Andrés Ricardo Beltrán Méndez
Resumen para el tema de Síntesis y modificaciones de las proteínas.
RESUMEN DEL ARTÍCULO. DESREGULACIÓN DE LA TRADUCCION EN LAS
ENFERMEDADES HUMANAS.
Articulo de revisión autores Soroush Tahmasebi, Arkady Khoutorsky, Nature
REviews Molecular cell Biology
Los avances en la secuenciación han logrado que se estudie las enfermedades a
una escala genómica. La lista de enfermedades que causan mutaciones se
expande rápidamente y las mutaciones que afectan el ARNm se encuentran
entre estas. La traducción de proteínas es uno de los procesos más complejos en
la célula. Se da gracias a la acción orquestada de mRNA , ribosomas tRNA. Esto
con el fin de formar la cadena polipeptidica. Esto se ve afectado en el cáncer pero
también en otras enfermedades. Hay ribosomopatias, disfunción del RNAt.
      En 1990 se realizó el primer reporte que asocio error en el tARN con una
       enfermedad (epilepsia mioclonica de fibras rojas)
      Se ha asociado errores en la traducción con numerosas enfermedades
       distintas al cáncer :
           o Inmunodeficiencias
           o Desordenes metabólicos
           o Desórdenes neurológicos
      La traducción es un proceso que tiene varios subprocesos como la
       iniciación, la elongación la terminación y el reciclaje ribosómico.
      La iniciación empieza con la lectura del UTR 5 prima cuando se identifica el
       codón de inicio.
      Este es un paso limitante en el proceso por la velocidad con la que se
       realiza.
      La rapamicina, las cinasas activadoras mitogenas. Y la respuesta de estrés
       integrada. En ocasiones son limitantes o facilitadores del proceso
      Alteraciones en los procesos de traducción son deletéreos para la fisiología
       y el desarrollo
      Las mitocondrias tienen un sistema de traducción independiente que se
       parece mas al de células procariotas y que puede afectar en ultimas
       también y producir enfermedades al dañar la maquinaria de generación de
       energía de la célula.
      Categorizar en tres grupos los desordenes de traducción
           o Los que involucran al tRNA ya sea en su síntesis o su función
           o Ribosomopatias
           o Desregulación de ISR respuesta integrada al estres
           o Desregulación de mTOR mecanistic target de rimpamicina
   Las nuevas técnicas de secuenciación del genoma han hecho más fácil
    encontrar mutaciones causantes de estas alteraciones. Así como
    considerar posibilidades terapéuticas.
   Desregulación de la función del tRNA
       o Los componentes de la maquinaria de traducción tRNA mtRAN
          enzimas modificantes del tRNA proteínas ribosomales etc.
               Frecuentemente mutan en enfermedades mitocondriales.
               Son de los desórdenes congénitos más comunes.
               Pueden resultar desordenes genéticos de mitocondrias o del
                 genoma general
               Tienen fenotipos diferentes y edades de inicio de la
                 enfermedad distintas.
               Se ha visto por ejemplo en enfermedades mitocondriales
                 tRNA
                      El genoma mitocondrial se transmite únicamente por la
                         madre , tiene 37 genes , 22 mtRNA y dos rRNA. La
                         mayoría de las proteínas mitocondriales están
                         codificadas en el núcleo y se traducen en el citoplasma
                         por mRNA y se transportan posteriormente a la
                         mitocondria.
                      Se exponen más a mutaciones deletéreas
                      Tienden a mutar mucho también por ser de transmisión
                         uniparental.
                      Sin embargo no suele notarse porque hay múltiples
                         mitocondrias deberían estar afectadas a mayoría hay
                         un umbral.
                      Se cree que hay efectos específicos de algunos genes
                         a pesar que se pensaría que el musculo y el sistema
                         nervioso a ser mas provistos de mitocondrias se
                         afectarían mas, la realidad es que no es asi y esto
                         parece explicado por lo anterior.
                      Los efectos pueden ser multiorganicos o específicos de
                         alguno
                            o MERRF
                            o MELAS
               El tRNA del citoplasma
                      SE han visto enfermedades asociadas con este
                         proceso sobre todo en lo referido al splicin por ejemplo
                         en exón 20 esto se ha visto por ejemplo en judíos
                         askenazi
                      Esto ha repercutido también en enfermedades sobre
                         todo a nivel del sistema nervioso.
       Aminoacil tRNA sintetasas
       Aminoacil tRNA sintetasa mitocondrial: Por ejemplo en
        cardiomiopatías o encefalopatías. Son autosómicas recesivas
        y son fatales en el primer año de vida
      tRNA aminoacil Sintaca del Citoplasma
             Por ejemplo afeccion del sistema nervioso
                    o Charcot-Marie-Tooth
                    o Haploinsuficiencia
                    o Neuropatías
      Factores de elongación de la traducción
             Por ejemplo el Facto TU TS y el G y las contrapartes
                del citoplasma
o Ribosomopatias
      Los defectos en la biogenes de el ribosoma y su función
        causan enfermedades llamadas ribosomooatias.
      Los ribosomas de los mamíferos consisten de cuatro rRNA y
        de proteínas ribosomales.
      Por lo general estas enfermedades presentan fenotipos
        específicos para tipos celulares y afectan la medula, el
        esqueleto y el cráneo.
      EJ anemia de Diamond Blackfan reticulocitopenia , anemia
        macrocitico y disminución en precursores hematopoyéticos
        eritroides. Afecta a subunidad 40s. Afeccion a GATA1
      TAmbien se encuentra el 5q-ddelecion del brazo largo del
        cromosoma 5 por haploinsuficiencia. Puede haber
        trombocitosis y deficiencia de proteína EGR!
