllinieExample 15: Construction the E1 / E4-inducible cell line
Das Plasmid pBI.E1/E4 (siehe Beispiel 1) wurde in die A549EBNA-Zellen zusammen mit pIREStTS/rtTApuro transfiziert. Die Zellen wurden durch Wachstum auf einem Medium, welches das Antibiotikum enthielt, selektioniert und hinsichtlich ihrer Expression früher Adenovirus-Proteine unter der Kontrolle von Tetracyclin einem Assay unterworfen. Für diesen Zweck wurde ein Adenovirus-Vektor der zweiten Generation, bei dem sowohl die E1- als auch die E4-Bereiche deletiert waren (Krougliak, V., et al. 1995, Hum. Gene Ther. 6:1575-1586) von F. L. Graham erhalten und zum Screenen hinsichtlich positiver Klone verwendet. Die Zellklone, welche durch Insertion der transkriptionalen Einheit E1/E4 in die Zelle erhalten worden waren, wurden auf der Basis ihrer Kapazität zur Komplementierung des helfer-abhängigen defekten Adenovirus-Vektors und somit zur Ermöglichung seiner Replikation selektioniert. Puromycin-resistente Klone wurden in 24-Mulden-Platten als Duplikat ausgesät. Dann wurden die Zellen mit dem ΔE1/E4-Virus infiziert und dann mit oder ohne Zugabe von Doxycyclin zu dem Kulturmedium kultiviert. In Gegenwart von Doxycyclin kann die E1- und E4-Transkriptionsaktivierung Zellen hinsichtlich viraler Replikation permissiv machen und somit den vermittelten zytopathischen Effekt belegen. Virale Titer wurden mittels PCR unter Verwendung des TaqMam-Verfahrens ermittelt. Die Klone, in denen der AdΔE1/E4-Vektor ausschließlich in Gegenwart von Doxycyclin replizieren kann, wurden expandiert und weiter charakterisiert, wobei eine dauerhafte Produktion des defekten Virus ermittelt wurde. Dieselbe Prozedur wurde befolgt, um A549EBNA-Klone zu erhalten, welche E2-Gene unter Tetracyclin-Kontrolle exprimierten. Die erhaltenen Klone wurden gescreent unter Verwendung von Ad-Vektoren, bei denen die entsprechenden E2-Gene deletiert waren.The plasmid pBI.E1 / E4 (see Example 1) was transfected into the A549EBNA cells together with pIREStTS / rtTApuro. The cells were selected by growth on a medium containing the antibiotic and assayed for expression of adenovirus early proteins under the control of tetracycline. For this purpose, a second generation adenovirus vector, with both the E1 and E4 regions deleted (Krougliak, V., et al., 1995, Hum. Gene Ther., 6: 1575-1586), was deleted from FL Graham and used to screen for positive clones. The cell clones obtained by insertion of the E1 / E4 transcriptional unit into the cell were selected on the basis of their capacity to complement the helper-dependent defective adenovirus vector and thus enable its replication. Puromycin-resistant clones were seeded in 24-well plates as a duplicate. Then, the cells were infected with the ΔE1 / E4 virus and then cultured with or without addition of doxycycline to the culture medium. In the presence of doxycycline, the E1 and E4 transcriptional activation make cells permissive with respect to viral replication, thus demonstrating the mediated cytopathic effect. Viral titers were determined by PCR using the TaqMam method. The clones in which the AdΔE1 / E4 vector can replicate only in the presence of doxycycline were expanded and further characterized, whereby a permanent production of the defective virus was determined. The same procedure was followed to obtain A549EBNA clones expressing E2 genes under tetracycline control. The resulting clones were screened using Ad vectors in which the corresponding E2 genes were deleted.
