Cours - 02 - Nature Chimiques Du Matériel Génétique

CHAPITRE I:
Matériel génétique
Cours 01:
Nature chimique du matériel
génétique
Composition des acides nucléiques
• Les acides nucléiques sont composés de

molécules simples :
– Acide phosphorique (PO4H3)
– Pentoses (oses à 5 carbones)
– Bases azotées (purines ou pyrimidines).

Les Phosphates
Phosphate inorganique Pyrophosphate

Pi PPi
Liaison ester Liaison anhydride d’acides

Le Ribose et le désoxyribose
b-D-Ribose 2-désoxy-b-D-Ribose
Les Bases azotées: purines/pyrimidines
• Purine: 2 noyaux hétérocycliques:

 un de 6 atomes
 un de 5 atomes
 avec 2 carbones en commun
au milieu.
• Pyrimidine:
un noyau aromatique à 6
atomes: 4 carbones et 2 azotes.
Les Bases puriques
• L’adénine:
 carbone 6 substitué par NH2.
 la seule des bases nucléiques
ne contenant pas d’O.
• La guanine:
 carbone 2 substitué par une
fonction NH2
 carbone 6 par une fonction
CO.
Les Bases pyrimidiques
• La cytosine:
carbone 4 substitué par une fonction NH2
 carbone 2 par une fonction CO.
• L’uracile:
 carbones 2 et 4 portent des fonctions CO.
• La thymine:
 carbones 2 et 4 portent des fonctions CO.
 carbone 5 substitué par un CH3.
Les NucléoSides et les NucléoTides
BASE + SUCRE = NUCLEOSIDE
BASE + SUCRE + PHOSPHATE = NUCLEOTIDE

Nomenclature
Exemple d’un nucléoSide: l’adénosine
Liaison N-osidique
nucléoside =
[pentose (ribose ou désoxy-ribose)] liaison N-osidique [base azotée]
• Les autres ribonucléosides sont : la guanosine, la cytidine et l’uridine.

Exemple d’un désoxyribonucléoSide: la
désoxyguanosine
• Les autres désoxyribonucléosides sont : la désoxyadénosine, la

désoxycytidine et la désoxythymidine, souvent appelée thymidine tout
court.
Exemple d’un nucléoTide: l’uridine
monophosphate ou uridylate
Liaison ester
• nucléoTide = [nucléoSide] liaison ester [acide phosphorique]
• L’uridine mono phosphate (UMP) = acide uridylique = uridylate
• Les autres ribonucléoTides sont : l’AMP, le GMP et le CMP.

Exemple d’un désoxynucléotide: le
désoxythymidine monophosphate
• Les autres désoxyribonucléotides sont : le dAMP, le dGMP et le dCMP.

Exemple d’un nucléoside Tri Phosphate:
l’Adénosine Tri Phosphate
• Les liaisons anhydrides unissant les acides phosphoriques sont des liaisons riches en
énergie.
• Le coenzyme ATP/ADP est un coenzyme transporteur d’énergie universel.
• Les autres nucléosides triphosphates sont en fonction du sucre ou de la base qu’ils

contiennent : le GTP, le CTP, l’UTP, le dATP, le dGTP, le dCTP et le dTTP.
Exemple d’un désoxynucléoside Tri
Phosphate: Désoxycytidine Tri Phosphate
Les Liaisons hydrogène
• Liaison H = liaison faible entre deux
atomes, l’un nucléophile (riche en
électrons) et l’autre électrophile
(n’ayant que les protons de son
noyau).
• L’H est électrophile
• L’O et l’N sont nucléophile
• L’O et l’N exercent une attraction

sur l’H: cette attraction constitue
une liaison hydrogène
L’Hybridation
• En solution, les nucléotides
Liaison
s’associent deux par deux hydrogène
grâce à des liaisons
hydrogènes
• Un nucléotide à adénine se lie

avec un nucléotide à thymine
(ou à uracile dans un ARN) et
un nucléotide à guanine avec
un nucléotide à cytosine.
Hybridation A-T
• On désigne cette liaison sous
le terme d’hybridation.
L’Hybridation (2)
Hybridation G-C
• L’hybridation guanine-cytosine est plus stable (3 liaisons

hydrogène, -63 kJ) que celle entre l’adénine et la thymine
(2 liaisons hydrogène, -21 kJ).
L’Acide Ribonucléique : l’ARN
Structure secondaire de l’ARN
• L’ARN diffère de l’ADN par plusieurs
caractères :
• Il est plus court (70 à 10 000 nucléotides)
• Contient du ribose à la place du

désoxyribose
• L’uracile (U) remplace la thymine (T)
• Les ARN sont simple brin mais certaines

régions sont appariées sur une courte
distance par leurs bases
complémentaires selon un ajustement
au hasard (épingles à cheveux)
Les types d’ARN
L’Acide Désoxyribonucléique: l’ADN
• Composé de 2 chaînes dont les
nucléotides sont hybridés deux à deux
sur toute la longueur.
• Les 2 chaînes sont complémentaires et

antiparallèles.
• Les bases azotées liées par les liaisons

hydrogènes sont tournées vers
l’intérieur, tandis que les riboses et les
acides phosphoriques, hydrophiles sont
tournés vers l’extérieur et constituent
le squelette de l’ADN.
• La chaleur peut dissocier les deux

chaînes : c’est la fusion de l’ADN. Cette
fusion est réversible : les deux chaînes
peuvent s’hybrider à nouveau.
L’ADN: structure bidimensionnelle
• Dans la notation
conventionnelle de la biologie
moléculaire, les deux chaînes
sont représentées comme suit:
5’ ACCTGAACGCGTTAGGCTA 3’
3’ TGGACTTGCGCAATCCGAT 5’
L’ADN: structure en double hélice