      Ambos se puede tratar con L-Leucina que promueve la
        traducción del mRNA y la biogénesis de los ribosomas.
      Hay otros como Schwachman- DIamond Syndrome disfunción
        pancreática exocrina. Falla en hematopoyesis y neutropenia y
        defecto óseos. SE muta el gen de maduración ribosómica.
      Hipoplasia de cartílago y cabello es otro ejemplo de
        ribosomopatias.
      También se ha visto que guarda relación con p53 aunque
        también se ha visto que hay vías independientes de p53
o Respuesta integrada al Estrés ISR
      Son cambios que se dan en la expresión génica para
        adaptarse al estrés.
      SE activan quinasas
             HRI
             eIF2AK2
             PKR
                        EIF2AK2
                        Entre otras.
                Ejemplos en ocasiones diabetes y algunos fenotipos del
                   sistema nervioso que se sobrepone con WRS
          o La vía mTOR en las enfermedades
                PI3K-AKT-mTORC1
                Esta via regula muchos procesos tanto catabólicos como
                   anabólicos.
                Síntesis de proteínas, lipogenenesis, producción de ácidos
                   nucleicos pero también autofagia.
                Rapamicina isla de pascua. Diana terapéutica que inhibe
                   traducción
          o Otros factores en enfermedades neurológicas
          o PI3K-AKT-mTORC1 via
En conclusión el proceso de síntesis de proteínas puede generar enfermedades
incluidas el cáncer pero no reducidas únicamente a este, dentro de estre proceso
hay varios factores que pueden verse afectados a la hora de presentar el fenotipo
de la enfemedad.
Entre los mecanismos involucrados tenemos los que tienen que ver con mRNA
con ribosomatiastambian con mTOR y por ISR
RESUMEN DE TEMA
      Traducción, proceso final del dogma de la biología molecular.
      Lo estudia la transcriptoma paso de RNA a proteínas.
      La traducción es distinta entre Eucariotas y Procariotas
      Procariotas hacen todo rápido y suele ser simultáneamente y en el mismo
       lugar
      En Eucariotas primero se replica el DNA, no tienen que ser inmediatos los
       procesos
          o EL núcleo se encarga de crea algunos RNA
          o Algunas proteínas se sintetizan en el retículo endoplasmatico para
              tecnificar algunos procesos.
          o El citoplasma es un ambiente rico en Agua, el interior del retículo
              endoplasmatico es hidrofóbico.
          o Las mitocondrias tienen su propio aparato de producción.
      Chaperonas, permiten la migración dependiendo a donde deba dirigirse
          o De distribución
          o DE reconocimiento de proteínas mas plegadas
                  Ayuda a replegar
          o Hay 5 familias de acuerdo a su peso molecular.
          o También existen cochaperona
   Del retículo endoplásmico rugoso al liso. En el liso se realiza la
    glucolizacion de ahí pasa al Golgi. El Golgi trafico vesicular.
   Una enfermedad solo se explica por un gen cuando es un gen maestro sin
    embargo la mayoría de enfermedades que son por genes por lo general
    afecta a varios.
   El mRNA es el que lleva el código para ser traducido
   tRNA lleva el aminoácido correcto al ribosoma para que se pueda después
    sintetizar
   Ribosomas. Conformados por RNA ribosomales y proteínas
        o Mixto
   mRNA procariotas son policistronico: Puede codificar una misma región
    mas de una proteína.
   Regiones UTR protegen el código y adicionalmente tienen secuencia en la
    5 prima para ser reconocido. Y el tres prima tiene la de migración y hasta
    donde va.
   Los mRNA procariotas no tienen intrones.
   Intrones son elementos regulatorios
   Eucariotas monocistronicos, uno solo codifica una proteína
        o Tiene 7 metilguanosina y cola poliAAA
        o Tienen tanto intrones como exones
        o Tiene múltiples modificaciones, bucles, nodos, elementos
            regulatorios, Secuencias de modificación.
        o Muchos elementos regulatorios
        o UTR
   Varios codones pueden codificar el mismo aminoácido
   El Codón AUG solo codifica para metionina
        o Es el de inicio de la traducción del ribosoma
        o El inicial siempre va a ser la metionina
   Hay tres puntos de parada
   El triptófano tiene un solo codón
   Mutaciones sin sentido: codifican para parada
   Tenemos caperuza de 7 metilguanosina
   Los antibióticos inhiben regiones específicas de factores en las
    subunidades ribosomales
   EPA
   El sentido de la traducción siempre es 5-3
   El factor de elongación tipo 1 reconoce factores de transferencia
   El enlace peptídico se comporta casi como un enlace covalente. ES
    responsable de la estructura primaria de las proteínas
   Polirribosomas
   Extremo amino se uno con el extremo carboxilo
   Las mitocondrias tienen sus propios ribosomas, propios rRNA
   El tamaño mitocondrial es menor, el tamaño ribosomal de las mitocondrias
    se parece más al de las bacterias que al eucariota.
   Rapamicina: Inhibe síntesis de proteínas porque bloque mTOR. Bloquea el
    factor de inicio tipo 4
   Cloranfenicol se une a la subunidad 50S
   Eritromicina se une a la 50S, bloquea sitio A bloquea elongación
   Tetraciclinas interfieren con el factor de transferencia al mRNA
   La temperatura no rompe el enlace peptídico
   Estructura secundaria es plegamiento en X e Y
   La estructura cuaternaria es la unión de dos o más primarias, dimericas,
    trimericas etc
   Las proteínas se pueden fosforilar, glucosilar, glicacion. Acilacion