Beispiel 16: Konstruktion der Helferzelllinie und HD-PropagationExample 16: Construction the helper cell line and HD propagation
Das Shuttle-Plasmid pSA-1 wurde durch Standard-Transfektionstechniken in die Zelllinie inseriert, welche die E1/E4-induzierbare transkriptionale Einheit und Tet-Proteine einschloss. Mehrere resistente Klone wurden erhalten durch Aufteilen der Zellen 48 h nach der Transfektion und Kultivierung in einem selektiven Medium, das auch Hygromycin B in einer Konzentration von 200 μg/ml enthielt. Resistente Klone wurden expandiert und hinsichtlich ihres Vermögens zur induzierbaren Expression der Adenovirus-Gene und zur Aufrechterhaltung der Propagation eines helfer-abhängigen Ad-Vektors weiter charakterisiert. Zunächst wurde die induzierbare Expression des Adenovirus-Genoms überprüft, wobei der vermittelte zytopathische Effekt durch Kultivierung der Zellen in Anwesenheit von Tetracyclin ermittelt wurde. Die Induktion der Adenovirus-Strukturproteinproduktion wurde quantitativ bestimmt durch Westernblots und Immunpräzipitationstechniken mit spezifischen Antikörpern. Die Kapazität der Zellklone, welche das Episom pSA-1 einschlossen, zur Ermöglichung der Replikation von helfer-abhängigen Vektoren wurde unter Verwendung verschiedener Vektoren untersucht, welche die Reportergene, codierend für das Grüne Fluoreszenzprotein (GFP) oder für die β-Galactosidase oder irgendein anderes Gen mit einer leicht nachweisbaren Aktivität, enthielten. Die Zellen wurden mit einer unterschiedlichen MOI des helferabhängigen Virus infiziert, dann geerntet, wenn der zytopathische Effekt ersichtlich war, nach tetracyclin-induzierter Expression des Adenovirus-Genoms. Die Virusausbeute wurde durch Verwendung des Zelllysats zur Infektion einer 293-Zellmonoschicht bestimmt. Die Ermittlung des Verhältnisses zwischen der Anzahl gebildeter transduzierender viraler Partikel, welche die verpackenden Zelllinien infizierten, und derjenigen, die im viralen Impfgut vorlagen, wurde zur Beurteilung der Virusproduktionseffizienz in den verschiedenen erhaltenen Klonen verwendet.The Shuttle plasmid pSA-1 was prepared by standard transfection techniques inserted into the cell line containing the E1 / E4-inducible transcriptional unit and Tet proteins included. Several resistant clones were obtained by dividing the cells 48 hours after transfection and cultivation in a selective medium that also contains hygromycin B in a concentration of 200 μg / ml contained. Resistant clones have been expanded and in terms of their assets inducible expression of the adenovirus genes and for maintenance the propagation of a helper-dependent Characterized further Ad vector. Initially, the inducible Expression of the adenovirus genome checked using the mediated cytopathic Effect of culturing the cells in the presence of tetracycline was determined. The induction of adenovirus structural protein production was quantitated by western blots and immunoprecipitation techniques with specific antibodies. The capacity of the cell clones that included the episome pSA-1 the replication of helper-dependent Vectors were examined using different vectors, which the reporter genes coding for the green fluorescent protein (GFP) or for the β-galactosidase or any other gene with readily detectable activity. The cells were challenged with a different MOI of helper-dependent virus infected, then harvested when the cytopathic effect becomes apparent was after tetracycline-induced expression of the adenovirus genome. The Virus yield became infection by using the cell lysate of a 293 cell monolayer. The determination of the ratio between the number of formed transducing viral particles, which infected the packaging cell lines, and those present in the viral inoculum was used to assess virus production efficiency used in the various clones obtained.
Dieselbe Prozedur wurde befolgt, um verpackende Zelllinien mit den modifizierten Versionen des Ad/EBV-Shuttle-Plasmids unter Kombination verschiedener Deletionen früher Gene, einschließlich E2-Gene, zu erhalten.the same Procedure was followed to modify the packaging cell lines with the modified ones Versions of the Ad / EBV shuttle plasmid combining different Deletions earlier Genes, including E2 genes, to obtain.
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