Surenroulement de la double
hélice d’ADN Boucle de réplication
• Lors de la transcription ou de la réplication, l’hélice ou de transcription
de l’ADN est ouverte par une topoisomérase
(hélicase) qui permet aux enzymes l’accès au brin
modèle.
• Le fait de séparer les bases complémentaires et les

deux brins de la double hélice sur plusieurs dizaines
de nucléotides se traduit par un resserrement des
tours d’hélice de part et d’autre de la boucle ainsi
ouverte.
• Ce surenroulement nécessite l’intervention d’une

topoisomérase qui va desserrer les tours d’hélice en
coupant un brin ou les deux brins de l’ADN, puis en
les faisant tourner l’un autour de l’autre jusqu’à
revenir à 10 nucléotides par tour d’hélice.
• Des protéines de stabilisation de l’ADN simple brin

viennent se fixer sur la partie déroulée pour protéger
Surenroulement
la molécule.
Double hélice d’ADN 2 nm
11nm
Enroulement de
l’ADN dans le 30 nm
noyau
300 nm
700 nm
1400 nm
Les nucléosomes
• L’ADN (polyanions) est enroulé sur des
histones (protéines basiques)
• Nucléosome = ADN (145 pb) + 8 histones
• On retrouve un nucléosome tout les 200

nucléotides = ce qui donne à la molécule
d’ADN un aspect de collier de perles.
• L’ADN lié aux histones est protégé

contres les enzymes, mais une
endonucléase peut digérer l’ADN entre
les « perles » et détacher les
nucléosomes
La fibre de chromatine
• L’ADN qui entoure chaque nucléosome et le relie en « collier de perles » aux nucléosomes
suivants, forme la trame d’une structure hélicoïdale qui enroule les colliers de perles sur eux
mêmes. On décrit aussi cette structure comme un solénoïde.
• Le diamètre de cette hélice est de 30 nm et forme une grande partie de la chromatine dite «
compactée » où l’ADN n’est pas accessible.
• Toutefois, des séquences reconnues spécifiquement par des protéines de liaison à l’ADN
interrompent de place en place cette structure compacte.
La Structure d’un chromosome
Condensation et hydrolyse des
nucléotides
Complémentarité des bases
• L’hybridation : liaisons hydrogène (C –G, A -T ).
• Grâce à des enzymes spécifiques, une séquence d’acide nucléique dite «originale» est capable
de diriger la synthèse d’une séquence d’acide nucléique complémentaire, et ces deux séquences
sont antiparallèles.
• Dans un second temps, cette séquence complémentaire isolée, sera elle aussi capable de diriger
la synthèse de la séquence originale dont elle est le complément.

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• Les acides nucléiques sont composés de

– Acide phosphorique (PO4H3)

– Pentoses (oses à 5 carbones)

– Bases azotées (purines ou pyrimidines).

Phosphate inorganique Pyrophosphate

Liaison ester Liaison anhydride d’acides

• Purine: 2 noyaux hétérocycliques:

BASE + SUCRE = NUCLEOSIDE

BASE + SUCRE + PHOSPHATE = NUCLEOTIDE

• Les autres ribonucléosides sont : la guanosine, la cytidine et l’uridine.

• Les autres désoxyribonucléosides sont : la désoxyadénosine, la

• nucléoTide = [nucléoSide] liaison ester [acide phosphorique]

• L’uridine mono phosphate (UMP) = acide uridylique = uridylate

• Les autres ribonucléoTides sont : l’AMP, le GMP et le CMP.

• Les autres désoxyribonucléotides sont : le dAMP, le dGMP et le dCMP.

• Le coenzyme ATP/ADP est un coenzyme transporteur d’énergie universel.

• Les autres nucléosides triphosphates sont en fonction du sucre ou de la base qu’ils

• L’H est électrophile

• L’O et l’N sont nucléophile

• L’O et l’N exercent une attraction

• Un nucléotide à adénine se lie

• L’hybridation guanine-cytosine est plus stable (3 liaisons

• Il est plus court (70 à 10 000 nucléotides)

• Contient du ribose à la place du

• L’uracile (U) remplace la thymine (T)

• Les ARN sont simple brin mais certaines

• Les 2 chaînes sont complémentaires et

• Les bases azotées liées par les liaisons

• La chaleur peut dissocier les deux

• Le fait de séparer les bases complémentaires et les

• Ce surenroulement nécessite l’intervention d’une

• Des protéines de stabilisation de l’ADN simple brin

• Nucléosome = ADN (145 pb) + 8 histones

• On retrouve un nucléosome tout les 200

• L’ADN lié aux histones est protégé

• L’hybridation : liaisons hydrogène (C –G, A -T ).

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