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Programa Curso Bioinformatica

El documento presenta un resumen de los temas a tratar en un curso de introducción a la bioinformática, incluyendo introducción al curso, bases de química y biología, secuencias de ADN, genes, alineamiento de secuencias y proteínas, bases de datos biológicas, estructuras biológicas, y evaluación.

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Cristian Bossolasco
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Bioinformática

Marco Regalia
marcoregalia@hotmail.com
Carpeta fotocopias #243

INTRODUCCIÓN A LA BIOINFORMÁTICA ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS Y PROTEÍNAS


Introducción al curso Alineamiento de múltiples secuencias
Que es la bioinformática y sus aplicaciones ClustalW y JalView
1 Bases de química 4 Proteínas y proteómica
Bases de biología Análisis comparativo de proteínas
Bases de genética Bases de datos de familias de proteínas
NCBI GQuery PROSITE, PRINTS, Pfam, Interpro

SECUENCIAS DE ADN
BASES DE DATOS
Bases de datos de secuencias de ADN
Datos biológicos
Formatos de secuencias
Definición de base de datos
Alineamiento de secuencias
2 Programación dinámica
5 Modelos de bases de datos
Estructura de bases de datos relacionales
Algoritmos de búsqueda de ADN
Bases de datos biológicos
Algoritmo BLAST
Visualización de datos biológicos
BLAST guía practica

ESTRUCTURAS BIOLÓGICAS
GENES Estructura del ADN
El código genético Estructura del ARN
Open Reading Frames (ORFs) Estructura de las proteínas
3 Algoritmos de búsqueda de ORFs 6 Protein Data Bank (PDB)
NCBI ORF Finder Folding de proteínas
Modelos estocásticos Alineamiento de estructuras
GENSCAN Folding@home y Foldit
Opiniones/sugerencias sobre el curso

 Software de alineamiento de 1er parcial 15%


1er corte 35%
secuencias basado en un algoritmo
T 1era actividad 20%
L
de programación dinámica E
A 2do parcial 15%
2do corte 35%
 Seminario temático S 2da actividad 20%
B

T Examen final 30%

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